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玉米EREBP-like轉(zhuǎn)錄因子基因ZmELF的序列變異分析

發(fā)布時間:2021-07-26 20:42
  玉米ZmELF基因編碼一個EREBP-like轉(zhuǎn)錄因子,含有一個AP2結(jié)構(gòu)域,屬于轉(zhuǎn)錄因子AP2/EREBP家族,對干旱響應(yīng)明顯。本研究對103份供試自交系的ZmELF基因進行目標(biāo)序列捕獲并測序,獲得了1 789bp的全長序列。核苷酸多態(tài)性分析發(fā)現(xiàn)43個變異位點,包括42個SNPs和1個Indel。對ZmELF基因進行中性檢驗分析,表明該基因沒有明顯的人工選擇痕跡。該基因的編碼區(qū)共有7個變異位點,均為SNP,4個為同義位點,其余3個為非同義位點,蛋白質(zhì)序列按非同義位點分為4種類型。 

【文章來源】:青島農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,37(04)

【文章頁數(shù)】:6 頁

【部分圖文】:

玉米EREBP-like轉(zhuǎn)錄因子基因ZmELF的序列變異分析


ZmELF基因序列核苷酸多樣性

自交,單倍型,玉米,基因


在編碼區(qū)有7個SNPs,4個為同義位點,其他3個為非同義位點。非同義位點將導(dǎo)致蛋白質(zhì)序列的變化。將7種編碼區(qū)單倍型的核苷酸序列轉(zhuǎn)為氨基酸序列發(fā)現(xiàn),103個玉米自交系中的ZmHM1基因共編碼了4種蛋白質(zhì)序列(圖4),蛋白質(zhì)全長為276aa。圖3 供試玉米自交系中ZmELF基因編碼區(qū)單倍型分布

自交,玉米,單倍型,基因


供試玉米自交系中ZmELF基因編碼區(qū)單倍型分布

【參考文獻】:
期刊論文
[1]玉米ZmLBD7基因的序列變異分析[J]. 滕青,尹雙義.  科技風(fēng). 2019(16)



本文編號:3304335

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