AP2作為一類植物轉(zhuǎn)錄因子,在花的發(fā)育和營養(yǎng)器官的形成過程中都起著非常重要的作用。旨在對蔓花生（Arachis duranensis）AP2蛋白的理化性質(zhì)及分子進化關(guān)系等進行詳細的生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,蔓花生AP2基因家族成員編碼蛋白亞細胞定位預(yù)測均在細胞核中,有11個成員的理論等電點小于7,推測該家族蛋白多為酸性蛋白,有8個成員存在2個保守結(jié)構(gòu)域;該家族成員均無信號肽;除了Aradu.SE6Q0與Aradu.42K79成員中存在跨膜現(xiàn)象外,其他成員鮮少出現(xiàn)跨膜現(xiàn)象。親疏水性預(yù)測結(jié)果表明,蔓花生AP2基因家族編碼蛋白的親疏水性系數(shù)均小于0,推測其為親水蛋白;磷酸化位點主要集中在絲氨酸上;其二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲和α-螺旋為主。研究還得出,蔓花生AP2基因家族編碼蛋白的主要保守基序是Motif1、Motif2和Motif4;Motif3、Motif4都含有YRG結(jié)構(gòu)域,Motif5含有RAYD結(jié)構(gòu)域;構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹也有力地說明了AP2基因家族的進化程度。 

【文章來源】：江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(14)

【文章頁數(shù)】：13 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 蔓花生AP2基因家族理化性質(zhì)的分析及亞細胞定位
        1.2.2 氨基酸保守結(jié)構(gòu)域的預(yù)測分析
        1.2.3 氨基酸信號肽及跨膜結(jié)構(gòu)的預(yù)測分析
        1.2.4 氨基酸親疏水性的預(yù)測分析
        1.2.5 磷酸化位點的預(yù)測分析
        1.2.6 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)的預(yù)測分析
        1.2.7 蔓花生AP2基因家族的蛋白基序分析
        1.2.8 系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
    2.1 蔓花生AP2基因家族編碼蛋白理化性質(zhì)的分析及亞細胞定位
    2.2 氨基酸保守結(jié)構(gòu)域分析
    2.3 氨基酸信號肽及跨膜結(jié)構(gòu)分析
    2.4 氨基酸親疏水性預(yù)測分析
    2.5 磷酸化位點分析
    2.6 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)的預(yù)測分析
    2.7 蔓花生AP2基因家族編碼蛋白基序分析
    2.8 系統(tǒng)進化關(guān)系分析
3 討論與結(jié)論


【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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[3]地被植物蔓花生再生體系建立及多倍體誘導(dǎo)[D]. 鄭荷.西南大學(xué) 2008
[4]蔓花生（Arachis duranensis Krap.et Greg）在低溫脅迫下的生理反應(yīng)研究[D]. 周立.西南大學(xué) 2008



本文編號：3329731