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二倍體薯塊礦質(zhì)元素含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析及HAK/KUP/KT基因家族的功能解析

發(fā)布時(shí)間:2021-07-01 17:57
  植物源食物為人類(lèi)和動(dòng)物提供了廣泛的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),而礦質(zhì)營(yíng)養(yǎng)是其中極為重要的組成部分。馬鈴薯作為世界上種植最廣泛的糧食作物之一,塊莖富含多種礦質(zhì)元素,而提高和改善馬鈴薯塊莖礦質(zhì)元素含量與組成具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值和社會(huì)效應(yīng)。中國(guó)作為馬鈴薯消費(fèi)和種植大國(guó),近些年在逐步推動(dòng)馬鈴薯主糧化和主食化戰(zhàn)略。栽培種馬鈴薯多為同源四倍體,基因組高度雜合,遺傳復(fù)雜且研究難度大,同時(shí)也限制了礦質(zhì)元素在遺傳和分子生物學(xué)上的廣泛研究。所以本課題選取了二倍體馬鈴薯自然變異群體作為材料,對(duì)馬鈴薯塊莖中的礦質(zhì)元素進(jìn)行了分析和探索,并利用全基因組關(guān)聯(lián)分析對(duì)影響各類(lèi)礦質(zhì)元素含量的染色體位點(diǎn)進(jìn)行了初步分析。另外,本文以馬鈴薯HAK/KUP/KT基因家族為例,初步解析了HAK/KUP/KT基因家族在影響塊莖中鉀離子含量中的功能。本文的結(jié)果將為提高馬鈴薯塊莖中的礦質(zhì)元素含量和研究馬鈴薯HAK/KUP/KT基因家族的功能提供理論基礎(chǔ)和技術(shù)指導(dǎo)。本文的主要研究結(jié)果如下:1)2018年,自然分離群體的馬鈴薯薯肉中鐵離子含量在窄刀薯、角萼薯和富利亞薯這3種類(lèi)群中呈連續(xù)分布,2019年在這3種類(lèi)群中均具有分離,大體可分為高鐵和低鐵兩種模式。20... 

【文章來(lái)源】:云南師范大學(xué)云南省

【文章頁(yè)數(shù)】:77 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

二倍體薯塊礦質(zhì)元素含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析及HAK/KUP/KT基因家族的功能解析


技術(shù)路線圖

亞群,離子


第2章鋅、鐵、錳、鎘和鉀等礦質(zhì)元素在馬鈴薯薯肉中的含量及全基因組關(guān)聯(lián)分析11沒(méi)有明顯差異。在2018年測(cè)定的165份材料中窄刀薯鋅離子含量的平均值大于角萼薯,角萼薯鋅離子含量的平均值大于富利亞薯(圖2.1A),在2019年測(cè)定的205份材料中窄刀薯鋅離子含量的平均值大于富利亞薯,富利亞薯鋅離子含量的平均值大于角萼薯(圖2.1B)。造成兩年數(shù)據(jù)不能吻合的原因有可能是由于2018年收集的富利亞薯的數(shù)目較多,而2019年收獲的群體類(lèi)型與數(shù)目和進(jìn)化樹(shù)的類(lèi)型比較一致。圖2.12018年和2019年三個(gè)亞群中鋅離子含量的分布Figure2.1Distributionofzincioncontentinthreesubgroupsin2018and2019注:A:2018年B:2019年本研究對(duì)薯肉中鋅離子含量的數(shù)據(jù)和馬鈴薯二倍體自然變異群體全基因組重測(cè)序的SNPs數(shù)據(jù)進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析,在2018年的GWAS結(jié)果中發(fā)現(xiàn)在1號(hào)染色體有明顯信號(hào)(圖2.2),而2019年的GWAS結(jié)果表明關(guān)聯(lián)到的信號(hào)位點(diǎn)在2號(hào)和10號(hào)染色體(圖2.3),造成兩次GWAS結(jié)果不同的原因可能是這兩年收獲的群體類(lèi)型的數(shù)目不一致。

關(guān)聯(lián)分析,曼哈頓,點(diǎn)圖,離子


第2章鋅、鐵、錳、鎘和鉀等礦質(zhì)元素在馬鈴薯薯肉中的含量及全基因組關(guān)聯(lián)分析12圖2.22018年薯肉鋅離子含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析的曼哈頓點(diǎn)圖Figure2.2Manhattandotplotofgenome-wideassociationanalysisofzincioncontentofpotatomeatin2018圖2.32019年薯肉鋅離子含量的全基因組關(guān)聯(lián)分析的曼哈頓點(diǎn)圖Figure2.3Manhattandotplotofgenome-wideassociationanalysisofzincioncontentofpotatomeatin2019

【參考文獻(xiàn)】:
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碩士論文
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[2]小麥抗倒伏相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 顏丹丹.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[3]水基微乳液直接進(jìn)樣ICP-OES測(cè)定乳制品中金屬含量的方法研究[D]. 明佳佳.鄭州大學(xué) 2018
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[5]兩個(gè)HAK/KUP/KT成員的鉀轉(zhuǎn)運(yùn)功能及耐鹽性分析[D]. 游西龍.新疆大學(xué) 2018
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[7]氮素對(duì)馬鈴薯生長(zhǎng)發(fā)育、產(chǎn)量及營(yíng)養(yǎng)品質(zhì)的影響[D]. 李帥兵.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[8]高淀粉馬鈴薯淀粉合成相關(guān)酶及基因在鉀調(diào)控下的差異[D]. 王金明.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[9]寧夏雨養(yǎng)區(qū)施鉀對(duì)馬鈴薯產(chǎn)量和品質(zhì)的影響[D]. 白志強(qiáng).寧夏大學(xué) 2016
[10]氮肥用量對(duì)馬鈴薯干物質(zhì)積累及氮素運(yùn)轉(zhuǎn)的影響[D]. 祁馳恒.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015



本文編號(hào):3259602

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