AP2作為一類(lèi)植物轉(zhuǎn)錄因子,在花的發(fā)育和營(yíng)養(yǎng)器官的形成過(guò)程中都起著非常重要的作用。旨在對(duì)蔓花生（Arachis duranensis）AP2蛋白的理化性質(zhì)及分子進(jìn)化關(guān)系等進(jìn)行詳細(xì)的生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,蔓花生AP2基因家族成員編碼蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)均在細(xì)胞核中,有11個(gè)成員的理論等電點(diǎn)小于7,推測(cè)該家族蛋白多為酸性蛋白,有8個(gè)成員存在2個(gè)保守結(jié)構(gòu)域;該家族成員均無(wú)信號(hào)肽;除了Aradu.SE6Q0與Aradu.42K79成員中存在跨膜現(xiàn)象外,其他成員鮮少出現(xiàn)跨膜現(xiàn)象。親疏水性預(yù)測(cè)結(jié)果表明,蔓花生AP2基因家族編碼蛋白的親疏水性系數(shù)均小于0,推測(cè)其為親水蛋白;磷酸化位點(diǎn)主要集中在絲氨酸上;其二級(jí)結(jié)構(gòu)以無(wú)規(guī)則卷曲和α-螺旋為主。研究還得出,蔓花生AP2基因家族編碼蛋白的主要保守基序是Motif1、Motif2和Motif4;Motif3、Motif4都含有YRG結(jié)構(gòu)域,Motif5含有RAYD結(jié)構(gòu)域;構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)也有力地說(shuō)明了AP2基因家族的進(jìn)化程度。 

【文章來(lái)源】：江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(14)

【文章頁(yè)數(shù)】：13 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 蔓花生AP2基因家族理化性質(zhì)的分析及亞細(xì)胞定位
        1.2.2 氨基酸保守結(jié)構(gòu)域的預(yù)測(cè)分析
        1.2.3 氨基酸信號(hào)肽及跨膜結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)分析
        1.2.4 氨基酸親疏水性的預(yù)測(cè)分析
        1.2.5 磷酸化位點(diǎn)的預(yù)測(cè)分析
        1.2.6 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)分析
        1.2.7 蔓花生AP2基因家族的蛋白基序分析
        1.2.8 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
    2.1 蔓花生AP2基因家族編碼蛋白理化性質(zhì)的分析及亞細(xì)胞定位
    2.2 氨基酸保守結(jié)構(gòu)域分析
    2.3 氨基酸信號(hào)肽及跨膜結(jié)構(gòu)分析
    2.4 氨基酸親疏水性預(yù)測(cè)分析
    2.5 磷酸化位點(diǎn)分析
    2.6 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)分析
    2.7 蔓花生AP2基因家族編碼蛋白基序分析
    2.8 系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析
3 討論與結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]辣椒CONSTANS-like轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學(xué)分析[J]. 李寧,高升華,王飛,尹延旭,姚明華,焦春海.  北方園藝. 2019(15)
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[3]玉米轉(zhuǎn)錄因子NF-YB基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 徐志軍,劉洋,徐磊,安東升.  分子植物育種. 2019(12)
[4]羅漢果幾丁質(zhì)酶基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 李惠敏,李璐璐,陳玉梅,李佳慧.  生物信息學(xué). 2019(03)
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[6]西洋參bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族生物信息學(xué)分析[J]. 閆艷,王希,周珂輝,李紀(jì)冬,韓鵬,邸鵬.  吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(03)
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碩士論文
[1]花生突變體庫(kù)的構(gòu)建及APETALA2基因的表達(dá)分析[D]. 宋佳靜.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]Pb2+、Hg2+脅迫下蔓花生逆境生理及田間不定根發(fā)生研究[D]. 張利.西南大學(xué) 2008
[3]地被植物蔓花生再生體系建立及多倍體誘導(dǎo)[D]. 鄭荷.西南大學(xué) 2008
[4]蔓花生（Arachis duranensis Krap.et Greg）在低溫脅迫下的生理反應(yīng)研究[D]. 周立.西南大學(xué) 2008



本文編號(hào)：3329731