近些年以來(lái),癌癥的發(fā)病率越來(lái)越高。肺癌是最常見(jiàn)的癌癥類(lèi)型,也是導(dǎo)致身亡的主要癌癥類(lèi)型之一。而非小細(xì)胞肺癌（NSCLC）是所有肺癌類(lèi)型中最為重要的一種。以往的研究發(fā)現(xiàn),肺癌主要是由于基因組變異的累積引起的。其中,KRAS基因是目前最常見(jiàn)的一種由于基因編碼突變導(dǎo)致肺癌的重要基因。單核苷酸多態(tài)性（SNPs）是一種基因變異,主要指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。單核苷酸多態(tài)性（SNPs）是一種很常見(jiàn)的人類(lèi)可遺傳變異,在人類(lèi)基因組中廣泛存在。整個(gè)人類(lèi)基因組中每200-300bp就會(huì)有一個(gè)SNP變異,占所有已知多態(tài)性的80%以上。在多種SNPs突變類(lèi)型中,發(fā)生在外顯子區(qū)域的非同義替換（nsSNPs）會(huì)引起轉(zhuǎn)錄或翻譯的機(jī)制改變,導(dǎo)致蛋白質(zhì)二級(jí)序列改變,從而影響蛋白質(zhì)的正常基因調(diào)控和原始功能。所以,nsSNPs會(huì)導(dǎo)致多種類(lèi)型的疾病,是非常有害的單核苷酸變異。在以往的研究看來(lái),實(shí)驗(yàn)是無(wú)法在分子機(jī)制上探究突變是如何對(duì)KRAS基因和蛋白質(zhì)產(chǎn)生影響的。本課題通過(guò)計(jì)算篩選和分子動(dòng)力學(xué)方法研究了KRAS基因中與肺癌相關(guān)的nsSNPs突變,解決了上述這一問(wèn)題。我們使用經(jīng)過(guò)高度訓(xùn)練和優(yōu)化的計(jì)... 

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

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各種癌癥發(fā)病率和死亡率的百分比[3]

上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文3三重要癌癥類(lèi)型。就死亡的人數(shù)來(lái)說(shuō)，肝癌、胃癌是除了肺癌之外，死亡人數(shù)最多的另外兩種癌癥。在女性的惡性腫瘤中，患病與死亡人數(shù)最多的是乳腺癌這種惡性腫瘤，結(jié)直腸癌和肺癌是患病和死亡人數(shù)排名第二的癌癥類(lèi)型。排名第四的是患宮頸癌，其患病人數(shù)和因它死亡的人數(shù)見(jiàn)圖1-2。在中國(guó)的所有惡性腫瘤中，患肺癌和因此去世的人數(shù)也是最多的，在剛過(guò)去的幾年里，患肺癌的數(shù)量越來(lái)越多，逐年增長(zhǎng)，極大的威脅著人類(lèi)的健康。所以惡性腫瘤的研究是醫(yī)學(xué)及科研人員需要攻克的一個(gè)重大難題，也是受到關(guān)注的重點(diǎn)方向。然而就目前的階段而言，各種癌癥的發(fā)病原因、治療程序等尚不清楚，因此，對(duì)惡性腫瘤的研究顯得非常有必要的，且迫在眉睫。特別是患病和死亡人數(shù)排名第一的肺癌。圖1-1各種癌癥發(fā)病率和死亡率的百分比[3]Fig.1-1Percentageofmorbidityandmortalityofvariouscancers圖1-2全世界所有年齡段的男性、女性癌癥發(fā)病率和死亡人數(shù)估計(jì)[3]Fig.1-2EstimatesofcancerincidenceandmortalityinmenandwomenofallagesworldwideTotal:9555027Total:18078957

上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文8圖1-3Ras的信號(hào)通路圖[10]Fig.1-3TheRassignallingpathway1.4單核苷酸多態(tài)性（SNP）1.4.1SNP含義和特點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性(SNPs)是在生物體的基因組中存在的一種可以被遺傳的重要突變[24]，90％以上的遺傳多態(tài)性都屬于單核苷酸多態(tài)性。SNP通常發(fā)生在同類(lèi)生物不同個(gè)體之間的同一個(gè)等位DNA序列上，是指由于一個(gè)核苷酸的插入、缺失或被替代變成其它核苷酸，進(jìn)而造成差異的現(xiàn)象[25,26]。在人類(lèi)中的整個(gè)基因組中每200-300bp就會(huì)有一個(gè)SNP變異[27]。在人類(lèi)中SNP存在一定的頻率（>1%）[28]，所以人類(lèi)的基因組才會(huì)出現(xiàn)多樣性。有一些SNP被稱(chēng)為是功能性的，這些SNP突變會(huì)導(dǎo)致其編碼表達(dá)的蛋白質(zhì)功能發(fā)生變化。在多種突變類(lèi)型中，發(fā)生在外顯子區(qū)域突變的非同義替換(nsSNP)會(huì)使轉(zhuǎn)錄或翻譯的機(jī)制改變，導(dǎo)致蛋白質(zhì)二級(jí)序列改變，從而影響蛋白質(zhì)的正�；蛘{(diào)控或自然功能，進(jìn)而引起有機(jī)體的許多疾


本文編號(hào)：3289105