馬鈴薯StGS基因克隆及鎘脅迫下的表達分析
發(fā)布時間:2021-08-08 13:33
谷胱甘肽(glutathione, GSH)是植物體內(nèi)重要的抗氧化劑,能有效清除活性氧自由基對細胞造成的損傷。為研究鎘脅迫對馬鈴薯(Solanum tuberosum)谷胱甘肽合成酶(glutathione synthetase, GS)編碼基因表達的影響,本研究以馬鈴薯‘威芋7號’為試驗材料,采用同源克隆的方法從cDNA中克隆到StGS基因。序列分析表明,該基因ORF全長為1 644 bp,可編碼344個氨基酸;在所選的物種中,蛋白序列同源性分析顯示,馬鈴薯GS蛋白與潘那利番茄(Solanum pennellii)的親緣關系最近,相似度為93.98%,與枸杞(Lycium barbarum)親緣關系最遠。另外,實時熒光定量PCR分析表明,鎘脅迫24 h與4 h相比,馬鈴薯根和葉中GS相對表達量均達到極顯著水平,分別為脅迫4 h的15倍和13倍;而在莖中GS相對表達量呈現(xiàn)出下降趨勢。鎘脅迫4 h時GS相對表達量為24 h的6倍,暗示StGS不僅是一個鎘應答的基因,而且馬鈴薯植株不同器官應在應答鎘脅迫時GS的表達存在一定差異。本研究結(jié)果為進一步探究StGS基因介導的鎘脅迫響應機制提供前期...
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(18)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
馬鈴薯StGS基因PCR擴增
圖1 馬鈴薯StGS基因PCR擴增利用ExPASy(http://web.expasy.org/protpa ram/)對StGS蛋白理化特性分析表明,該蛋白分子量約為61 190.79 Da,理論等電點(pI)為6.01,總共包括8 614個原子,分子式為C2703H4315N751O824S21;在組成StGS編碼蛋白的19種氨基酸中,異亮氨酸Leu(L)所占比例最高10.8%,而色氨酸(Trp)所占比例最低,為1.1%,不含新發(fā)現(xiàn)的吡咯賴氨酸Pyl(O)和硒半胱氨酸Sec(U)�?偟膸д姎埢�(Arg+Lys)個數(shù)為69,帶負電殘基(Asp+Glu)個數(shù)為61。不穩(wěn)定性系數(shù)為49.99(>40為不穩(wěn)定),屬于不穩(wěn)定性蛋白,脂肪指數(shù)為92.36,總平均親水性分數(shù)為-0.295;馬鈴薯StGS蛋白亞細胞定位表明,StGS蛋白定位在細胞核中。
不同組織在鎘脅迫下的StGS相對表達量
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Cd脅迫對馬鈴薯根際土壤細菌群落組成及多樣性的影響[J]. 謝朝,付天嶺,何騰兵,成劍波,符東順,羅勝. 河南農(nóng)業(yè)科學. 2020(06)
[2]鎘逆境脅迫下甜菜谷胱甘肽合成酶(BvGS)基因的克隆[J]. 劉大麗,馬龍彪,郭愛英,楊洪,魯振強. 中國糖料. 2017(06)
[3]中國馬鈴薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀及對策[J]. 黃鳳玲,張琳,李先德,蔡典雄. 農(nóng)業(yè)展望. 2017(01)
[4]鉛、鎘脅迫對馬鈴薯葉綠素含量及細胞超微結(jié)構的影響[J]. 李佩華. 湖北農(nóng)業(yè)科學. 2015(16)
碩士論文
[1]鎘脅迫下馬鈴薯相關表達基因的轉(zhuǎn)錄組測序與候選基因挖掘[D]. 符東順.貴州大學 2019
本文編號:3330054
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(18)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
馬鈴薯StGS基因PCR擴增
圖1 馬鈴薯StGS基因PCR擴增利用ExPASy(http://web.expasy.org/protpa ram/)對StGS蛋白理化特性分析表明,該蛋白分子量約為61 190.79 Da,理論等電點(pI)為6.01,總共包括8 614個原子,分子式為C2703H4315N751O824S21;在組成StGS編碼蛋白的19種氨基酸中,異亮氨酸Leu(L)所占比例最高10.8%,而色氨酸(Trp)所占比例最低,為1.1%,不含新發(fā)現(xiàn)的吡咯賴氨酸Pyl(O)和硒半胱氨酸Sec(U)�?偟膸д姎埢�(Arg+Lys)個數(shù)為69,帶負電殘基(Asp+Glu)個數(shù)為61。不穩(wěn)定性系數(shù)為49.99(>40為不穩(wěn)定),屬于不穩(wěn)定性蛋白,脂肪指數(shù)為92.36,總平均親水性分數(shù)為-0.295;馬鈴薯StGS蛋白亞細胞定位表明,StGS蛋白定位在細胞核中。
不同組織在鎘脅迫下的StGS相對表達量
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Cd脅迫對馬鈴薯根際土壤細菌群落組成及多樣性的影響[J]. 謝朝,付天嶺,何騰兵,成劍波,符東順,羅勝. 河南農(nóng)業(yè)科學. 2020(06)
[2]鎘逆境脅迫下甜菜谷胱甘肽合成酶(BvGS)基因的克隆[J]. 劉大麗,馬龍彪,郭愛英,楊洪,魯振強. 中國糖料. 2017(06)
[3]中國馬鈴薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀及對策[J]. 黃鳳玲,張琳,李先德,蔡典雄. 農(nóng)業(yè)展望. 2017(01)
[4]鉛、鎘脅迫對馬鈴薯葉綠素含量及細胞超微結(jié)構的影響[J]. 李佩華. 湖北農(nóng)業(yè)科學. 2015(16)
碩士論文
[1]鎘脅迫下馬鈴薯相關表達基因的轉(zhuǎn)錄組測序與候選基因挖掘[D]. 符東順.貴州大學 2019
本文編號:3330054
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