基因芯片篩選人肺腺癌SPC-A-1干細(xì)胞樣細(xì)胞特異性標(biāo)志分子研究
發(fā)布時(shí)間:2021-08-08 07:29
目的通過(guò)基因芯片技術(shù)篩選特異性的肺癌干細(xì)胞標(biāo)志分子,為后續(xù)肺癌干細(xì)胞的篩選和功能研究奠定基礎(chǔ),為肺癌的發(fā)生機(jī)制和靶向治療提供依據(jù)。方法將人肺腺癌SPC-A-1貼壁細(xì)胞(SPC-A-1monolayer cells,SPC-A-1-MC)作為對(duì)照組,將SPC-A-1-MC細(xì)胞培養(yǎng)于含20μg/L的重組人表皮生長(zhǎng)因子(epidermal growth factor,EGF)和重組人堿性成纖維因子(basic fibroblast growth factor,b-FGF)及2%B27三種誘導(dǎo)因子的DMEM/F12培養(yǎng)基中誘導(dǎo)得到SPC-A-1干細(xì)胞樣細(xì)胞(SPC-A-1stem-like cells,SPC-A-1-SC),作為實(shí)驗(yàn)組。收取兩組細(xì)胞樣本RNA,采用基因芯片技術(shù)篩選兩組間差異表達(dá)基因,進(jìn)一步對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO富集分析和KEGG通路富集分析。實(shí)時(shí)熒光定量PCR(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)驗(yàn)證部分關(guān)鍵差異表達(dá)基因在兩組間的表達(dá)水平;采用兩組獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)對(duì)兩組間差異基因的表達(dá)結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析...
【文章來(lái)源】:中華腫瘤防治雜志. 2020,27(22)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
人肺腺癌SPC-A-1貼壁細(xì)胞與干細(xì)胞樣細(xì)胞RNA探針信號(hào)強(qiáng)度分布曲線
對(duì)差異表達(dá)上調(diào)基因SPRY1、ANTXR2、SER-PINE2及下調(diào)基因KRT7和DKK1進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證。圖4示,與對(duì)照組相比,實(shí)驗(yàn)組上調(diào)基因SPRY1上調(diào)(77.404±23.247)倍,t=-68.77,P<0.001;ANTXR2上調(diào)(17.454±1.163)倍,t=-34.22,P<0.001;SERPINE2上調(diào)(66.744±7.537)倍,t=-15.10,P<0.001;下調(diào)基因KRT7下調(diào)(53.328±0.932)倍,t=69.70,P<0.001;DKK1下調(diào)(16.800±0.482)倍,t=199.37,P<0.001;組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,qRT-PCR驗(yàn)證結(jié)果與芯片結(jié)果一致。圖3 人肺腺癌SPC-A-1貼壁細(xì)胞與干細(xì)胞樣細(xì)胞差異表達(dá)基因的主要生物學(xué)功能
圖2 人肺腺癌SPC-A-1貼壁細(xì)胞與干細(xì)胞樣細(xì)胞差異表達(dá)基因散點(diǎn)圖圖4 人肺腺癌SPC-A-1貼壁細(xì)胞與干細(xì)胞樣細(xì)胞差異表達(dá)基因參與的主要信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]人肺腺癌A549干樣細(xì)胞富集及其自噬表達(dá)水平研究[J]. 劉長(zhǎng)路,李才弘,代森林,李亞軍,劉代順. 中華腫瘤防治雜志. 2020(02)
[2]H226細(xì)胞和肺癌及其淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組織CPA4表達(dá)以及生物學(xué)功能研究[J]. 張峰,張媛,孫立新,陳夢(mèng),冉宇靚,孫力超. 中華腫瘤防治雜志. 2019(06)
[3]非小細(xì)胞肺癌組織STAT3信號(hào)與靶基因VEGF及VEGF-C關(guān)系的研究[J]. 朱鵬沖,孫志鋼,肖偉,張楠,王軍,王洲,朱良明. 中華腫瘤防治雜志. 2016(12)
[4]下調(diào)CD133表達(dá)對(duì)肝癌干細(xì)胞上皮間質(zhì)化和侵襲能力影響及機(jī)制探討[J]. 牛堅(jiān),王月. 中華腫瘤防治雜志. 2016(11)
本文編號(hào):3329512
【文章來(lái)源】:中華腫瘤防治雜志. 2020,27(22)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
人肺腺癌SPC-A-1貼壁細(xì)胞與干細(xì)胞樣細(xì)胞RNA探針信號(hào)強(qiáng)度分布曲線
對(duì)差異表達(dá)上調(diào)基因SPRY1、ANTXR2、SER-PINE2及下調(diào)基因KRT7和DKK1進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證。圖4示,與對(duì)照組相比,實(shí)驗(yàn)組上調(diào)基因SPRY1上調(diào)(77.404±23.247)倍,t=-68.77,P<0.001;ANTXR2上調(diào)(17.454±1.163)倍,t=-34.22,P<0.001;SERPINE2上調(diào)(66.744±7.537)倍,t=-15.10,P<0.001;下調(diào)基因KRT7下調(diào)(53.328±0.932)倍,t=69.70,P<0.001;DKK1下調(diào)(16.800±0.482)倍,t=199.37,P<0.001;組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,qRT-PCR驗(yàn)證結(jié)果與芯片結(jié)果一致。圖3 人肺腺癌SPC-A-1貼壁細(xì)胞與干細(xì)胞樣細(xì)胞差異表達(dá)基因的主要生物學(xué)功能
圖2 人肺腺癌SPC-A-1貼壁細(xì)胞與干細(xì)胞樣細(xì)胞差異表達(dá)基因散點(diǎn)圖圖4 人肺腺癌SPC-A-1貼壁細(xì)胞與干細(xì)胞樣細(xì)胞差異表達(dá)基因參與的主要信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]人肺腺癌A549干樣細(xì)胞富集及其自噬表達(dá)水平研究[J]. 劉長(zhǎng)路,李才弘,代森林,李亞軍,劉代順. 中華腫瘤防治雜志. 2020(02)
[2]H226細(xì)胞和肺癌及其淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組織CPA4表達(dá)以及生物學(xué)功能研究[J]. 張峰,張媛,孫立新,陳夢(mèng),冉宇靚,孫力超. 中華腫瘤防治雜志. 2019(06)
[3]非小細(xì)胞肺癌組織STAT3信號(hào)與靶基因VEGF及VEGF-C關(guān)系的研究[J]. 朱鵬沖,孫志鋼,肖偉,張楠,王軍,王洲,朱良明. 中華腫瘤防治雜志. 2016(12)
[4]下調(diào)CD133表達(dá)對(duì)肝癌干細(xì)胞上皮間質(zhì)化和侵襲能力影響及機(jī)制探討[J]. 牛堅(jiān),王月. 中華腫瘤防治雜志. 2016(11)
本文編號(hào):3329512
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