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園藝植物心皮(室)數(shù)基因CLAVATA3生物信息學(xué)分析及遺傳評(píng)價(jià)

發(fā)布時(shí)間:2021-07-30 11:32
  心皮是被子植物特有的器官,是植物界進(jìn)化的產(chǎn)物,是子房的主要組成部分。CLAVATA3(CLV3)基因是調(diào)控植物心皮(室)數(shù)量的重要基因,對(duì)以果實(shí)為商品器官和觀賞用途的園藝植物具有重要意義。本研究利用生物信息學(xué)分析的方法對(duì)11個(gè)園藝植物的(CLV3)基因進(jìn)行信息檢索、系統(tǒng)發(fā)育分析、結(jié)構(gòu)比較等,為闡明CLV3基因在不同物種間的進(jìn)化關(guān)系奠定了基礎(chǔ)。多數(shù)研究認(rèn)為,植物心皮(室)是受顯隱性基因調(diào)控的。黃瓜作為我國(guó)大宗園藝植物,其果實(shí)既有重要的食用價(jià)值,同時(shí)不同的果實(shí)性狀、果皮顏色等極具觀賞價(jià)值。本研究選擇黃瓜作為構(gòu)建5心皮滲入系的材料,通過分子標(biāo)記輔助選擇的方法進(jìn)行多代回交,對(duì)CsCLAVATA3基因進(jìn)行遺傳評(píng)價(jià),為進(jìn)一步解析CsCLAVATA3基因調(diào)控黃瓜果實(shí)形狀及重量的多效性及其分子機(jī)理奠定基礎(chǔ)。本研究主要結(jié)果如下:1.根據(jù)檢索到的黃瓜、擬南芥、番茄、胡蘿卜、蘋果、甜橙、野草莓、碧桃、猴面花、洛杉磯耬斗菜、大花薔薇等11個(gè)物種的CLV3基因,對(duì)其進(jìn)行了信號(hào)肽預(yù)測(cè)、基因分子量、等電點(diǎn)等指標(biāo)的預(yù)測(cè),并將CLV3基因在各物種的染色體上進(jìn)行了定位。在檢索到的所有CLV3基因中,共有66個(gè)具有信號(hào)肽,... 

【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省

【文章頁數(shù)】:55 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

園藝植物心皮(室)數(shù)基因CLAVATA3生物信息學(xué)分析及遺傳評(píng)價(jià)


CLV3蛋白多序列比對(duì)圖

基序,蛋白


?⑻?橙具有信號(hào)肽的CLV3基因占比均超過60%,分別為69.2%,66.6%,63.6%。對(duì)各物種CLV3多肽基因家族的理化性質(zhì)預(yù)測(cè)分析,發(fā)現(xiàn)該家族氨基酸大小范圍在72~229之間,平均大小為102。這11個(gè)物種中,親水性最強(qiáng)的分別是黃瓜CsCLV3-5、擬南芥AtCLV3-12、番茄SlCLV3-1、胡蘿卜DcCLV3-11、蘋果MdCLV3-1、甜橙CisCLV3-11、野草莓FvCLV3-1、碧桃PpCLV3-1、猴面花MgCLV3-5、洛杉磯耬斗菜AcCLV3-1、大花薔薇CgCLV3-7。龍凌云[54]認(rèn)為,蛋白質(zhì)的親水性與疏水性是用于評(píng)判蛋白質(zhì)跨膜區(qū)域的重要依據(jù),但所有的疏水性區(qū)域不都為跨膜區(qū)域。圖2.3CLV3蛋白基序圖Figure2.3CLV3proteinmotif

剖面圖,親本,果實(shí),剖面圖


-28-圖3.1親本材料及果實(shí)剖面圖Figure3.1Parentmaterialandfruitsection3.1.1.2分子標(biāo)記篩選根據(jù)Yang等發(fā)表的黃瓜基因組連鎖遺傳圖譜的SSR標(biāo)記,結(jié)合TrueLemon,JC4和CCMC的基因組重測(cè)序數(shù)據(jù),運(yùn)用美國(guó)威斯康辛大學(xué)WengYiqun博士的In-SlicoPCR(http://cuke.vcru.wisc.edu/wenglab/updata/)分析平臺(tái)分別對(duì)TL和JC4、TL和CCMC的多態(tài)SSR進(jìn)行篩選,進(jìn)一步根據(jù)Yang等發(fā)表的黃瓜基因組連鎖遺傳圖譜[60]均勻地在7條染色體上挑選SSR標(biāo)記,委托南京鐘鼎生物技術(shù)公司合成并寄送至實(shí)驗(yàn)室。3.1.2試驗(yàn)方法3.1.2.1群體構(gòu)建過程分別以JC4和CCMC為受體親本(之后均作為輪回母本出現(xiàn)),TL為供體親本進(jìn)行雜交;次年,種植雜種F1代,并用兩個(gè)輪回親本做母本回交得到BC1F1種子。2016年9月,種植BC1F1群體,結(jié)合心皮數(shù)關(guān)聯(lián)標(biāo)記dCAPS1(D1)篩選雜合型植株,并經(jīng)MAS選擇,選出目標(biāo)單株繼續(xù)用JC4和CCMC回交,獲得BC2F1種子,選擇目標(biāo)單株

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[4]不同處理對(duì)‘巨峰’葡萄無核化及果實(shí)品質(zhì)的影響[J]. 劉金標(biāo),李洪艷,曹雄軍,時(shí)曉芳,張瑛,周詠梅,謝太理.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(12)
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博士論文
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[2]擬南芥STM、WUS和CLV3相互作用調(diào)控莖端分生組織干細(xì)胞活性的研究[D]. 周超.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015

碩士論文
[1]中國(guó)十字花科果實(shí)及種子形態(tài)學(xué)研究[D]. 曹董玲.哈爾濱師范大學(xué) 2015
[2]豆科3亞科5屬5種植物花發(fā)育形態(tài)學(xué)研究[D]. 周晶.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[3]模式植物CLE多肽基因家族的生物信息學(xué)分析與鑒定[D]. 張宇.天津大學(xué) 2015
[4]中國(guó)木蓮屬植物的觀賞性狀研究和觀賞價(jià)值評(píng)價(jià)[D]. 唐浩君.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]灰楊再生體系的建立和PcHMA3的克隆及生物信息學(xué)分析[D]. 龍凌云.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
[6]CLAVATA1-ECD與CpTI的克隆表達(dá)純化及初步功能的研究[D]. 李鋒.北京林業(yè)大學(xué) 2011
[7]薔薇科三種植物的比較解剖研究[D]. 張松梅.東北師范大學(xué) 2008
[8]毛茛科心皮多樣性及其系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 唐小華.陜西師范大學(xué) 2008
[9]擬南芥、薺菜心皮發(fā)育相關(guān)基因CRABS CLAW cDNA克隆及交互轉(zhuǎn)化[D]. 趙燕.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007



本文編號(hào):3311324

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