多小穗小麥種質(zhì)10-A穗部相關(guān)性狀的基因定位
發(fā)布時(shí)間：2021-08-12 15:10
小麥?zhǔn)鞘澜缟现匾募Z食作物之一。小麥穗部性狀對(duì)小麥最終產(chǎn)量的形成具有重要貢獻(xiàn)。其中,小穗數(shù)、千粒重和芒長(zhǎng)是小麥穗部性狀的重要組成。本研究采用集群分離分析（bulked segregant analysis,BSA）法,利用小麥660K SNP芯片,對(duì)多小穗種質(zhì)10-A構(gòu)建的10-A/BE89 F7 RIL群體的小穗數(shù)和芒長(zhǎng),10-A/B39 F6 RIL群體的千粒重和芒長(zhǎng)進(jìn)行了初步的基因定位,并結(jié)合qRT-PCR分析篩選候選基因,為相關(guān)性狀的精細(xì)定位、基因克隆和分子標(biāo)記輔助育種奠定基礎(chǔ)。本研究主要研究結(jié)果如下:（1）田間性狀調(diào)查表明,10-A與BE89和B39在小穗數(shù)、千粒重和芒長(zhǎng)均存在顯著差異。群體10-A/BE89 F7的平均小穗數(shù)和芒長(zhǎng)分別為22.35和3.63cm,變異系數(shù)為10.55%和63.67%,群體10-A/B39 F6平均千粒重和芒長(zhǎng)分別為47.3g和3.78cm,變異系數(shù)為21.47%和72.81%。選擇群體中各性狀30個(gè)極大值系和30個(gè)極小值系分別組成極值混合池。利用小麥660...
【文章來(lái)源】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】：66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
圖13個(gè)親本植株與穗子的表型比較
20圖2目標(biāo)性狀頻率分布直方圖Fig.2Frequencydistributionoftrait注：a和b分別是10-A/BE89群體小穗數(shù)和芒長(zhǎng)的頻率分布直方圖；c和d分別是10-A/B39群體千粒重和芒長(zhǎng)的頻率分布直方圖。表2親本間多態(tài)性SNP位點(diǎn)在基因組上的分布Table2DidtributionofpolymorphicSNPlociongenomeofwheatbetweenparents同源染色體10-A/BE8910-A/B39ABD總計(jì)ABD總計(jì)143718813175621220514656324544659510143212237161533192761016962808656512104518341208791861271632952614104471515629824478617516731373149612523574001498863727718927493總計(jì)256419965105070158119683743923百分比（%）50.639.410.140.350.29.5
22圖3親本間多態(tài)性SNP位點(diǎn)在染色體上的分布Fig.3DistributionofpolymorphicSNPlociongenomeofwheatbetweenparents注：a和b是10-A/BE89群體中，親本間具有多態(tài)性的SNP位點(diǎn)在基因組上分布的直方圖和折線圖；c和d是10-A/B39群體中，親本本具有多態(tài)性的SNP位點(diǎn)在基因組上分布的直方圖和折線圖。3.3BSA分析3.3.1候選區(qū)域的分析在10-A/BE89和10-A/B39群體中，親本間具有多態(tài)性，且有染色體位置信息的SNP位點(diǎn)分別有5070個(gè)和3923個(gè)。在篩選出親本間的多態(tài)性SNP的基礎(chǔ)上，進(jìn)一步分析目標(biāo)性狀混合池，得到混合池間具有差異SNP（表3）。（1）對(duì)于10-A/BE89群體，在小穗數(shù)的兩個(gè)極端混合池之間有差異SNP位點(diǎn)有186個(gè)，已有相應(yīng)的染色體信息有177個(gè)，在6B染色體上的差異SNP標(biāo)記最多，為38個(gè)，在4D染色體上沒(méi)有差異SNP位點(diǎn)，在7B和7D上僅有一個(gè)1個(gè)差異SNP位點(diǎn)；在芒長(zhǎng)的兩個(gè)極端混合池之間有差異的SNP位點(diǎn)有77個(gè)，已有相應(yīng)的染色體信息的有76個(gè)，在7B染色體上有差異SNP標(biāo)記最多，有15個(gè)，總共有4個(gè)染色體（1A，1D，3D和6D）上沒(méi)有差異SNP標(biāo)記，在4A和4D染色體上僅僅只有1個(gè)差異SNP位點(diǎn)。（2）對(duì)于10-A/B39群體，在千粒重的兩個(gè)極端
本文編號(hào)：3338550
【文章來(lái)源】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】：66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
圖13個(gè)親本植株與穗子的表型比較
20圖2目標(biāo)性狀頻率分布直方圖Fig.2Frequencydistributionoftrait注：a和b分別是10-A/BE89群體小穗數(shù)和芒長(zhǎng)的頻率分布直方圖；c和d分別是10-A/B39群體千粒重和芒長(zhǎng)的頻率分布直方圖。表2親本間多態(tài)性SNP位點(diǎn)在基因組上的分布Table2DidtributionofpolymorphicSNPlociongenomeofwheatbetweenparents同源染色體10-A/BE8910-A/B39ABD總計(jì)ABD總計(jì)143718813175621220514656324544659510143212237161533192761016962808656512104518341208791861271632952614104471515629824478617516731373149612523574001498863727718927493總計(jì)256419965105070158119683743923百分比（%）50.639.410.140.350.29.5
22圖3親本間多態(tài)性SNP位點(diǎn)在染色體上的分布Fig.3DistributionofpolymorphicSNPlociongenomeofwheatbetweenparents注：a和b是10-A/BE89群體中，親本間具有多態(tài)性的SNP位點(diǎn)在基因組上分布的直方圖和折線圖；c和d是10-A/B39群體中，親本本具有多態(tài)性的SNP位點(diǎn)在基因組上分布的直方圖和折線圖。3.3BSA分析3.3.1候選區(qū)域的分析在10-A/BE89和10-A/B39群體中，親本間具有多態(tài)性，且有染色體位置信息的SNP位點(diǎn)分別有5070個(gè)和3923個(gè)。在篩選出親本間的多態(tài)性SNP的基礎(chǔ)上，進(jìn)一步分析目標(biāo)性狀混合池，得到混合池間具有差異SNP（表3）。（1）對(duì)于10-A/BE89群體，在小穗數(shù)的兩個(gè)極端混合池之間有差異SNP位點(diǎn)有186個(gè)，已有相應(yīng)的染色體信息有177個(gè)，在6B染色體上的差異SNP標(biāo)記最多，為38個(gè)，在4D染色體上沒(méi)有差異SNP位點(diǎn)，在7B和7D上僅有一個(gè)1個(gè)差異SNP位點(diǎn)；在芒長(zhǎng)的兩個(gè)極端混合池之間有差異的SNP位點(diǎn)有77個(gè)，已有相應(yīng)的染色體信息的有76個(gè)，在7B染色體上有差異SNP標(biāo)記最多，有15個(gè)，總共有4個(gè)染色體（1A，1D，3D和6D）上沒(méi)有差異SNP標(biāo)記，在4A和4D染色體上僅僅只有1個(gè)差異SNP位點(diǎn)。（2）對(duì)于10-A/B39群體，在千粒重的兩個(gè)極端
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