四氫嘧啶（Ectoine）是由細(xì)菌產(chǎn)生的一種次級(jí)代謝產(chǎn)物,賦予細(xì)菌抵御高滲透壓環(huán)境的一種相容性溶質(zhì)。研究顯示許多細(xì)菌具有四氫嘧啶基因簇（ect ABCD-ask）,然而關(guān)于該基因簇在假單胞菌屬（Pseudomonas）中的分布還沒(méi)有系統(tǒng)報(bào)道。鑒于此,以公共數(shù)據(jù)庫(kù)中已測(cè)序的9 548株假單胞菌屬菌株全基因組序列為數(shù)據(jù),采用深度生物信息學(xué)分析方法探究假單胞菌中的四氫嘧啶基因簇分布及其組成共線性特征。結(jié)果顯示165株假單胞菌攜帶有四氫嘧啶基因簇,占假單胞菌株總數(shù)的1.78%,歸屬于32個(gè)不同的種,超過(guò)一半的菌株屬于施氏假單胞菌（P.stutzeri）;同一種內(nèi)菌株間,ect ABCD-ask及其側(cè)翼基因高度保守,共線性水平程度高。系統(tǒng)地揭示了假單胞菌基因組中四氫嘧啶基因簇分布規(guī)律,將為開(kāi)展生物合成四氫嘧啶提供重要菌種資源信息。 

【文章來(lái)源】：科技與創(chuàng)新. 2020,(12)

【文章頁(yè)數(shù)】：3 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 物信息學(xué)平臺(tái)
    1.2 假單胞菌基因組序列批量獲取
    1.3 四氫嘧啶基因簇分布分析
    1.4 四氫嘧啶基因簇側(cè)翼序列比較
2 結(jié)果與分析
    2.1 四氫嘧啶合成酶基因簇在假單胞菌屬菌株中的分布
    2.2 四氫嘧啶基因簇及其側(cè)翼序列共線性
3 結(jié)束語(yǔ)


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]抗銅綠假單胞菌感染治療方法研究進(jìn)展[J]. 丁燁,戴璐,俞娟.  中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2020(06)
[2]四氫嘧啶類抗寄生蟲(chóng)藥在獸醫(yī)臨床上的應(yīng)用[J]. 劉偉.  畜牧獸醫(yī)科技信息. 2018(10)
[3]施氏假單胞菌四氫嘧啶/羥基四氫嘧啶合成基因簇進(jìn)化分析[J]. 李向陽(yáng),張國(guó)輝,湯宏.  凱里學(xué)院學(xué)報(bào). 2015(06)

博士論文
[1]甜椒根際合成抗生素假單胞菌遺傳多樣性分析及GP72菌株生防機(jī)制研究[D]. 劉海明.上海交通大學(xué) 2007

碩士論文
[1]甘蔗根際假單胞菌的分離鑒定及其對(duì)甘蔗的促生作用[D]. 李海碧.廣西大學(xué) 2017
[2]吉蘭泰鹽湖土壤中嗜鹽堿放線菌的分離鑒定及四氫嘧啶工程菌株的構(gòu)建[D]. 高波.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[3]四氫嘧啶合成工程菌株構(gòu)建[D]. 徐蕊.大連海事大學(xué) 2012



本文編號(hào)：3295523