魚類抗病毒基因TRIM和IFN基因克隆及功能研究
發(fā)布時間:2021-08-05 10:29
TRIM(tripartite motifs)蛋白是一類數(shù)目龐大的蛋白家族,其結構包括RING(really interesting new gene)結構域,1個或2個B-box結構域和Coiled-coil結構域,以及緊接其后的不同C端結構域。TRIM蛋白在不同的細胞過程中扮演多種重要角色,例如細胞的生長、分化、細胞凋亡和抗病毒免疫。finTRIM(fish novel large multigene TRIM genes)只在硬骨魚類中出現(xiàn),并且發(fā)揮重要的抗病毒免疫功能。干擾素(interferon,IFN)在機體抗病毒免疫反應中發(fā)揮重要的作用,能夠刺激下游的多種IFN刺激基因蛋白表達進而發(fā)揮功能。TRIM蛋白屬于IFN刺激基因家族的一個成員,研究TRIM和IFN的功能能夠為魚類抗病毒的防治措施提供理論基礎。本研究通過系統(tǒng)進化分析,發(fā)現(xiàn)草魚中存在魚類TRIM14(finTRIM14/ftr14)基因、ftr51、ftr67、ftr72、ftr82、ftr83和ftr99基因,表明TRIM基因的特定譜系多樣化事件的發(fā)生。因此,finTRIM基因的數(shù)量在不同的物種之間有較大差異。草魚...
【文章來源】:長江大學湖北省
【文章頁數(shù)】:118 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
TRIM蛋白家族分類結構示意圖
圖 1-2 TRIM5α的結構模型[53]Fig. 1-2 Structure model of TRIM5α1.3 TRIM 蛋白在先天免疫中的功能在先天免疫反應中,細胞內(nèi)的信號調(diào)控主要由一些翻譯后修飾介導化作用,乙;饔煤头核鼗饔肹54]。TRIM 蛋白家族與先天免疫的在 TRIM5α中發(fā)現(xiàn)具有抗一些病毒的作用,如逆轉錄病毒和慢病毒,體免受感染,但是在人體 TRIM5α不能夠干擾 HIV 的感染[55]。TRIM5構域直接與病毒核外衣殼結合,或許接著摧毀病毒核心;TRIM5α也活 NF-κB 信號通路中的 TAK1 來抑制病毒的感染[56]。相反,一些 T先天免疫中能夠幫助一些病毒逃避免疫系統(tǒng)的識別。甲型流感病毒非Influenza A virus nonstructural protein 1,NS1)與 TRIM25 相互作IM25 介導的 RIG-I 通路中 K63 鏈接的泛素化,從而抑制 RIG-I 介導[57, 58]。黃熱病病毒(yellow fever virus)的非結構型 NS5 蛋白能夠通過互作用抑制 IFN 信號通路[59]。TRIM19 是核體(nuclear body)的必
圖 1-3 TRIM 蛋白在先天免疫系統(tǒng)和干擾素信號通路中的調(diào)節(jié)[65]Fig. 1-3 Regulation of TRIM in innate immunity and IFN signaling哺乳動物細胞擁有多種多樣的模式識別受體來識別不同的病原,如圖 1-3 所示,這些 PRRs 有些在細胞外(TLR1/2/4/5/6),有些在核內(nèi)體內(nèi)腔(TLR3/7/8/9)或細胞溶質部分(RIG-I/MDA5/DDX41)。TRIM5 通過 K63 交聯(lián)磷酸化鏈的合成,這 種 磷 酸 化 鏈 能 夠 激 活 TAK1 變 形 生 長 因 子 β 激 活 酶 1 結 合 蛋 白 1(TAK1-transfoming growth factor-β-activated kinase 1-bingding protein 1,TBK1)-TAB2 復合體,從而激活 NF-κB 信號通路[66]。TRIM38 與 TRAF6 和 TRIF 相互作用,然后介導 TRAF6 的 K48 交聯(lián)多泛素化作用和 TRIF 蛋白酶體的降解,以及與 TAB2/TAB3 溶酶體降解[67, 68]。人的巨細胞病毒(human cytomagalovirus,HCMV)基因產(chǎn)生的 UL144 通過激活 TRAF6 依賴的方式來激活 NF-κB。TRIM23和TRAF6的相互作用是UL144介導的NF-κB產(chǎn)生活性的必要條件,但是TRIM23不能通過TNF或者雙鏈RNA(dsRNA)來影響傳統(tǒng)的NF-κB信號通路[69]。TRIM62正向調(diào)節(jié) TLR4 信號通路中的 TRIF[70]。TRIM22 可以減少 TRAF6 的自我泛素化
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鱘細菌性敗血綜合征致病菌的初步研究[J]. 曹海鵬,楊先樂,高鵬,李怡,張書俊,鄧璐. 淡水漁業(yè). 2007(02)
[2]鱘魚病毒性疾病研究進展(英文)[J]. 華育平,王荻. Journal of Forestry Research. 2005(01)
博士論文
[1]魚類TRIM基因系統(tǒng)進化分析及免疫功能研究[D]. 張新尚.中國農(nóng)業(yè)科學院 2015
本文編號:3323593
【文章來源】:長江大學湖北省
【文章頁數(shù)】:118 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
TRIM蛋白家族分類結構示意圖
圖 1-2 TRIM5α的結構模型[53]Fig. 1-2 Structure model of TRIM5α1.3 TRIM 蛋白在先天免疫中的功能在先天免疫反應中,細胞內(nèi)的信號調(diào)控主要由一些翻譯后修飾介導化作用,乙;饔煤头核鼗饔肹54]。TRIM 蛋白家族與先天免疫的在 TRIM5α中發(fā)現(xiàn)具有抗一些病毒的作用,如逆轉錄病毒和慢病毒,體免受感染,但是在人體 TRIM5α不能夠干擾 HIV 的感染[55]。TRIM5構域直接與病毒核外衣殼結合,或許接著摧毀病毒核心;TRIM5α也活 NF-κB 信號通路中的 TAK1 來抑制病毒的感染[56]。相反,一些 T先天免疫中能夠幫助一些病毒逃避免疫系統(tǒng)的識別。甲型流感病毒非Influenza A virus nonstructural protein 1,NS1)與 TRIM25 相互作IM25 介導的 RIG-I 通路中 K63 鏈接的泛素化,從而抑制 RIG-I 介導[57, 58]。黃熱病病毒(yellow fever virus)的非結構型 NS5 蛋白能夠通過互作用抑制 IFN 信號通路[59]。TRIM19 是核體(nuclear body)的必
圖 1-3 TRIM 蛋白在先天免疫系統(tǒng)和干擾素信號通路中的調(diào)節(jié)[65]Fig. 1-3 Regulation of TRIM in innate immunity and IFN signaling哺乳動物細胞擁有多種多樣的模式識別受體來識別不同的病原,如圖 1-3 所示,這些 PRRs 有些在細胞外(TLR1/2/4/5/6),有些在核內(nèi)體內(nèi)腔(TLR3/7/8/9)或細胞溶質部分(RIG-I/MDA5/DDX41)。TRIM5 通過 K63 交聯(lián)磷酸化鏈的合成,這 種 磷 酸 化 鏈 能 夠 激 活 TAK1 變 形 生 長 因 子 β 激 活 酶 1 結 合 蛋 白 1(TAK1-transfoming growth factor-β-activated kinase 1-bingding protein 1,TBK1)-TAB2 復合體,從而激活 NF-κB 信號通路[66]。TRIM38 與 TRAF6 和 TRIF 相互作用,然后介導 TRAF6 的 K48 交聯(lián)多泛素化作用和 TRIF 蛋白酶體的降解,以及與 TAB2/TAB3 溶酶體降解[67, 68]。人的巨細胞病毒(human cytomagalovirus,HCMV)基因產(chǎn)生的 UL144 通過激活 TRAF6 依賴的方式來激活 NF-κB。TRIM23和TRAF6的相互作用是UL144介導的NF-κB產(chǎn)生活性的必要條件,但是TRIM23不能通過TNF或者雙鏈RNA(dsRNA)來影響傳統(tǒng)的NF-κB信號通路[69]。TRIM62正向調(diào)節(jié) TLR4 信號通路中的 TRIF[70]。TRIM22 可以減少 TRAF6 的自我泛素化
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鱘細菌性敗血綜合征致病菌的初步研究[J]. 曹海鵬,楊先樂,高鵬,李怡,張書俊,鄧璐. 淡水漁業(yè). 2007(02)
[2]鱘魚病毒性疾病研究進展(英文)[J]. 華育平,王荻. Journal of Forestry Research. 2005(01)
博士論文
[1]魚類TRIM基因系統(tǒng)進化分析及免疫功能研究[D]. 張新尚.中國農(nóng)業(yè)科學院 2015
本文編號:3323593
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