Bacillus cereus中羰基還原酶的基因挖掘及克隆表達(dá)研究
發(fā)布時間:2021-06-24 06:24
手性醇是工業(yè)合成藥物、農(nóng)用化學(xué)品、天然產(chǎn)品及某些特殊材料過程中一種重要的手性砌塊。利用羰基還原酶不對稱還原前手性羰基化合物,是合成手性醇的重要方法之一。本文通過構(gòu)建基因挖掘策略,挖掘蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中潛在羰基還原酶,并進(jìn)行了克隆表達(dá)研究。本研究在確定羰基還原酶各家族的氨基酸保守序列后,選取來源于極端嗜熱菌Aeropyrum pernix K1中的羰基還原酶(ApCR),作為探針酶。以探針酶的氨基酸序列為模板,在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行同源序列比對、篩選后,構(gòu)建候選酶庫。通過對候選酶序列和探針序列進(jìn)行氨基酸序列比對、二級結(jié)構(gòu)模擬比對、三級結(jié)構(gòu)模擬比對后,確定來源于蠟樣芽胞桿菌Bacilluscereus中的蛋白BcCR,與探針ApCR序列具有相似的二級、三級結(jié)構(gòu),并且都具有羰基還原酶SDRs家族的氨基酸保守序列,推測該蛋白具有與ApCR相似的酶學(xué)性質(zhì)及功能。以B.cereus的基因組DNA為模板,PCR克隆出BcCR基因(738bp),構(gòu)建重組質(zhì)粒pET 28a-BcCR,并將其導(dǎo)入在E.coli B121(DE3)plysS中,實(shí)現(xiàn)了可溶性表達(dá),蛋白大小約為32kDa。對表達(dá)出的目標(biāo)酶進(jìn)行酶學(xué)性...
【文章來源】:武漢科技大學(xué)湖北省
【文章頁數(shù)】:73 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1輔酶NTAD(P)H氫轉(zhuǎn)移示意圖??Fig.?1.1?Diagram?of?the?hydrogen?transfer?form?NAD(P)H?to?the?carbon??
2.2.2基因挖掘原理??基因挖掘的原理,主要是針對某種特定的生物或整個公共數(shù)據(jù)庫,對已知的??基因或蛋白質(zhì)序列進(jìn)行檢索、分析、篩選,最終獲得目標(biāo)蛋白,流程如圖2.1所??13??
_3849),與探針酶ApCR的氨基酸序列一致性為38.4%。氨基酸??序列比對結(jié)果見圖2.4,分析可見二者均包含了?SDR家族的活性中心保守區(qū)??Y-X3-K,輔因子結(jié)合位點(diǎn)保守區(qū)TG-X3-G-X-G。BcCR與ApCR的二級結(jié)構(gòu)模??擬見圖2.5,由圖可見,二者的二級結(jié)構(gòu),在的a螺旋、(3折疊、無規(guī)則卷曲所??在的氨基酸位置及分布區(qū)間相似。BcCR與ApCR的三級結(jié)構(gòu)模擬見圖2.6,可??見二者的三級結(jié)構(gòu)也很相似。??首先,根據(jù)BcCR具有羰基還原酶的催化位點(diǎn)和輔酶結(jié)合位點(diǎn)的氨基酸保守??序列,初步推測其具有羰基還原酶活性。然后,根據(jù)BcCR與ApCR具有相似的??二級和三級結(jié)構(gòu),初步推測二者具有相似酶學(xué)性質(zhì)。即BcCR為SDRs家族的羰??基還原酶,能催化COBE還原為相應(yīng)的手性醇,并需要NADPH的參與,同時,??該酶可能具有耐高溫和熱穩(wěn)定性較好的特性。??ApCR.seq?.?MET?T?L?R?Eglv?fgg?I?K?S?RAD?39??3cCR.seq?邏?40??Consensus?alltg?srgTgfa?a?9?vv?y??Consensus?a?e?Xgs?a?vr?dv?d?vz?m??ApCR.seq?IFHlN\ggjggjl-QLGGIEETSI^£ETI?\^I?^?119??BcCR.seq?臓則_5:1壓?CT’、’:N?邏:219??Consensus?Ivn?agv?ew?nl?gv?l??ApCR.seq?'篇:XLPIXRKAKWAH僅?Is|£lg'”'.:AGVA|?韋
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]酮還原酶在合成含手性醇結(jié)構(gòu)藥物中的應(yīng)用[J]. 孫仲橋,張姝琦,賈嫻. 沈陽藥科大學(xué)學(xué)報. 2017(12)
[2]生物信息數(shù)據(jù)挖掘若干關(guān)鍵問題研究與應(yīng)用[J]. 施偉,孫華. 信息與電腦(理論版). 2017(21)
[3]淺談紫杉醇的機(jī)制研究和治療應(yīng)用[J]. 朱麗曉. 臨床醫(yī)藥文獻(xiàn)電子雜志. 2017(62)
[4]拆分手性化合物色譜填料的研究進(jìn)展[J]. 張美齡,趙琰,屈會化. 藥物分析雜志. 2017(05)
[5]定點(diǎn)突變提高苯丙氨酸羥化酶的熱穩(wěn)定性[J]. 葉雙雙,周麗,周哲敏. 生物工程學(xué)報. 2016(09)
[6]脂肪酶手性拆分的研究進(jìn)展[J]. 黃冠廷,杜育芝,彭昆,張文承,葉鵬. 廣州化工. 2016(09)
[7]高通量篩選具有催化活性和立體選擇性羰基還原酶[J]. 張航,陳曦,馮進(jìn)輝,鮑錦庫,吳洽慶,朱敦明. 生物工程學(xué)報. 2015(02)
[8]手性物質(zhì)及其拆分方法[J]. 劉鳳艷,龐小琳,鄭軼群,甘秀石. 遼寧化工. 2007(11)
本文編號:3246557
【文章來源】:武漢科技大學(xué)湖北省
【文章頁數(shù)】:73 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1輔酶NTAD(P)H氫轉(zhuǎn)移示意圖??Fig.?1.1?Diagram?of?the?hydrogen?transfer?form?NAD(P)H?to?the?carbon??
2.2.2基因挖掘原理??基因挖掘的原理,主要是針對某種特定的生物或整個公共數(shù)據(jù)庫,對已知的??基因或蛋白質(zhì)序列進(jìn)行檢索、分析、篩選,最終獲得目標(biāo)蛋白,流程如圖2.1所??13??
_3849),與探針酶ApCR的氨基酸序列一致性為38.4%。氨基酸??序列比對結(jié)果見圖2.4,分析可見二者均包含了?SDR家族的活性中心保守區(qū)??Y-X3-K,輔因子結(jié)合位點(diǎn)保守區(qū)TG-X3-G-X-G。BcCR與ApCR的二級結(jié)構(gòu)模??擬見圖2.5,由圖可見,二者的二級結(jié)構(gòu),在的a螺旋、(3折疊、無規(guī)則卷曲所??在的氨基酸位置及分布區(qū)間相似。BcCR與ApCR的三級結(jié)構(gòu)模擬見圖2.6,可??見二者的三級結(jié)構(gòu)也很相似。??首先,根據(jù)BcCR具有羰基還原酶的催化位點(diǎn)和輔酶結(jié)合位點(diǎn)的氨基酸保守??序列,初步推測其具有羰基還原酶活性。然后,根據(jù)BcCR與ApCR具有相似的??二級和三級結(jié)構(gòu),初步推測二者具有相似酶學(xué)性質(zhì)。即BcCR為SDRs家族的羰??基還原酶,能催化COBE還原為相應(yīng)的手性醇,并需要NADPH的參與,同時,??該酶可能具有耐高溫和熱穩(wěn)定性較好的特性。??ApCR.seq?.?MET?T?L?R?Eglv?fgg?I?K?S?RAD?39??3cCR.seq?邏?40??Consensus?alltg?srgTgfa?a?9?vv?y??Consensus?a?e?Xgs?a?vr?dv?d?vz?m??ApCR.seq?IFHlN\ggjggjl-QLGGIEETSI^£ETI?\^I?^?119??BcCR.seq?臓則_5:1壓?CT’、’:N?邏:219??Consensus?Ivn?agv?ew?nl?gv?l??ApCR.seq?'篇:XLPIXRKAKWAH僅?Is|£lg'”'.:AGVA|?韋
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]酮還原酶在合成含手性醇結(jié)構(gòu)藥物中的應(yīng)用[J]. 孫仲橋,張姝琦,賈嫻. 沈陽藥科大學(xué)學(xué)報. 2017(12)
[2]生物信息數(shù)據(jù)挖掘若干關(guān)鍵問題研究與應(yīng)用[J]. 施偉,孫華. 信息與電腦(理論版). 2017(21)
[3]淺談紫杉醇的機(jī)制研究和治療應(yīng)用[J]. 朱麗曉. 臨床醫(yī)藥文獻(xiàn)電子雜志. 2017(62)
[4]拆分手性化合物色譜填料的研究進(jìn)展[J]. 張美齡,趙琰,屈會化. 藥物分析雜志. 2017(05)
[5]定點(diǎn)突變提高苯丙氨酸羥化酶的熱穩(wěn)定性[J]. 葉雙雙,周麗,周哲敏. 生物工程學(xué)報. 2016(09)
[6]脂肪酶手性拆分的研究進(jìn)展[J]. 黃冠廷,杜育芝,彭昆,張文承,葉鵬. 廣州化工. 2016(09)
[7]高通量篩選具有催化活性和立體選擇性羰基還原酶[J]. 張航,陳曦,馮進(jìn)輝,鮑錦庫,吳洽慶,朱敦明. 生物工程學(xué)報. 2015(02)
[8]手性物質(zhì)及其拆分方法[J]. 劉鳳艷,龐小琳,鄭軼群,甘秀石. 遼寧化工. 2007(11)
本文編號:3246557
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3246557.html
最近更新
教材專著