【目的】研究薄殼山核桃MADS-box轉(zhuǎn)錄因子CiAGL6基因的特性、亞細胞定位及在雌花不同發(fā)育時期的表達水平,為揭示薄殼山核桃成花分子機理提供理論依據(jù)�！痉椒ā扛鶕�(jù)薄殼山核桃轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),采用RT-PCR方法獲得CiAGL6基因,對其進行生物信息學分析和亞細胞定位鑒定。利用實時熒光定量PCR技術(shù)（qRT-PCR）分析CiAGL6基因在雌花發(fā)育過程中的表達模式�！窘Y(jié)果】獲得薄殼山核桃CiAGL6基因的完整開放閱讀框（ORF）780bp,共編碼259個氨基酸,具有典型的MADS-box結(jié)構(gòu)域和K-box區(qū)。在該蛋白的二級結(jié)構(gòu)中,α-螺旋、延伸鏈和無規(guī)則卷曲分別占該蛋白質(zhì)氨基酸殘基總數(shù)的54.44%、17.37%和28.19%。系統(tǒng)進化分析表明,薄殼山核桃CiAGL6與殼斗科栓皮櫟QsAGL6的親緣關系最近。亞細胞定位顯示,CiAGL6蛋白定位在細胞核內(nèi)。qRT-PCR分析結(jié)果表明,CiAGL6基因在雌花中的表達量顯著高于雄花中的。CiAGL6基因在雌花發(fā)育的各個階段均有表達,其中在雌花盛開期的表達量最高�！窘Y(jié)論】CiAGL6基因在薄殼山核桃雌花形成過程中發(fā)揮重要調(diào)控作用。 

【文章來源】：南京林業(yè)大學學報(自然科學版). 2020,44(04)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

薄殼山核桃雌花芽發(fā)育不同時期

利用NCBI Blast Conserved Domains Search分析薄殼山核桃品種‘波尼’CiAGL6蛋白氨基酸序列的保守域，結(jié)果（圖2C）顯示：CiAGL6蛋白序列在第2位到第72位氨基酸間含有MADS-box結(jié)構(gòu)域，在第83位到第171位氨基酸間含有K-box保守域。薄殼山核桃CiAGL6蛋白符合MADS-boxⅡ型結(jié)構(gòu)特征。CiAGL6蛋白二級結(jié)構(gòu)預測表明，α-螺旋、延伸鏈和無規(guī)則卷曲分別占比包含54.44%(141）、17.37%(45）、28.19%(73），其中α-螺旋二級結(jié)構(gòu)最多，這可能與CiAGL6蛋白含有K保守域有關。應用SWISS-MODEL軟件對CiAGL6蛋白進行三維結(jié)構(gòu)的同源建模。經(jīng)同源比對分析，以含有MADS-box結(jié)構(gòu)域的晶體結(jié)構(gòu)（6byy.1.B）為模板，圖2D顯示在3級結(jié)構(gòu)中MADS-box結(jié)構(gòu)域構(gòu)成了該蛋白核心結(jié)構(gòu)，該蛋白3級結(jié)構(gòu)模型的QMEAN得分為-1.60，表明模擬得到的CiAGL6蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)是可靠的。2.2 薄殼山核桃CiAGL6系統(tǒng)進化關系

采用實時熒光定量PCR法對CiAGL6基因在雌花和雄花中的表達情況進行分析，CiAGL6基因在雌花中的表達水平顯著高于雄花（圖4A）。進一步對CiAGL6基因在雌花芽分化和發(fā)育不同時期的表達量進行檢測（圖4B），基因表達分析結(jié)果顯示，在雌花芽分化前3個階段CiAGL6基因表達量維持在較低的水平，在顯蕾期和盛花期達到峰值，其中在盛花期的表達量最高，說明CiAGL6基因在薄殼山核桃雌花器官發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用。圖4 薄殼山核桃CiAGL6基因在雌雄花中的表達量（A）以及雌花不同發(fā)育時期的表達量（B)

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3341930