基于生物信息學分析篩選腎上腺皮質(zhì)癌核心基因
發(fā)布時間:2021-06-24 04:37
目的通過生物信息學方法研究腎上腺皮質(zhì)癌發(fā)生、惡化的核心基因,探索可能的預后評估、篩選診斷的分子生物學標志物,為腎上腺皮質(zhì)癌潛在治療靶點提供了生物信息學證據(jù)支持。方法從GEO數(shù)據(jù)庫下載GSE14922、GSE19750和GSE90713芯片數(shù)據(jù),利用一系列生物信息學方法對GSE14922芯片進行處理、分析并篩選差異基因。再通過CytoHuhha插件篩選出核心基因,最后分別利用在線分析工具GEPIA和GSE19750、GSE90713芯片數(shù)據(jù)對核心基因進行生存分析與診斷試驗分析。結果從GSE14922芯片獲得90個差異基因。通過CytoHuhha插件獲得了6個核心基因分別為BUB1、CDK1、CENPF、NDC80、ASPM和DLGAP5。Kaplan-Meier生存曲線分析的結果表明上述核心基因?qū)δI上腺皮質(zhì)癌患者的診斷及生存預后具有顯著影響。ROC分析的結果表明上述核心基因?qū)δI上腺皮質(zhì)癌患者具有較好的診斷意義。結論通過生物信息學分析獲得6個核心基因在腎上腺皮質(zhì)癌的發(fā)生、進展中發(fā)揮重要作用,并為揭示腎上腺皮質(zhì)癌潛在的診斷、預后標志物和治療靶點提供了新的理論依據(jù)。
【文章來源】:醫(yī)學研究雜志. 2020,49(09)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1.原始芯片數(shù)據(jù)來源:
2.芯片數(shù)據(jù)預處理和差異基因篩選:
3.蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡的構建與核心基因的篩選:
4.核心基因的生存預后分析:
5.核心基因的診斷價值評價:
結 果
1.芯片數(shù)據(jù)預處理和差異基因篩選的結果:
2.蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡的構建與核心基因的篩選:
3.核心基因的生存預后分析:
4.核心基因的診斷價值評價:
討 論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于生物信息學分析胰腺癌的關鍵基因[J]. 黎越,林丹丹,何曉琴,徐細明. 醫(yī)學研究雜志. 2019(10)
[2]基于高通量芯片和生物信息學篩選系統(tǒng)性紅斑狼瘡核心基因及通路[J]. 朱晴,蔡昕添,洪靜,李南方. 新疆醫(yī)學. 2019(07)
本文編號:3246386
【文章來源】:醫(yī)學研究雜志. 2020,49(09)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1.原始芯片數(shù)據(jù)來源:
2.芯片數(shù)據(jù)預處理和差異基因篩選:
3.蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡的構建與核心基因的篩選:
4.核心基因的生存預后分析:
5.核心基因的診斷價值評價:
結 果
1.芯片數(shù)據(jù)預處理和差異基因篩選的結果:
2.蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡的構建與核心基因的篩選:
3.核心基因的生存預后分析:
4.核心基因的診斷價值評價:
討 論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于生物信息學分析胰腺癌的關鍵基因[J]. 黎越,林丹丹,何曉琴,徐細明. 醫(yī)學研究雜志. 2019(10)
[2]基于高通量芯片和生物信息學篩選系統(tǒng)性紅斑狼瘡核心基因及通路[J]. 朱晴,蔡昕添,洪靜,李南方. 新疆醫(yī)學. 2019(07)
本文編號:3246386
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