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BSA·QTL-seq分離控制青稞藍粒性狀的可能性候選基因HvMYC1和HvMYB1

發(fā)布時間:2021-07-24 23:21
  青稞又稱裸大麥,屬于禾本科大麥屬。有色青稞含有高水平的營養(yǎng)成分,如花青素、酚類化合物、蛋白質(zhì)和微量元素。藍粒青稞作為有色青稞的一類,是由花青素大量沉積于青稞糊粉層所形成的。本研究主要實驗結(jié)果如下:1.采用BSA·QTL-seq方法對青稞藍;蚪M進行了高通量測序,確定兩類共7452819個SNP以及其在7條染色體上的分布情況,得到一個明顯的QTL區(qū)并在該區(qū)域內(nèi)預(yù)測基因853個,其中MYB和bHLH相關(guān)基因各5個。QTL區(qū)域的4個MYB基因與擬南芥中的MYB基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,發(fā)現(xiàn)其中只有一個候選基因HvMYB1與調(diào)控花青素合成的MYB基因聚為一類。同樣發(fā)現(xiàn)在候選基因區(qū)段中只有一個MYC候選基因HvMYC1與MYC基因聚為一類。這暗示了它們可能為控制藍粒性狀的候選基因,經(jīng)過比對與先前的轉(zhuǎn)錄組測序研究結(jié)果一致。而且候選基因HvMYC1與HvMYB1的QTL分析結(jié)果在與藍粒小麥性狀相關(guān)的QTL巔峰區(qū)域525.9-541.7Mb之內(nèi),更加說明這兩個基因極有可能為控制藍粒性狀的主效基因。2.分別對候選基因HvMYC1與HvMYB1進行序列結(jié)構(gòu)分析,發(fā)現(xiàn)HvMYC1基因全長1668bp,編碼555... 

【文章來源】:青海師范大學(xué)青海省

【文章頁數(shù)】:59 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

BSA·QTL-seq分離控制青稞藍粒性狀的可能性候選基因HvMYC1和HvMYB1


花青素生物合成途徑Figureure1-1biosyntheticpathwayofanthocyanins

花青素,轉(zhuǎn)錄因子,調(diào)控結(jié)構(gòu),共基


Figureure 1-1 biosynthetic pathway of anthocyan合成受結(jié)構(gòu)基因和轉(zhuǎn)錄因子的共同控制,其中結(jié)形成相應(yīng)的合成途徑;轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控結(jié)構(gòu)基因的素的合成。目前已知花青素合成涉及三種主要子,bHLH 轉(zhuǎn)錄因子和 WD40 轉(zhuǎn)錄因子,它們共基因的啟動子來發(fā)揮作用。

青稞,藍粒,實驗材料,昆侖


A B圖 3-1 實驗材料藍粒青稞‘肚里黃’(A)和白粒青稞‘昆侖 1-1 Experimental material blue highland barley ‘Yellow belly’ (A)barley ‘Kunlun10’ (B)要實驗試劑及儀器表 3-1 主要實驗試劑Table 3-1 Main experimental reagents供應(yīng)商NAprep 純植物試劑盒 Tiangen 公司idi Purification Kit 膠回收試劑盒 天根生化科技有First Strand cDNA Synthesis KitThermo Scientif

【參考文獻】:
期刊論文
[1]甘蔗花青素轉(zhuǎn)錄因子基因ScRS克隆與基因槍轉(zhuǎn)化研究[J]. 劉迪,施桂姣,肖乃衍,Khalil Farghama,許躍語,陳平華,張卓,王恒波,高三基,許莉萍,張華.  熱帶作物學(xué)報. 2017(07)
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[5]利用BSA法檢測水稻條紋葉枯病高效應(yīng)抗性位點[J]. 張云輝,張所兵,林靜,汪迎節(jié),方先文.  華北農(nóng)學(xué)報. 2014(02)
[6]玉米R2R3型MYB轉(zhuǎn)錄因子家族生物學(xué)功能綜述[J]. 戴毅,高瑩瑩,黃澤峰,陳云,高勇.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(03)
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博士論文
[1]甘藍類蔬菜抗根腫病基因定位、克隆及抗感材料比較轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 張小麗.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
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[3]ABA介導(dǎo)的PacMYBA調(diào)控紅肉甜櫻桃果實花色苷合成的研究[D]. 沈欣杰.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
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[5]類黃酮調(diào)控基因AtMYB12的異源表達及其對植物抗病性的貢獻[D]. 李明.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012

碩士論文
[1]青稞藍粒性狀的遺傳分析及主效基因分離[D]. 趙鑫.青海師范大學(xué) 2018
[2]玉米雄穗穗頸長QTL初步定位[D]. 李曉娜.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]水稻苗期耐旱性基因位點的發(fā)掘[D]. 姜雪.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]棉花bHLH蛋白基因的克隆、表達及生物信息學(xué)分析[D]. 劉厚生.西南大學(xué) 2014
[5]擬南芥干旱誘導(dǎo)型啟動子的克隆及功能分析[D]. 吳憲.吉林大學(xué) 2013



本文編號:3301635

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