西瓜GAPDH基因家族的鑒定與功能的初步分析
發(fā)布時間：2021-08-08 13:00
西瓜是我國重要的經(jīng)濟作物,其栽培面積和產(chǎn)量均居世界第一位。近年來,隨著設(shè)施栽培面積的擴大,選育高抗、廣適和優(yōu)質(zhì)的西瓜品種已成為現(xiàn)在亟待解決的問題之一。目前,西瓜的全基因組測序已經(jīng)完成,但后續(xù)關(guān)于基因功能的研究相對落后,尤其是針對西瓜抗逆相關(guān)基因功能的研究仍不明了。此外,西瓜遺傳背景相對狹窄。因此,研究和利用抗性相關(guān)基因,不但可以指導西瓜抗逆新品種的選育,并能為抗性機制的解析提供理論基礎(chǔ)。3-磷酸甘油醛脫氫酶（Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH）是細胞內(nèi)糖代謝過程中一個組成性表達蛋白,參與細胞中糖酵解途徑,與ATP的合成密切相關(guān)。通常GAPDH在生物體內(nèi)的含量較為豐富,它也通常被看作是一種內(nèi)參蛋白。本文通過篩選和鑒定葫蘆科主要作物西瓜、甜瓜、黃瓜和南瓜的GAPDH基因家族成員,比較了不同物種間的家族進化關(guān)系;同時針對西瓜GAPDH基因家族在非生物脅迫和生物脅迫等方面的非糖酵解功能進行了初步驗證,并克隆了西瓜GAPDH家族中的逆境響應基因ClaGAPDH3、ClaGAPDH4和ClaGAPDH5;為了進一步驗證其功能,初步構(gòu)建了GA...
【文章來源】：河南農(nóng)業(yè)大學河南省
【文章頁數(shù)】：58 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
植物中的GAPDH(①GAPC;②GAPAIB;③NP-GAPDH;④GAPCp)（引自張秀紅，2010）
圖 1-2 植物中的 GAPCs 的代謝調(diào)控模式圖Figure 1-2 the metabolic regulation pattern chart of GAPCs gene in pl脫氫酶（GAPDH）曾被認為是一個簡單的管家基因。近年來環(huán)境中能夠特異性表達，通過改變細胞膜的狀態(tài)來抵抗外
圖 2-4 葫蘆科主要作物 GAPDH 基因結(jié)構(gòu)圖Figure 2-4 GAPDH genetic structure不同物種名稱的對應縮寫如下：At 代表擬南芥；Cla 代表西瓜；Cme 代表甜瓜；Csa 代表黃瓜；Cmo 代表南瓜；黃色代表 CDS，藍色代表上下游，一代表內(nèi)含子。
【參考文獻】：
期刊論文
[1]小麥UROS基因的可變剪接[J]. 郎丹瑩,呂庚寅,梁廣旺,李瑞航,郭曉光,徐虹,郭藹光. 麥類作物學報. 2016(12)
[2]可可泛素結(jié)合酶基因家族的生物信息學初步分析[J]. 趙秋芳,董晨,決登偉,陳宏良,賈利強. 熱帶作物學報. 2016(09)
[3]太子參GAPDH基因的克隆及序列分析[J]. 龍登凱,丁鈴,李軍,周濤,江維克,肖承鴻. 河南農(nóng)業(yè)科學. 2016(07)
[4]西瓜bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族基因的鑒定及其在非生物脅迫下的表達分析[J]. 何潔,顧秀容,魏春華,楊小振,李好,馬建祥,張勇,楊建強,張顯. 園藝學報. 2016(02)
[5]我國西瓜品種選育研究進展[J]. 劉文革,何楠,趙勝杰,路緒強. 中國瓜菜. 2016(01)
[6]羊蹄GAPDH基因的克隆及序列分析[J]. 任聰,黃五星,張翔,邵惠芳,許自成. 河南農(nóng)業(yè)科學. 2015(02)
[7]香蕉GAPDH基因家族的生物信息學及轉(zhuǎn)錄表達分析[J]. 史后蕊,馮仁軍,王靜毅,柴娟,任夢云,盧利方,張銀東. 熱帶作物學報. 2014(06)
[8]黃瓜、甜瓜和西瓜MLO基因家族的比較基因組學分析[J]. 徐堅,陳先知,王燕,史建磊,朱隆靜,王克磊. 核農(nóng)學報. 2014(06)
[9]刺五加GAPDH基因全長cDNA的克隆與生物信息學分析[J]. 修樂山,柴麗花,周秘,邢朝斌. 廣東農(nóng)業(yè)科學. 2013(16)
[10]植物甘油醛-3-磷酸脫氫酶作用機制的研究進展[J]. 盧倩,弭曉菊,崔繼哲. 生物技術(shù)通報. 2013(08)
博士論文
[1]水稻胞質(zhì)3-磷酸甘油醛脫氫酶基因家族的分離和功能分析[D]. 張秀紅.武漢大學 2011
碩士論文
[1]生長素相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子家族基因在西瓜果實膨大過程中的調(diào)控作用分析[D]. 袁靜賢.華中農(nóng)業(yè)大學 2015
[2]長武134小麥GAPDH基因過表達載體的構(gòu)建及擬南芥的遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 張陽璞.西北農(nóng)林科技大學 2014
[3]玉米苗期干旱脅迫下可變剪接及其調(diào)控因子的研究[D]. 李嬌.鄭州大學 2013
[4]抗旱小麥長武134 GAPDH基因的表達及克隆[D]. 崔麗榮.西北農(nóng)林科技大學 2010
本文編號：3330002
【文章來源】：河南農(nóng)業(yè)大學河南省
【文章頁數(shù)】：58 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
植物中的GAPDH(①GAPC;②GAPAIB;③NP-GAPDH;④GAPCp)（引自張秀紅，2010）
圖 1-2 植物中的 GAPCs 的代謝調(diào)控模式圖Figure 1-2 the metabolic regulation pattern chart of GAPCs gene in pl脫氫酶（GAPDH）曾被認為是一個簡單的管家基因。近年來環(huán)境中能夠特異性表達，通過改變細胞膜的狀態(tài)來抵抗外
圖 2-4 葫蘆科主要作物 GAPDH 基因結(jié)構(gòu)圖Figure 2-4 GAPDH genetic structure不同物種名稱的對應縮寫如下：At 代表擬南芥；Cla 代表西瓜；Cme 代表甜瓜；Csa 代表黃瓜；Cmo 代表南瓜；黃色代表 CDS，藍色代表上下游，一代表內(nèi)含子。
【參考文獻】：
期刊論文
[1]小麥UROS基因的可變剪接[J]. 郎丹瑩,呂庚寅,梁廣旺,李瑞航,郭曉光,徐虹,郭藹光. 麥類作物學報. 2016(12)
[2]可可泛素結(jié)合酶基因家族的生物信息學初步分析[J]. 趙秋芳,董晨,決登偉,陳宏良,賈利強. 熱帶作物學報. 2016(09)
[3]太子參GAPDH基因的克隆及序列分析[J]. 龍登凱,丁鈴,李軍,周濤,江維克,肖承鴻. 河南農(nóng)業(yè)科學. 2016(07)
[4]西瓜bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族基因的鑒定及其在非生物脅迫下的表達分析[J]. 何潔,顧秀容,魏春華,楊小振,李好,馬建祥,張勇,楊建強,張顯. 園藝學報. 2016(02)
[5]我國西瓜品種選育研究進展[J]. 劉文革,何楠,趙勝杰,路緒強. 中國瓜菜. 2016(01)
[6]羊蹄GAPDH基因的克隆及序列分析[J]. 任聰,黃五星,張翔,邵惠芳,許自成. 河南農(nóng)業(yè)科學. 2015(02)
[7]香蕉GAPDH基因家族的生物信息學及轉(zhuǎn)錄表達分析[J]. 史后蕊,馮仁軍,王靜毅,柴娟,任夢云,盧利方,張銀東. 熱帶作物學報. 2014(06)
[8]黃瓜、甜瓜和西瓜MLO基因家族的比較基因組學分析[J]. 徐堅,陳先知,王燕,史建磊,朱隆靜,王克磊. 核農(nóng)學報. 2014(06)
[9]刺五加GAPDH基因全長cDNA的克隆與生物信息學分析[J]. 修樂山,柴麗花,周秘,邢朝斌. 廣東農(nóng)業(yè)科學. 2013(16)
[10]植物甘油醛-3-磷酸脫氫酶作用機制的研究進展[J]. 盧倩,弭曉菊,崔繼哲. 生物技術(shù)通報. 2013(08)
博士論文
[1]水稻胞質(zhì)3-磷酸甘油醛脫氫酶基因家族的分離和功能分析[D]. 張秀紅.武漢大學 2011
碩士論文
[1]生長素相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子家族基因在西瓜果實膨大過程中的調(diào)控作用分析[D]. 袁靜賢.華中農(nóng)業(yè)大學 2015
[2]長武134小麥GAPDH基因過表達載體的構(gòu)建及擬南芥的遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 張陽璞.西北農(nóng)林科技大學 2014
[3]玉米苗期干旱脅迫下可變剪接及其調(diào)控因子的研究[D]. 李嬌.鄭州大學 2013
[4]抗旱小麥長武134 GAPDH基因的表達及克隆[D]. 崔麗榮.西北農(nóng)林科技大學 2010
本文編號：3330002
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