玉米大斑病菌漆酶基因家族鑒定及關鍵基因的功能解析
發(fā)布時間:2021-07-01 18:36
漆酶是一種多銅氧化酶,多以基因家族形式存在,編碼不同活性的同工酶,參與真菌形態(tài)建成、宿主與病原互作、合成色素、應激反應等多種重要生物學過程,但由于漆酶家族成員眾多及作用底物范圍廣泛,對其功能的闡釋多為表型分析,對漆酶參與的生化途徑了解較少。玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)是一種半活體子囊真菌,可以侵染玉米、高粱等作物,形成梭形病斑,影響植物光合作用從而降低產(chǎn)量。前期研究發(fā)現(xiàn),玉米大斑病菌漆酶基因StLAC1、StLAC2影響病菌生長、發(fā)育及致病,本論文對玉米大斑病菌漆酶家族基因進行了系統(tǒng)鑒定,并在轉錄及蛋白水平上尋找關鍵基因,結合基因組學、代謝組學研究玉米大斑病菌中關鍵漆酶基因在病菌生長、發(fā)育及致病中的功能。得到以下結果:1.利用多銅氧化酶結構域的隱馬爾可夫模型,在玉米大斑病菌基因組中鑒定得到了9個漆酶樣多銅氧化酶,均含有保守的銅離子結合特征序列,但其蛋白氨基酸序列同源性低,僅為19.79%-48.70%,聚類在5個不同的超家族,其中Stlac1、Stlac2、Stlac4、Stlac6為子囊菌多銅氧化酶。在9個基因上游含有正向氮調(diào)控基因作用元件(NIT2)、正...
【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學河北省
【文章頁數(shù)】:113 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
典型漆酶結構域及銅離子結合位點[6]
諫?刂屑洳??多巴類色素,兒茶酚胺衍生物如吡咯-2,3,5-三羧酸和吡咯-2,3-二羧酸等黑色素的特異性中間產(chǎn)物在缺失漆酶的突變體中不存在。在添加了兒茶酚胺的培養(yǎng)基中,漆酶通過氧化多巴胺成為高活性的多巴醌,多巴醌再與自身或其它產(chǎn)物聚合生成黑色素,但是這個催化過程尚未在體內(nèi)得到證明[40]。在昆蟲角質(zhì)層硬化過程中也發(fā)現(xiàn)多巴胺類衍生物可以作為漆酶的天然底物。1,2-脫氫-N-乙;喟桶肥抢ハx角質(zhì)層硬化過程中形成的重要兒茶酚胺衍生物,漆酶催化其氧化產(chǎn)生大量二聚體,但并未檢測到聚合程度更高的低聚物[41]。AB圖1-2漆酶以DHN和L-dopa為底物合成黑色素[32]Fig.1-2LaccasessynthesizemelaninusingDHNandL-dopaassubstrates[32]注:A:DHN黑色素合成過程。B:L-dopa黑色素合成過程。Note:A:thesynthesisofDHNmelaninB:thesynthesisofL-dopamelanin1.2.2木質(zhì)素類化合物植物細胞壁組分木質(zhì)素是苯丙烷衍生的高聚物,由對香豆醇(H單元,次要單元)、松柏醇(G單元)和芥子醇(S單元)等多酚類物質(zhì)構成的,通過自由基聚合偶聯(lián)形成各種C-C和C-O鍵實現(xiàn)其聚合。普遍認為漆酶對木質(zhì)素類化合物具有催化活性,但在不同的物種中其作用似乎完全相反。在植物中,漆酶參與氧化木質(zhì)素前體物質(zhì)的聚合,而木質(zhì)化程度增加可以抵抗病菌侵染[41-43];利用漆酶/介質(zhì)體系改性木質(zhì)素的過程中發(fā)現(xiàn),體外模擬漆酶催化酚木質(zhì)素二聚體,聚合發(fā)生在α位C上,而且小分子介質(zhì)的參與直接影響漆酶反應的聚合程度[44]。相反,在真菌中漆酶參與木質(zhì)素的降解,在降解過程中,漆酶能夠斷裂木質(zhì)素中低分子量酚類化合物,并且在各種介質(zhì)存在下斷裂非酚木質(zhì)素單元間的化學鍵,而酚類化合物作為降解中間產(chǎn)物可以促進漆酶對頑固非酚類結構的轉化(圖1-3)[45,46]。
河北農(nóng)業(yè)大學博士學位(畢業(yè))論文6圖1-3漆酶降解木質(zhì)素中推測的化學鍵斷裂[45]Fig.1-3Thechemicalreactioninlignindegradingbylaccase[45]1.2.3其他多酚類物質(zhì)研究表明,漆酶可以催化黃酮類、單寧類等其他多酚物質(zhì)。植物黃酮類化合物具有拮抗微生物侵染的作用,可能是漆酶的天然靶標并導致形成防御性色素。不同來源的漆酶催化黃酮類化合物的聚合反應的位置不同,植物中漆酶可以氧化黃酮的A環(huán)或產(chǎn)生自由基發(fā)生聚合,而真菌和細菌漆酶需要黃酮結構中B環(huán)上具有羥基才能進行催化反應;白藜蘆醇和多酚化合物具有限制色素形成的能力,可能是漆酶活性的有效抑制劑[47,48]。Colletotrichumgloeosporioides侵染鱷梨果實過程中發(fā)現(xiàn)真菌產(chǎn)生的漆酶參與黃酮類表兒茶素(Epicatechin)的生物轉化并導致抗真菌二烯化合物含量的下降,從而促進了病菌侵染及發(fā)病[49]。Polyporusversicolor產(chǎn)生的漆酶可以以黃酮醇作為底物,且動力學分析表明該酶對黃酮類化合物的親和力比多酚和苯二胺高[50]。植物中的漆酶活性導致形成許多棕色色素,通常稱為單寧[51,52]。Botrytiscinerea感染過程中,植物產(chǎn)生的漆酶氧化導致葡萄褐變反應,主要化合物包括沒食子酸、咖啡酸、阿魏酸和葡萄糖苷錦葵花素等多酚類物質(zhì)[53]。同時真菌漆酶也被認為是B.cinerea的重要致病蛋白,可以將白藜蘆醇氧化成維尼非林(Viniferin),其漆酶活性與致病性強弱有關[54]。其他多酚類如七葉樹素(一種香豆素衍生物)也能被漆酶氧化,說明漆酶可能參與香豆素等物質(zhì)的生物合成途徑[55]。除此之外,真菌DaldiniaeschscholziiIFB-TL01產(chǎn)生的免疫抑制劑Dalesconols是DHN衍生物,漆酶催化其聚合過程[56]。1.2.4前列腺素等脂類化合物隨著對漆酶功能的深入了解,逐漸發(fā)現(xiàn)多酚類物質(zhì)不是漆酶
【參考文獻】:
期刊論文
[1]禾谷鐮孢漆酶樣多銅氧化酶的鑒定及其表達模式[J]. 劉寧,渠清,李麗娜,龐茜,柳建虎,張垚,曹志艷,董金皋. 植物病理學報. 2019(06)
[2]代謝組學全功能軟件研究進展[J]. 梁丹丹,李憶濤,鄭曉皎,陳天璐. 上海交通大學學報(醫(yī)學版). 2018(07)
[3]香菇生長發(fā)育過程中漆酶基因家族的轉錄表達[J]. 秦澎,李津,辜運富,曾先富,向泉桔. 應用與環(huán)境生物學報. 2018(02)
[4]STK1基因對山梨醇高滲脅迫下玉米大斑病菌菌絲生長和發(fā)育的調(diào)控[J]. 張淑紅,張運峰,范永山. 西北農(nóng)林科技大學學報(自然科學版). 2018(07)
[5]龍眼漆酶家族成員全基因組結構與功能分析[J]. 徐小萍,陳曉慧,呂科良,陳旭,陳裕坤,林玉玲,賴鐘雄. 應用與環(huán)境生物學報. 2018(04)
[6]過氧化物酶體增殖劑對稻瘟病菌生長發(fā)育及致病性的影響[J]. 陳海莉,李玲,王教瑜,張昕,孫國昌. 微生物學報. 2016(10)
[7]擬南芥轉酮醇酶蛋白AtTKL1的同源建模及與α-三聯(lián)噻吩結合作用分析[J]. 趙斌,霍靜倩,邢繼紅,齊萌,張金林,董金皋. 高等學;瘜W學報. 2015(04)
[8]利用根癌農(nóng)桿菌T-DNA插入突變尋找參與漆酶葡萄糖阻遏的關鍵基因[J]. 李中明,潘皎,朱旭東. 微生物學報. 2012(01)
[9]過氧化物酶體與病原真菌的致病性[J]. 李荔,張克勤,楊金奎. 微生物學通報. 2011(06)
[10]漆酶空間結構、反應機理及應用[J]. 葛宏華,武赟,肖亞中. 生物工程學報. 2011(02)
博士論文
[1]核地杖菌漆酶基因ShLAC1和桑樹幾丁質(zhì)識別受體的功能研究[D]. 呂志遠.西南大學 2018
[2]磷脂類系列化合物對UGT酶抑制及其機制的研究[D]. 高欣.中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院 2015
[3]白腐真菌漆酶及同工酶基因家族的克隆表達調(diào)控研究[D]. 卓睿.華中科技大學 2015
[4]稻瘟病菌精氨酸合成途徑基因的功能分析及稻瘟病菌代謝組學的研究[D]. 張勇.浙江大學 2015
[5]玉米小斑病菌中Vel2與Vos1的功能分析[D]. 王偉偉.吉林大學 2014
[6]漆酶在斑玉蕈菌絲生長和子實體發(fā)育中的功能研究[D]. 張津京.南京農(nóng)業(yè)大學 2014
[7]玉米大斑病菌黑色素合成途徑相關基因的克隆及功能分析[D]. 曹志艷.河北農(nóng)業(yè)大學 2009
碩士論文
[1]毛竹漆酶家族全基因組分析及PeLAC和PeLAC190的功能研究[D]. 李利超.中國林業(yè)科學研究院 2017
[2]稻瘟病菌自噬基因缺失對菌體及其寄主代謝的影響及差異代謝物篩選[D]. 張凡忠.浙江大學 2016
[3]灰葡萄孢菌和紫外誘導葡萄抗毒素白藜蘆醇合成及代謝的研究[D]. 張翠蘋.四川農(nóng)業(yè)大學 2016
[4]水稻漆酶介導植株體內(nèi)阿特拉津和異丙隆降解機理的研究[D]. 黃夢甜.南京農(nóng)業(yè)大學 2016
[5]大斑剛毛座腔菌漆酶基因功能驗證及高產(chǎn)漆酶發(fā)酵條件優(yōu)化[D]. 曹可可.河北農(nóng)業(yè)大學 2015
[6]芒果炭疽病菌漆酶基因Lac1的克隆與致病相關功能鑒定[D]. 韋運謝.海南大學 2014
[7]大豆疫霉磷脂酰肌醇轉移蛋白PsPITP1功能分析[D]. 路兆軍.南京農(nóng)業(yè)大學 2013
[8]白念珠菌多銅氧化酶基因功能及轉錄調(diào)控的研究[D]. 程欣欣.南開大學 2013
[9]稻瘟病菌漆酶基因的生物信息學分析及其功能驗證[D]. 趙傳志.福建農(nóng)林大學 2006
本文編號:3259656
【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學河北省
【文章頁數(shù)】:113 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
典型漆酶結構域及銅離子結合位點[6]
諫?刂屑洳??多巴類色素,兒茶酚胺衍生物如吡咯-2,3,5-三羧酸和吡咯-2,3-二羧酸等黑色素的特異性中間產(chǎn)物在缺失漆酶的突變體中不存在。在添加了兒茶酚胺的培養(yǎng)基中,漆酶通過氧化多巴胺成為高活性的多巴醌,多巴醌再與自身或其它產(chǎn)物聚合生成黑色素,但是這個催化過程尚未在體內(nèi)得到證明[40]。在昆蟲角質(zhì)層硬化過程中也發(fā)現(xiàn)多巴胺類衍生物可以作為漆酶的天然底物。1,2-脫氫-N-乙;喟桶肥抢ハx角質(zhì)層硬化過程中形成的重要兒茶酚胺衍生物,漆酶催化其氧化產(chǎn)生大量二聚體,但并未檢測到聚合程度更高的低聚物[41]。AB圖1-2漆酶以DHN和L-dopa為底物合成黑色素[32]Fig.1-2LaccasessynthesizemelaninusingDHNandL-dopaassubstrates[32]注:A:DHN黑色素合成過程。B:L-dopa黑色素合成過程。Note:A:thesynthesisofDHNmelaninB:thesynthesisofL-dopamelanin1.2.2木質(zhì)素類化合物植物細胞壁組分木質(zhì)素是苯丙烷衍生的高聚物,由對香豆醇(H單元,次要單元)、松柏醇(G單元)和芥子醇(S單元)等多酚類物質(zhì)構成的,通過自由基聚合偶聯(lián)形成各種C-C和C-O鍵實現(xiàn)其聚合。普遍認為漆酶對木質(zhì)素類化合物具有催化活性,但在不同的物種中其作用似乎完全相反。在植物中,漆酶參與氧化木質(zhì)素前體物質(zhì)的聚合,而木質(zhì)化程度增加可以抵抗病菌侵染[41-43];利用漆酶/介質(zhì)體系改性木質(zhì)素的過程中發(fā)現(xiàn),體外模擬漆酶催化酚木質(zhì)素二聚體,聚合發(fā)生在α位C上,而且小分子介質(zhì)的參與直接影響漆酶反應的聚合程度[44]。相反,在真菌中漆酶參與木質(zhì)素的降解,在降解過程中,漆酶能夠斷裂木質(zhì)素中低分子量酚類化合物,并且在各種介質(zhì)存在下斷裂非酚木質(zhì)素單元間的化學鍵,而酚類化合物作為降解中間產(chǎn)物可以促進漆酶對頑固非酚類結構的轉化(圖1-3)[45,46]。
河北農(nóng)業(yè)大學博士學位(畢業(yè))論文6圖1-3漆酶降解木質(zhì)素中推測的化學鍵斷裂[45]Fig.1-3Thechemicalreactioninlignindegradingbylaccase[45]1.2.3其他多酚類物質(zhì)研究表明,漆酶可以催化黃酮類、單寧類等其他多酚物質(zhì)。植物黃酮類化合物具有拮抗微生物侵染的作用,可能是漆酶的天然靶標并導致形成防御性色素。不同來源的漆酶催化黃酮類化合物的聚合反應的位置不同,植物中漆酶可以氧化黃酮的A環(huán)或產(chǎn)生自由基發(fā)生聚合,而真菌和細菌漆酶需要黃酮結構中B環(huán)上具有羥基才能進行催化反應;白藜蘆醇和多酚化合物具有限制色素形成的能力,可能是漆酶活性的有效抑制劑[47,48]。Colletotrichumgloeosporioides侵染鱷梨果實過程中發(fā)現(xiàn)真菌產(chǎn)生的漆酶參與黃酮類表兒茶素(Epicatechin)的生物轉化并導致抗真菌二烯化合物含量的下降,從而促進了病菌侵染及發(fā)病[49]。Polyporusversicolor產(chǎn)生的漆酶可以以黃酮醇作為底物,且動力學分析表明該酶對黃酮類化合物的親和力比多酚和苯二胺高[50]。植物中的漆酶活性導致形成許多棕色色素,通常稱為單寧[51,52]。Botrytiscinerea感染過程中,植物產(chǎn)生的漆酶氧化導致葡萄褐變反應,主要化合物包括沒食子酸、咖啡酸、阿魏酸和葡萄糖苷錦葵花素等多酚類物質(zhì)[53]。同時真菌漆酶也被認為是B.cinerea的重要致病蛋白,可以將白藜蘆醇氧化成維尼非林(Viniferin),其漆酶活性與致病性強弱有關[54]。其他多酚類如七葉樹素(一種香豆素衍生物)也能被漆酶氧化,說明漆酶可能參與香豆素等物質(zhì)的生物合成途徑[55]。除此之外,真菌DaldiniaeschscholziiIFB-TL01產(chǎn)生的免疫抑制劑Dalesconols是DHN衍生物,漆酶催化其聚合過程[56]。1.2.4前列腺素等脂類化合物隨著對漆酶功能的深入了解,逐漸發(fā)現(xiàn)多酚類物質(zhì)不是漆酶
【參考文獻】:
期刊論文
[1]禾谷鐮孢漆酶樣多銅氧化酶的鑒定及其表達模式[J]. 劉寧,渠清,李麗娜,龐茜,柳建虎,張垚,曹志艷,董金皋. 植物病理學報. 2019(06)
[2]代謝組學全功能軟件研究進展[J]. 梁丹丹,李憶濤,鄭曉皎,陳天璐. 上海交通大學學報(醫(yī)學版). 2018(07)
[3]香菇生長發(fā)育過程中漆酶基因家族的轉錄表達[J]. 秦澎,李津,辜運富,曾先富,向泉桔. 應用與環(huán)境生物學報. 2018(02)
[4]STK1基因對山梨醇高滲脅迫下玉米大斑病菌菌絲生長和發(fā)育的調(diào)控[J]. 張淑紅,張運峰,范永山. 西北農(nóng)林科技大學學報(自然科學版). 2018(07)
[5]龍眼漆酶家族成員全基因組結構與功能分析[J]. 徐小萍,陳曉慧,呂科良,陳旭,陳裕坤,林玉玲,賴鐘雄. 應用與環(huán)境生物學報. 2018(04)
[6]過氧化物酶體增殖劑對稻瘟病菌生長發(fā)育及致病性的影響[J]. 陳海莉,李玲,王教瑜,張昕,孫國昌. 微生物學報. 2016(10)
[7]擬南芥轉酮醇酶蛋白AtTKL1的同源建模及與α-三聯(lián)噻吩結合作用分析[J]. 趙斌,霍靜倩,邢繼紅,齊萌,張金林,董金皋. 高等學;瘜W學報. 2015(04)
[8]利用根癌農(nóng)桿菌T-DNA插入突變尋找參與漆酶葡萄糖阻遏的關鍵基因[J]. 李中明,潘皎,朱旭東. 微生物學報. 2012(01)
[9]過氧化物酶體與病原真菌的致病性[J]. 李荔,張克勤,楊金奎. 微生物學通報. 2011(06)
[10]漆酶空間結構、反應機理及應用[J]. 葛宏華,武赟,肖亞中. 生物工程學報. 2011(02)
博士論文
[1]核地杖菌漆酶基因ShLAC1和桑樹幾丁質(zhì)識別受體的功能研究[D]. 呂志遠.西南大學 2018
[2]磷脂類系列化合物對UGT酶抑制及其機制的研究[D]. 高欣.中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院 2015
[3]白腐真菌漆酶及同工酶基因家族的克隆表達調(diào)控研究[D]. 卓睿.華中科技大學 2015
[4]稻瘟病菌精氨酸合成途徑基因的功能分析及稻瘟病菌代謝組學的研究[D]. 張勇.浙江大學 2015
[5]玉米小斑病菌中Vel2與Vos1的功能分析[D]. 王偉偉.吉林大學 2014
[6]漆酶在斑玉蕈菌絲生長和子實體發(fā)育中的功能研究[D]. 張津京.南京農(nóng)業(yè)大學 2014
[7]玉米大斑病菌黑色素合成途徑相關基因的克隆及功能分析[D]. 曹志艷.河北農(nóng)業(yè)大學 2009
碩士論文
[1]毛竹漆酶家族全基因組分析及PeLAC和PeLAC190的功能研究[D]. 李利超.中國林業(yè)科學研究院 2017
[2]稻瘟病菌自噬基因缺失對菌體及其寄主代謝的影響及差異代謝物篩選[D]. 張凡忠.浙江大學 2016
[3]灰葡萄孢菌和紫外誘導葡萄抗毒素白藜蘆醇合成及代謝的研究[D]. 張翠蘋.四川農(nóng)業(yè)大學 2016
[4]水稻漆酶介導植株體內(nèi)阿特拉津和異丙隆降解機理的研究[D]. 黃夢甜.南京農(nóng)業(yè)大學 2016
[5]大斑剛毛座腔菌漆酶基因功能驗證及高產(chǎn)漆酶發(fā)酵條件優(yōu)化[D]. 曹可可.河北農(nóng)業(yè)大學 2015
[6]芒果炭疽病菌漆酶基因Lac1的克隆與致病相關功能鑒定[D]. 韋運謝.海南大學 2014
[7]大豆疫霉磷脂酰肌醇轉移蛋白PsPITP1功能分析[D]. 路兆軍.南京農(nóng)業(yè)大學 2013
[8]白念珠菌多銅氧化酶基因功能及轉錄調(diào)控的研究[D]. 程欣欣.南開大學 2013
[9]稻瘟病菌漆酶基因的生物信息學分析及其功能驗證[D]. 趙傳志.福建農(nóng)林大學 2006
本文編號:3259656
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