禾谷炭疽菌中氨基酸通透酶(GAP3)基因的功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-07-30 07:05
玉米是我國(guó)最主要糧食作物之一。近年來(lái),由于單一高產(chǎn)品種的大面積推廣,導(dǎo)致新老病害頻繁發(fā)生,其中以玉米炭疽病、大斑病、小斑病等葉部病害最為突出。由禾谷類(lèi)炭疽菌(Colletotrichum graminicola)引起的玉米炭疽病,在玉米的各種植區(qū)均有發(fā)生,該病害會(huì)造成葉片壞死,形成褐色化病斑,在灌漿期尤為嚴(yán)重。并且該病害的發(fā)生會(huì)阻礙玉米的光合同化作用,影響玉米的產(chǎn)量。禾谷炭疽菌(C.graminicola)在田間以新月形單孢單核的分生孢子為主要侵染源,其全基因組序列已經(jīng)釋放,而且易于接種和遺傳轉(zhuǎn)化,因此炭疽菌是繼稻瘟病菌之后的又一模式生物。研究炭疽菌致病機(jī)制有助解析玉米炭疽病發(fā)病的本質(zhì),為有效控制玉米炭疽等葉斑病提供理論支撐。氮是組成生物體的基本元素,適宜的氮源在微生物的生活史中起著極其重要的作用。本實(shí)驗(yàn)室前期已經(jīng)獲得一株ASADH突變株,該突變株是天冬氨酸家族中一種重要的酶類(lèi)-腺苷酸半縮脫氫酶,在生物體內(nèi)氨基酸的合成過(guò)程中扮演重要角色;在稻瘟病菌中,該基因缺失導(dǎo)致菌株對(duì)過(guò)氧化氫敏感,而且致病力降低,由于炭疽菌較稻瘟病菌具有更長(zhǎng)的活體侵染過(guò)程,當(dāng)病原菌在植物體內(nèi)不能合成氮源時(shí),是否能從...
【文章來(lái)源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
禾谷炭疽菌GAP3(GLRG_06384)基因序列與稻瘟菌GAP3(MGG_05170.6)GAP3基因序列比對(duì)結(jié)果
源對(duì)微生物來(lái)說(shuō)是必不可少的,當(dāng)生物體本身不能合成氨基酸時(shí)能否從外界吸收氨基酸呢?為了弄清這一問(wèn)題,我們找到一種氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)酶,經(jīng)過(guò)與稻瘟菌中的 GAP3,MGG_0517.6 基因比對(duì),在禾谷類(lèi)炭疽菌中找到了與它同源性高的一個(gè)基因(GLRG_06384),我們將其命名為 GLRG-GAP3.如圖 2.1 所示,把MGG-GAP3 與 GLRG-GAP3 用 DNAMAN 進(jìn)行序列比對(duì),結(jié)果發(fā)現(xiàn) MGG-GAP3與 GLRG-GAP3 的相似性為百分之 62.65%。2.3.2 稻瘟菌 GAP3 基因與禾谷炭疽菌 GAP3 基因氨基酸保守結(jié)構(gòu)域的預(yù)測(cè)與分析將GAP3基因的氨基酸序列在http://smart.embl-heidelberg.de/進(jìn)行功能預(yù)測(cè)分析,如圖 2.2 所示,結(jié)果發(fā)現(xiàn),GAP 的基因中存在跨膜結(jié)構(gòu)域(transmembraneregion),將 GAP3 的氨基酸的序列放入 NCBI Blast 進(jìn)行了蛋白的比對(duì)以后,發(fā)現(xiàn)該蛋白有在細(xì)胞膜上對(duì)氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)的功能。
MGG_05170.6:稻瘟菌 GAP3 蛋白,GLRG_06384:炭疽菌中 GAP3 蛋白。Fig2.2 The function domain of GAP in C.graminicola with GAP3 in M.grisaeMGG_05170.6:GAP3 protein in M.grisae;GLRG_06384:GAP3 protein inC.graminicola2.3.3 禾谷炭疽菌 GAP3 基因蛋白序列的同源性進(jìn)化分析將所得到的 GLRG_06384(GLRG-GAP3)中的蛋白序列在 NCBI 中進(jìn)行序列的比對(duì),找出同源性最高的八株菌株,將這些菌株在 Mega.7.0.9 中用ClustalW 工具進(jìn)行序列的比對(duì),再用 NJ 的方法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),結(jié)果發(fā)現(xiàn)與禾谷類(lèi)炭疽菌(Colletotrichum graminicola)中親緣關(guān)系最近的均為植物中的炭疽菌,GAP3 與疏紋刺孢菌親緣關(guān)系最近,與松針炭疽菌和茶炭疽菌的親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),如圖 2.3 所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)AAP1基因玉米游離氨基酸與可溶性蛋白質(zhì)含量變化關(guān)系的研究[J]. 李慧杰,齊家興,單冬冬,王羽,王爽,崔喜艷. 玉米科學(xué). 2017(01)
[2]羥自由基誘導(dǎo)蛋白質(zhì)氧化損傷的研究[J]. 章銀良,楊慧,安巧云. 食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2012(03)
[3]NO和H2O2在介導(dǎo)熱激誘發(fā)金絲桃細(xì)胞合成金絲桃素中的信號(hào)互作[J]. 徐茂軍,董菊芳,張新波. 中國(guó)科學(xué)(C輯:生命科學(xué)). 2008(07)
[4]逆境脅迫下植物活性氧代謝及外源調(diào)控機(jī)理的研究進(jìn)展[J]. 趙天宏,孫加偉,付宇. 作物雜志. 2008(03)
[5]水稻與基腐病菌互作中的活性氧代謝[J]. 劉瓊光,和蘭娣,張靜一,王玉濤,王振中. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(04)
[6]產(chǎn)胞外黑色素菌株的篩選[J]. 李建波,宋欣,曲音波. 微生物學(xué)通報(bào). 2004(01)
[7]植物病原真菌附著胞的機(jī)械穿透力[J]. 王洪凱,林福呈,王政逸. 菌物學(xué)報(bào). 2004(01)
[8]稻瘟病菌附著胞形成的細(xì)胞生物學(xué)[J]. 林福呈. 植物病理學(xué)報(bào). 2001(02)
[9]活性氧在植物抗病反應(yīng)中的作用(綜述)[J]. 傅愛(ài)根,羅廣華,王愛(ài)國(guó). 熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào). 2000(01)
碩士論文
[1]稻瘟菌天冬氨酸半縮脫氫酶基因(MoASADH)的生物功能鑒定[D]. 劉明宇.吉林大學(xué) 2015
本文編號(hào):3310950
【文章來(lái)源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
禾谷炭疽菌GAP3(GLRG_06384)基因序列與稻瘟菌GAP3(MGG_05170.6)GAP3基因序列比對(duì)結(jié)果
源對(duì)微生物來(lái)說(shuō)是必不可少的,當(dāng)生物體本身不能合成氨基酸時(shí)能否從外界吸收氨基酸呢?為了弄清這一問(wèn)題,我們找到一種氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)酶,經(jīng)過(guò)與稻瘟菌中的 GAP3,MGG_0517.6 基因比對(duì),在禾谷類(lèi)炭疽菌中找到了與它同源性高的一個(gè)基因(GLRG_06384),我們將其命名為 GLRG-GAP3.如圖 2.1 所示,把MGG-GAP3 與 GLRG-GAP3 用 DNAMAN 進(jìn)行序列比對(duì),結(jié)果發(fā)現(xiàn) MGG-GAP3與 GLRG-GAP3 的相似性為百分之 62.65%。2.3.2 稻瘟菌 GAP3 基因與禾谷炭疽菌 GAP3 基因氨基酸保守結(jié)構(gòu)域的預(yù)測(cè)與分析將GAP3基因的氨基酸序列在http://smart.embl-heidelberg.de/進(jìn)行功能預(yù)測(cè)分析,如圖 2.2 所示,結(jié)果發(fā)現(xiàn),GAP 的基因中存在跨膜結(jié)構(gòu)域(transmembraneregion),將 GAP3 的氨基酸的序列放入 NCBI Blast 進(jìn)行了蛋白的比對(duì)以后,發(fā)現(xiàn)該蛋白有在細(xì)胞膜上對(duì)氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)的功能。
MGG_05170.6:稻瘟菌 GAP3 蛋白,GLRG_06384:炭疽菌中 GAP3 蛋白。Fig2.2 The function domain of GAP in C.graminicola with GAP3 in M.grisaeMGG_05170.6:GAP3 protein in M.grisae;GLRG_06384:GAP3 protein inC.graminicola2.3.3 禾谷炭疽菌 GAP3 基因蛋白序列的同源性進(jìn)化分析將所得到的 GLRG_06384(GLRG-GAP3)中的蛋白序列在 NCBI 中進(jìn)行序列的比對(duì),找出同源性最高的八株菌株,將這些菌株在 Mega.7.0.9 中用ClustalW 工具進(jìn)行序列的比對(duì),再用 NJ 的方法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),結(jié)果發(fā)現(xiàn)與禾谷類(lèi)炭疽菌(Colletotrichum graminicola)中親緣關(guān)系最近的均為植物中的炭疽菌,GAP3 與疏紋刺孢菌親緣關(guān)系最近,與松針炭疽菌和茶炭疽菌的親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),如圖 2.3 所示。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)AAP1基因玉米游離氨基酸與可溶性蛋白質(zhì)含量變化關(guān)系的研究[J]. 李慧杰,齊家興,單冬冬,王羽,王爽,崔喜艷. 玉米科學(xué). 2017(01)
[2]羥自由基誘導(dǎo)蛋白質(zhì)氧化損傷的研究[J]. 章銀良,楊慧,安巧云. 食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2012(03)
[3]NO和H2O2在介導(dǎo)熱激誘發(fā)金絲桃細(xì)胞合成金絲桃素中的信號(hào)互作[J]. 徐茂軍,董菊芳,張新波. 中國(guó)科學(xué)(C輯:生命科學(xué)). 2008(07)
[4]逆境脅迫下植物活性氧代謝及外源調(diào)控機(jī)理的研究進(jìn)展[J]. 趙天宏,孫加偉,付宇. 作物雜志. 2008(03)
[5]水稻與基腐病菌互作中的活性氧代謝[J]. 劉瓊光,和蘭娣,張靜一,王玉濤,王振中. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2007(04)
[6]產(chǎn)胞外黑色素菌株的篩選[J]. 李建波,宋欣,曲音波. 微生物學(xué)通報(bào). 2004(01)
[7]植物病原真菌附著胞的機(jī)械穿透力[J]. 王洪凱,林福呈,王政逸. 菌物學(xué)報(bào). 2004(01)
[8]稻瘟病菌附著胞形成的細(xì)胞生物學(xué)[J]. 林福呈. 植物病理學(xué)報(bào). 2001(02)
[9]活性氧在植物抗病反應(yīng)中的作用(綜述)[J]. 傅愛(ài)根,羅廣華,王愛(ài)國(guó). 熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào). 2000(01)
碩士論文
[1]稻瘟菌天冬氨酸半縮脫氫酶基因(MoASADH)的生物功能鑒定[D]. 劉明宇.吉林大學(xué) 2015
本文編號(hào):3310950
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