目的從基因網(wǎng)絡(luò)的層面挖掘出與乳腺癌發(fā)生發(fā)展過程相關(guān)的關(guān)鍵模塊及Hub基因,并且驗(yàn)證這些Hub基因是否具有乳腺癌特異性。方法使用加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析法（weighted gene co-expression network analysis,WGCNA）篩選出與乳腺癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)的關(guān)鍵模塊,用基因本體論數(shù)據(jù)庫及京都基因和基因組數(shù)據(jù)庫（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）對模塊功能進(jìn)行富集,進(jìn)一步挖掘出與乳腺癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)性最高的Hub基因。同時(shí)分析腫瘤合集中發(fā)生發(fā)展的Hub基因。結(jié)果 WGCNA一共定義了10個共表達(dá)模塊,其中藍(lán)色模塊為與乳腺癌及其他惡性腫瘤發(fā)生發(fā)展相關(guān)的關(guān)鍵模塊,該模塊的基因在細(xì)胞周期（KEGG ID:cfa04110）和病毒致癌通路（KEGG ID:hsa05203）、癌癥通路（KEGG ID:hsa05200）和系統(tǒng)性紅斑狼瘡（KEGG ID:hsa05322）等通路中顯著富集。最終從藍(lán)色模塊中挖掘出與乳腺癌發(fā)生發(fā)展最為相關(guān)的8個Hub基因,包括NUSAP1、FOXM1、KIF20A、BIRC5、TOP2A、R... 

【文章來源】：華西醫(yī)學(xué). 2020,35(09)

【文章頁數(shù)】：8 頁

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基因芯片表達(dá)譜數(shù)據(jù)的預(yù)處理分析[J]. 吳斌,沈自尹.  中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2006(04)



本文編號：3293492