組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶KMT2D調(diào)控心肌細(xì)胞中HIF-1α下游基因轉(zhuǎn)錄的研究
發(fā)布時間:2021-07-09 06:05
背景:組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶Histone-lysine N-methyltransferase 2D(KMT2D)是主要的組蛋白3第4位賴氨酸(Histone 3 lysine4,H3K4)甲基轉(zhuǎn)移酶,在組織中廣泛表達(dá),并且在調(diào)控胚胎發(fā)育、分化和代謝過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。H3K4的甲基化(methylation)作為組蛋白修飾的一種類型,通過結(jié)合在基因的增強子與啟動子區(qū)域激活基因轉(zhuǎn)錄。前期研究報道在小鼠胚胎期敲除Kmt2d基因會導(dǎo)致小鼠心臟發(fā)育不全而死亡。我們團隊的研究發(fā)現(xiàn),在成年小鼠心臟中特異性敲除Kmt2d,進行心梗手術(shù)后梗死面積與對照組相比明顯增加,血管再生能力下降。低氧誘導(dǎo)因子-1α(Hypoxia-inducible factor 1,HIF-1α)是調(diào)控細(xì)胞應(yīng)對低氧狀態(tài)的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,在心肌缺血缺氧條件下,HIF-1α表達(dá)上調(diào),從而調(diào)節(jié)下游相關(guān)基因的表達(dá),以減少心肌受損。此外,HIF-1α調(diào)控其下游基因表達(dá)存在一定的選擇性,即在不同生理病理條件下對基因有不同程度的調(diào)控。有研究表明,表觀遺傳修飾在基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控過程中發(fā)揮重要作用,包括組蛋白甲基化、乙;葘IF-1α的穩(wěn)定性和轉(zhuǎn)...
【文章來源】:南京中醫(yī)藥大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1心肌缺血24?h后,mllW組和mll4-cKO組小鼠心肌組織染色??
?第二部分實驗結(jié)果???平,并且觀察蛋白表達(dá)水平與低氧時間點的關(guān)系。因這些蛋白都表達(dá)在細(xì)胞核內(nèi),提取核??蛋白,。保?|。邕M行Western?blotting檢測。KMT2D蛋白分子量較大,經(jīng)過探索采取濃度??為6%的分離膠進行電泳,KMT2D抗體目前市面上未銷售,有戈凱教授實驗室贈送。首先??對其抗體特異性進行檢測,結(jié)果(圖1-3)顯示,KMT2D抗體可用于后續(xù)實驗。結(jié)果如(圖??1-4)所示:組蛋白HistoneH3作為細(xì)胞核內(nèi)參蛋白,在不同時間點表達(dá)量一致;與常氧組??(Oh)相比,HIF-la在低氧處理后蛋白量積累,低氧4h時蛋白積累量升高,8h后蛋白積??累量達(dá)到最多,16h蛋白水平積累下降(圖1-4A);?P300作為HIF-1轉(zhuǎn)錄輔助激活劑,我??們觀察到P300的蛋白水平在4?h和8?h表達(dá)明顯升高(圖1-4B)。低氧處理后KMT2D的??蛋白水平隨著低氧時間的增加,表達(dá)量明顯上調(diào)(圖1-4C);其催化的H3K4mel的蛋白水??平在低氧16?h明顯增加(圖1-4D)。??Hypoxia?0?4?8?16?24?(h)??——460KD??圖1-3?KMT2D抗體特異性檢測??Western?blotting檢測KMT2D抗體特異性,整張膜孵ft抗體,觀察足否有丨丨;特性結(jié)介。H??的蛋白分子量約為593KD,大分子量蛋白marker(LC5699)最上端條帶460KD作為指示標(biāo)志。??22??
?第二部分實驗結(jié)果???錄水平。??2.1總RNA的完整性鑒定??提取細(xì)胞的總RNA,對其進行完整性檢測,同一批提取的6個樣本,通過1.5%瓊脂??糖凝膠電泳觀察到28s條帶的亮度約為18s的2倍,5s條帶最弱(圖2-1?),證明提取的RNA??質(zhì)控合格,可繼續(xù)下一步實驗。??Hypoxia?0?4?8?16?24?24?(h)??kh?,/?一、二,??■■■■??^H5s??圖2-1?RNA的完整性檢測結(jié)果??2.2實時熒光定量PCR檢測Fegf和5?/>3的mRNA表達(dá)水平??檢測HIF-loc下游基因的轉(zhuǎn)錄活性,本實驗采用qRT-PCR技術(shù)檢測HIF-la的下游基因??的mRNA表達(dá)水平。因為在低氧應(yīng)激狀態(tài)下,機體能調(diào)動一系列與血管生成、糖代謝、細(xì)??胞凋亡等生理病理過程相關(guān)基因表達(dá),本實驗對心肌梗死損傷修復(fù)過程中,促進血管生成??過程發(fā)揮重要作用的血管內(nèi)皮生長因子VEGF以及細(xì)胞凋亡過程中的關(guān)鍵因子BNIP3進??行檢測。結(jié)果如圖2-2所示,低氧處理不同時間后,設(shè)#的mRNA表達(dá)水平在低氧4?h后??顯著上調(diào)且隨著低氧時間的延長有逐步上升的趨勢(圖2-2A);?的mRNA水平在低??氧處理后有明顯升高,且在16h表達(dá)量最高(圖2-2B)。??24??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]表觀遺傳學(xué)研究進展[J]. 丁勇,許超,吳季輝,施蘊渝,臧建業(yè),蔡剛. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2017(01)
[2]組蛋白賴氨酸特異性去甲基化酶1抑制劑的研究進展[J]. 吳麗明,鄒芳霞,席佳越,周金培,查曉明. 藥學(xué)進展. 2016(07)
[3]低氧誘導(dǎo)因子-1與缺血性心肌損傷保護的研究進展[J]. 丁然然,哈艷平,王振良,雷洪,申志華,郭峻莉,揭偉. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報. 2015(10)
[4]表觀遺傳學(xué)及其與疾病相關(guān)性[J]. 李文,邊育紅,褚曉倩. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報. 2013(02)
本文編號:3273186
【文章來源】:南京中醫(yī)藥大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1心肌缺血24?h后,mllW組和mll4-cKO組小鼠心肌組織染色??
?第二部分實驗結(jié)果???平,并且觀察蛋白表達(dá)水平與低氧時間點的關(guān)系。因這些蛋白都表達(dá)在細(xì)胞核內(nèi),提取核??蛋白,。保?|。邕M行Western?blotting檢測。KMT2D蛋白分子量較大,經(jīng)過探索采取濃度??為6%的分離膠進行電泳,KMT2D抗體目前市面上未銷售,有戈凱教授實驗室贈送。首先??對其抗體特異性進行檢測,結(jié)果(圖1-3)顯示,KMT2D抗體可用于后續(xù)實驗。結(jié)果如(圖??1-4)所示:組蛋白HistoneH3作為細(xì)胞核內(nèi)參蛋白,在不同時間點表達(dá)量一致;與常氧組??(Oh)相比,HIF-la在低氧處理后蛋白量積累,低氧4h時蛋白積累量升高,8h后蛋白積??累量達(dá)到最多,16h蛋白水平積累下降(圖1-4A);?P300作為HIF-1轉(zhuǎn)錄輔助激活劑,我??們觀察到P300的蛋白水平在4?h和8?h表達(dá)明顯升高(圖1-4B)。低氧處理后KMT2D的??蛋白水平隨著低氧時間的增加,表達(dá)量明顯上調(diào)(圖1-4C);其催化的H3K4mel的蛋白水??平在低氧16?h明顯增加(圖1-4D)。??Hypoxia?0?4?8?16?24?(h)??——460KD??圖1-3?KMT2D抗體特異性檢測??Western?blotting檢測KMT2D抗體特異性,整張膜孵ft抗體,觀察足否有丨丨;特性結(jié)介。H??的蛋白分子量約為593KD,大分子量蛋白marker(LC5699)最上端條帶460KD作為指示標(biāo)志。??22??
?第二部分實驗結(jié)果???錄水平。??2.1總RNA的完整性鑒定??提取細(xì)胞的總RNA,對其進行完整性檢測,同一批提取的6個樣本,通過1.5%瓊脂??糖凝膠電泳觀察到28s條帶的亮度約為18s的2倍,5s條帶最弱(圖2-1?),證明提取的RNA??質(zhì)控合格,可繼續(xù)下一步實驗。??Hypoxia?0?4?8?16?24?24?(h)??kh?,/?一、二,??■■■■??^H5s??圖2-1?RNA的完整性檢測結(jié)果??2.2實時熒光定量PCR檢測Fegf和5?/>3的mRNA表達(dá)水平??檢測HIF-loc下游基因的轉(zhuǎn)錄活性,本實驗采用qRT-PCR技術(shù)檢測HIF-la的下游基因??的mRNA表達(dá)水平。因為在低氧應(yīng)激狀態(tài)下,機體能調(diào)動一系列與血管生成、糖代謝、細(xì)??胞凋亡等生理病理過程相關(guān)基因表達(dá),本實驗對心肌梗死損傷修復(fù)過程中,促進血管生成??過程發(fā)揮重要作用的血管內(nèi)皮生長因子VEGF以及細(xì)胞凋亡過程中的關(guān)鍵因子BNIP3進??行檢測。結(jié)果如圖2-2所示,低氧處理不同時間后,設(shè)#的mRNA表達(dá)水平在低氧4?h后??顯著上調(diào)且隨著低氧時間的延長有逐步上升的趨勢(圖2-2A);?的mRNA水平在低??氧處理后有明顯升高,且在16h表達(dá)量最高(圖2-2B)。??24??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]表觀遺傳學(xué)研究進展[J]. 丁勇,許超,吳季輝,施蘊渝,臧建業(yè),蔡剛. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2017(01)
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[3]低氧誘導(dǎo)因子-1與缺血性心肌損傷保護的研究進展[J]. 丁然然,哈艷平,王振良,雷洪,申志華,郭峻莉,揭偉. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報. 2015(10)
[4]表觀遺傳學(xué)及其與疾病相關(guān)性[J]. 李文,邊育紅,褚曉倩. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報. 2013(02)
本文編號:3273186
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