心皮是被子植物特有的器官,是植物界進化的產(chǎn)物,是子房的主要組成部分。CLAVATA3（CLV3）基因是調(diào)控植物心皮（室）數(shù)量的重要基因,對以果實為商品器官和觀賞用途的園藝植物具有重要意義。本研究利用生物信息學(xué)分析的方法對11個園藝植物的（CLV3）基因進行信息檢索、系統(tǒng)發(fā)育分析、結(jié)構(gòu)比較等,為闡明CLV3基因在不同物種間的進化關(guān)系奠定了基礎(chǔ)。多數(shù)研究認為,植物心皮（室）是受顯隱性基因調(diào)控的。黃瓜作為我國大宗園藝植物,其果實既有重要的食用價值,同時不同的果實性狀、果皮顏色等極具觀賞價值。本研究選擇黃瓜作為構(gòu)建5心皮滲入系的材料,通過分子標記輔助選擇的方法進行多代回交,對CsCLAVATA3基因進行遺傳評價,為進一步解析CsCLAVATA3基因調(diào)控黃瓜果實形狀及重量的多效性及其分子機理奠定基礎(chǔ)。本研究主要結(jié)果如下:1.根據(jù)檢索到的黃瓜、擬南芥、番茄、胡蘿卜、蘋果、甜橙、野草莓、碧桃、猴面花、洛杉磯耬斗菜、大花薔薇等11個物種的CLV3基因,對其進行了信號肽預(yù)測、基因分子量、等電點等指標的預(yù)測,并將CLV3基因在各物種的染色體上進行了定位。在檢索到的所有CLV3基因中,共有66個具有信號肽,... 

【文章來源】：山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省

【文章頁數(shù)】：55 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

CLV3蛋白多序列比對圖

?⑻?橙具有信號肽的CLV3基因占比均超過60%，分別為69.2%，66.6%，63.6%。對各物種CLV3多肽基因家族的理化性質(zhì)預(yù)測分析，發(fā)現(xiàn)該家族氨基酸大小范圍在72~229之間，平均大小為102。這11個物種中，親水性最強的分別是黃瓜CsCLV3-5、擬南芥AtCLV3-12、番茄SlCLV3-1、胡蘿卜DcCLV3-11、蘋果MdCLV3-1、甜橙CisCLV3-11、野草莓FvCLV3-1、碧桃PpCLV3-1、猴面花MgCLV3-5、洛杉磯耬斗菜AcCLV3-1、大花薔薇CgCLV3-7。龍凌云[54]認為，蛋白質(zhì)的親水性與疏水性是用于評判蛋白質(zhì)跨膜區(qū)域的重要依據(jù)，但所有的疏水性區(qū)域不都為跨膜區(qū)域。圖2.3CLV3蛋白基序圖Figure2.3CLV3proteinmotif

-28-圖3.1親本材料及果實剖面圖Figure3.1Parentmaterialandfruitsection3.1.1.2分子標記篩選根據(jù)Yang等發(fā)表的黃瓜基因組連鎖遺傳圖譜的SSR標記，結(jié)合TrueLemon，JC4和CCMC的基因組重測序數(shù)據(jù)，運用美國威斯康辛大學(xué)WengYiqun博士的In-SlicoPCR（http://cuke.vcru.wisc.edu/wenglab/updata/）分析平臺分別對TL和JC4、TL和CCMC的多態(tài)SSR進行篩選，進一步根據(jù)Yang等發(fā)表的黃瓜基因組連鎖遺傳圖譜[60]均勻地在7條染色體上挑選SSR標記，委托南京鐘鼎生物技術(shù)公司合成并寄送至實驗室。3.1.2試驗方法3.1.2.1群體構(gòu)建過程分別以JC4和CCMC為受體親本（之后均作為輪回母本出現(xiàn)），TL為供體親本進行雜交；次年，種植雜種F1代，并用兩個輪回親本做母本回交得到BC1F1種子。2016年9月，種植BC1F1群體，結(jié)合心皮數(shù)關(guān)聯(lián)標記dCAPS1（D1）篩選雜合型植株，并經(jīng)MAS選擇，選出目標單株繼續(xù)用JC4和CCMC回交，獲得BC2F1種子，選擇目標單株

【參考文獻】：
期刊論文
[1]葡萄全基因組WRKY轉(zhuǎn)錄因子鑒定和分析[J]. 蘇玲,王鵬飛,楊陽,任鳳山,王詠梅,陳萬鈞.  黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(01)
[2]小麥SBP基因家族生物信息學(xué)分析[J]. 呂亮杰,陳希勇,胡夢蕓,劉玉平,孫麗靜,馬樂,李輝.  華北農(nóng)學(xué)報. 2018(06)
[3]利用回交和標記輔助選擇快速培育高油酸花生品種及其評價[J]. 張照華,王志慧,淮東欣,譚家壯,陳劍洪,晏立英,王曉軍,萬麗云,陳傲,康彥平,姜慧芳,雷永,廖伯壽.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(09)
[4]不同處理對‘巨峰’葡萄無核化及果實品質(zhì)的影響[J]. 劉金標,李洪艷,曹雄軍,時曉芳,張瑛,周詠梅,謝太理.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(12)
[5]植物F3’H基因的序列與進化分析[J]. 胡利宗,張佳慧,王秋霞,李俐俐,王紅星.  東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(03)
[6]植物多肽信號分子CLE家族[J]. 高麗.  生物技術(shù)通報. 2014(11)
[7]黃瓜成熟瓜網(wǎng)紋基因H遺傳定位及候選基因分析[J]. 王敏,顧興芳,苗晗,劉書林,王燁,Todd C.Wehner,張圣平.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(08)
[8]不同低溫脅迫下野扁桃與栽培扁桃花原基解剖結(jié)構(gòu)觀察[J]. 鐘海霞,陸婷,劉立強,李疆,李古權(quán).  西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2013(12)
[9]弱光脅迫對不同基因型玉米雌雄花發(fā)育和授粉結(jié)實能力的影響[J]. 周衛(wèi)霞,王秀萍,穆心愿,李潮海.  作物學(xué)報. 2013(11)
[10]CLE多肽參與植物分生組織維持與分化平衡的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)研究[J]. 吳錦斌,宋銀,喬睿,強毅,王國棟.  生命科學(xué). 2013(04)

博士論文
[1]黃瓜種質(zhì)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析和黃瓜心皮數(shù)基因Cn的克隆[D]. 李森.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]擬南芥STM、WUS和CLV3相互作用調(diào)控莖端分生組織干細胞活性的研究[D]. 周超.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015

碩士論文
[1]中國十字花科果實及種子形態(tài)學(xué)研究[D]. 曹董玲.哈爾濱師范大學(xué) 2015
[2]豆科3亞科5屬5種植物花發(fā)育形態(tài)學(xué)研究[D]. 周晶.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[3]模式植物CLE多肽基因家族的生物信息學(xué)分析與鑒定[D]. 張宇.天津大學(xué) 2015
[4]中國木蓮屬植物的觀賞性狀研究和觀賞價值評價[D]. 唐浩君.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]灰楊再生體系的建立和PcHMA3的克隆及生物信息學(xué)分析[D]. 龍凌云.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
[6]CLAVATA1-ECD與CpTI的克隆表達純化及初步功能的研究[D]. 李鋒.北京林業(yè)大學(xué) 2011
[7]薔薇科三種植物的比較解剖研究[D]. 張松梅.東北師范大學(xué) 2008
[8]毛茛科心皮多樣性及其系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 唐小華.陜西師范大學(xué) 2008
[9]擬南芥、薺菜心皮發(fā)育相關(guān)基因CRABS CLAW cDNA克隆及交互轉(zhuǎn)化[D]. 趙燕.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007



本文編號：3311324