髓系腫瘤中DLX4基因的表觀遺傳學(xué)調(diào)控機(jī)制及其臨床意義
發(fā)布時(shí)間:2021-06-29 21:42
目的探究急性髓細(xì)胞白血病(acute myeloid leukemia,AML)、慢性髓細(xì)胞白血病(chronic myeloid leukemia,CML)和骨髓增生異常綜合征(myelodysplastic syndrome,MDS)三種髓系腫瘤患者中DLX4(distal-less homeobox 4)表達(dá)和啟動(dòng)子甲基化態(tài)勢(shì),同時(shí)分析其相關(guān)性和臨床意義。方法應(yīng)用實(shí)時(shí)定量PCR(real-time quantitative PCR,RQ-PCR)檢測(cè)37例正常人、102例AML患者及56例CML患者骨髓單個(gè)核細(xì)胞中DLX4轉(zhuǎn)錄本水平。應(yīng)用實(shí)時(shí)定量甲基化特異性PCR(real-time quantitative methylation-specific PCR,RQ-MSP)方法檢測(cè)52例正常人、173例AML患者、87例CML患者及103例MDS患者骨髓單個(gè)核細(xì)胞中DLX4啟動(dòng)子甲基化水平。同時(shí)應(yīng)用亞硫酸氫鹽測(cè)序PCR(bisulfite sequencing PCR,BSP)方法驗(yàn)證有標(biāo)本中的DLX4甲基化密度。應(yīng)用去甲基化藥物5-氮-2’-脫氧胞苷(5-aza-2’-deox...
【文章來(lái)源】:江蘇大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
英文縮略語(yǔ)
第一章 引言
1.1 髓系腫瘤
1.2 表觀遺傳學(xué)與DNA甲基化
1.3 DLX4
第二章 研究目的、方案設(shè)計(jì)、意義
2.1 研究目的
2.2 研究方法設(shè)計(jì)
2.3 研究的意義
第三章 材料和方法
3.1 材料
3.1.1 研究對(duì)象
3.1.2 主要試劑
3.1.3 主要儀器
3.1.4 引物
3.2 方法
3.2.1 骨髓單個(gè)核細(xì)胞的分離、提取總RNA和基因組DNA
3.2.2 亞硫酸鹽修飾基因組DNA
3.2.3 逆轉(zhuǎn)錄合成c DNA
3.2.4 實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)DLX4的表達(dá)
3.2.5 實(shí)時(shí)定量甲基化特異性PCR檢測(cè)DLX4甲基化的水平
3.2.6 亞硫酸氫鹽測(cè)序PCR檢測(cè)DLX4甲基化的密度
3.2.7 PCR產(chǎn)物純化回收
3.2.8 重組載體構(gòu)建
3.2.9 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化
3.2.10 重組質(zhì)粒提取
3.2.11 質(zhì)粒鑒定、測(cè)序
3.2.12 陽(yáng)性模板建立
3.2.13 細(xì)胞遺傳學(xué)檢查
3.2.14 基因突變檢測(cè)
3.2.15 融合基因檢測(cè)
3.2.16 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
第四章 結(jié)果
4.1 AML中DLX4表達(dá)、甲基化及其相關(guān)關(guān)系
4.1.1 對(duì)照組和AML患者中DLX4表達(dá)
4.1.2 AML患者中DLX4表達(dá)的ROC曲線
4.1.3 DLX4表達(dá)與AML患者臨床參數(shù)的相關(guān)性
4.1.4 DLX4表達(dá)與AML患者預(yù)后的關(guān)系
4.1.5 對(duì)照組和AML患者中DLX4啟動(dòng)子1甲基化水平
4.1.6 對(duì)照組和AML患者中DLX4啟動(dòng)子2甲基化水平
4.1.7 AML患者中DLX4甲基化的ROC曲線
4.1.8 DLX4甲基化與AML患者臨床參數(shù)的相關(guān)性
4.1.9 DLX4甲基化與AML患者預(yù)后的關(guān)系
4.1.10 AML患者中DLX4甲基化與表達(dá)的關(guān)系
4.1.11 AML細(xì)胞株中 5-aza-d C對(duì)DLX4甲基化和表達(dá)的影響
4.2 CML中DLX4表達(dá)、甲基化及其相關(guān)關(guān)系
4.2.1 CML患者中DLX4甲基化
4.2.2 同一CML患者不同時(shí)期DLX4甲基化
4.2.3 CML患者中DLX4甲基化的ROC曲線
4.2.4 DLX4甲基化與CML患者臨床參數(shù)的相關(guān)性
4.2.5 CML患者中DLX4甲基化與表達(dá)的關(guān)系
4.2.6 CML細(xì)胞株中 5-aza-d C對(duì)DLX4的甲基化和表達(dá)的影響
4.3 MDS中DLX4甲基化的臨床意義
4.3.1 MDS患者中DLX4甲基化
4.3.2 MDS患者中DLX4甲基化的ROC曲線
4.3.3 DLX4甲基化與MDS患者臨床參數(shù)的相關(guān)性
4.3.4 DLX4甲基化與MDS患者預(yù)后的關(guān)系
第五章 討論
第六章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及其他科研成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]DNA甲基化研究方法的回顧與評(píng)價(jià)[J]. 顧婷婷,張忠明,鄭鵬生. 中國(guó)婦幼健康研究. 2006(06)
本文編號(hào):3257214
【文章來(lái)源】:江蘇大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
英文縮略語(yǔ)
第一章 引言
1.1 髓系腫瘤
1.2 表觀遺傳學(xué)與DNA甲基化
1.3 DLX4
第二章 研究目的、方案設(shè)計(jì)、意義
2.1 研究目的
2.2 研究方法設(shè)計(jì)
2.3 研究的意義
第三章 材料和方法
3.1 材料
3.1.1 研究對(duì)象
3.1.2 主要試劑
3.1.3 主要儀器
3.1.4 引物
3.2 方法
3.2.1 骨髓單個(gè)核細(xì)胞的分離、提取總RNA和基因組DNA
3.2.2 亞硫酸鹽修飾基因組DNA
3.2.3 逆轉(zhuǎn)錄合成c DNA
3.2.4 實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)DLX4的表達(dá)
3.2.5 實(shí)時(shí)定量甲基化特異性PCR檢測(cè)DLX4甲基化的水平
3.2.6 亞硫酸氫鹽測(cè)序PCR檢測(cè)DLX4甲基化的密度
3.2.7 PCR產(chǎn)物純化回收
3.2.8 重組載體構(gòu)建
3.2.9 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化
3.2.10 重組質(zhì)粒提取
3.2.11 質(zhì)粒鑒定、測(cè)序
3.2.12 陽(yáng)性模板建立
3.2.13 細(xì)胞遺傳學(xué)檢查
3.2.14 基因突變檢測(cè)
3.2.15 融合基因檢測(cè)
3.2.16 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
第四章 結(jié)果
4.1 AML中DLX4表達(dá)、甲基化及其相關(guān)關(guān)系
4.1.1 對(duì)照組和AML患者中DLX4表達(dá)
4.1.2 AML患者中DLX4表達(dá)的ROC曲線
4.1.3 DLX4表達(dá)與AML患者臨床參數(shù)的相關(guān)性
4.1.4 DLX4表達(dá)與AML患者預(yù)后的關(guān)系
4.1.5 對(duì)照組和AML患者中DLX4啟動(dòng)子1甲基化水平
4.1.6 對(duì)照組和AML患者中DLX4啟動(dòng)子2甲基化水平
4.1.7 AML患者中DLX4甲基化的ROC曲線
4.1.8 DLX4甲基化與AML患者臨床參數(shù)的相關(guān)性
4.1.9 DLX4甲基化與AML患者預(yù)后的關(guān)系
4.1.10 AML患者中DLX4甲基化與表達(dá)的關(guān)系
4.1.11 AML細(xì)胞株中 5-aza-d C對(duì)DLX4甲基化和表達(dá)的影響
4.2 CML中DLX4表達(dá)、甲基化及其相關(guān)關(guān)系
4.2.1 CML患者中DLX4甲基化
4.2.2 同一CML患者不同時(shí)期DLX4甲基化
4.2.3 CML患者中DLX4甲基化的ROC曲線
4.2.4 DLX4甲基化與CML患者臨床參數(shù)的相關(guān)性
4.2.5 CML患者中DLX4甲基化與表達(dá)的關(guān)系
4.2.6 CML細(xì)胞株中 5-aza-d C對(duì)DLX4的甲基化和表達(dá)的影響
4.3 MDS中DLX4甲基化的臨床意義
4.3.1 MDS患者中DLX4甲基化
4.3.2 MDS患者中DLX4甲基化的ROC曲線
4.3.3 DLX4甲基化與MDS患者臨床參數(shù)的相關(guān)性
4.3.4 DLX4甲基化與MDS患者預(yù)后的關(guān)系
第五章 討論
第六章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及其他科研成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]DNA甲基化研究方法的回顧與評(píng)價(jià)[J]. 顧婷婷,張忠明,鄭鵬生. 中國(guó)婦幼健康研究. 2006(06)
本文編號(hào):3257214
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