玉米EREBP-like轉(zhuǎn)錄因子基因ZmELF的序列變異分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-26 20:42
玉米ZmELF基因編碼一個(gè)EREBP-like轉(zhuǎn)錄因子,含有一個(gè)AP2結(jié)構(gòu)域,屬于轉(zhuǎn)錄因子AP2/EREBP家族,對(duì)干旱響應(yīng)明顯。本研究對(duì)103份供試自交系的ZmELF基因進(jìn)行目標(biāo)序列捕獲并測(cè)序,獲得了1 789bp的全長(zhǎng)序列。核苷酸多態(tài)性分析發(fā)現(xiàn)43個(gè)變異位點(diǎn),包括42個(gè)SNPs和1個(gè)Indel。對(duì)ZmELF基因進(jìn)行中性檢驗(yàn)分析,表明該基因沒(méi)有明顯的人工選擇痕跡。該基因的編碼區(qū)共有7個(gè)變異位點(diǎn),均為SNP,4個(gè)為同義位點(diǎn),其余3個(gè)為非同義位點(diǎn),蛋白質(zhì)序列按非同義位點(diǎn)分為4種類(lèi)型。
【文章來(lái)源】:青島農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,37(04)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
ZmELF基因序列核苷酸多樣性
在編碼區(qū)有7個(gè)SNPs,4個(gè)為同義位點(diǎn),其他3個(gè)為非同義位點(diǎn)。非同義位點(diǎn)將導(dǎo)致蛋白質(zhì)序列的變化。將7種編碼區(qū)單倍型的核苷酸序列轉(zhuǎn)為氨基酸序列發(fā)現(xiàn),103個(gè)玉米自交系中的ZmHM1基因共編碼了4種蛋白質(zhì)序列(圖4),蛋白質(zhì)全長(zhǎng)為276aa。圖3 供試玉米自交系中ZmELF基因編碼區(qū)單倍型分布
供試玉米自交系中ZmELF基因編碼區(qū)單倍型分布
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米ZmLBD7基因的序列變異分析[J]. 滕青,尹雙義. 科技風(fēng). 2019(16)
本文編號(hào):3304335
【文章來(lái)源】:青島農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,37(04)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
ZmELF基因序列核苷酸多樣性
在編碼區(qū)有7個(gè)SNPs,4個(gè)為同義位點(diǎn),其他3個(gè)為非同義位點(diǎn)。非同義位點(diǎn)將導(dǎo)致蛋白質(zhì)序列的變化。將7種編碼區(qū)單倍型的核苷酸序列轉(zhuǎn)為氨基酸序列發(fā)現(xiàn),103個(gè)玉米自交系中的ZmHM1基因共編碼了4種蛋白質(zhì)序列(圖4),蛋白質(zhì)全長(zhǎng)為276aa。圖3 供試玉米自交系中ZmELF基因編碼區(qū)單倍型分布
供試玉米自交系中ZmELF基因編碼區(qū)單倍型分布
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米ZmLBD7基因的序列變異分析[J]. 滕青,尹雙義. 科技風(fēng). 2019(16)
本文編號(hào):3304335
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