發(fā)布時(shí)間：2021-06-20 11:30

　　為探究赤眼鱒（Squaliobarbuscurriculus）β-肌動(dòng)蛋白（β-actin）基因的結(jié)構(gòu)和表達(dá)特性,本文采用RT-PCR技術(shù)和RACE法,從赤眼鱒肝臟中獲得了赤眼鱒β-actin cDNA全長(zhǎng)序列（GenBank:MT119965）,該基因c DNA全長(zhǎng)共1 816 bp,由94 bp的5’端非編碼區(qū), 594 bp的3’端非編碼區(qū)和1 128 bp的開放閱讀框（95-1222）組成,閱讀框共編碼375個(gè)氨基酸。通過序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建,赤眼鱒β-actin與鯉科魚類聚為一支且與鯪魚、鯽魚、黃顙魚等多個(gè)物種的β-actin氨基酸同源性都為99%。熒光定量（qPCR）表達(dá)分析顯示,β-actin在赤眼鱒肌肉、腸、脾臟、皮膚、血液、鰓、體腎、頭腎、心臟和肝臟十個(gè)組織中都有表達(dá),但不同組織的表達(dá)量存在差異。利用Best keeper軟件對(duì)赤眼鱒體內(nèi)的延伸因子1（elongation factor 1, EF1）和β-actin基因進(jìn)行穩(wěn)定性對(duì)比,發(fā)現(xiàn)β-actin基因穩(wěn)定性低于EF1基因。以上結(jié)果為赤眼鱒的分子系統(tǒng)進(jìn)化研究提供證據(jù),也為赤眼鱒功能基因表達(dá)研究提供參考依據(jù)。 

【文章來源】：湖南文理學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,32(03)

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【部分圖文】：

SWISS-MODEL預(yù)測(cè)赤眼鱒β-肌動(dòng)蛋白同源三級(jí)結(jié)構(gòu)模型

利用Best Keeper軟件計(jì)算得到β-actin與EF1兩個(gè)基因的CP最小值(min)、CP最大值(max)、相關(guān)系數(shù)(r)、標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)和變異系數(shù)(CV),β-actin的三個(gè)數(shù)值均高于EF1,相關(guān)系數(shù)兩者相差不大,但EF1的標(biāo)準(zhǔn)偏差和變異系數(shù)均顯著小于β-actin(表2)。根據(jù)Best Keeper軟件穩(wěn)定性的判定標(biāo)準(zhǔn)[26],綜合可得,EF1的穩(wěn)定性高于β-actin,EF1更適合作為赤眼鱒的內(nèi)參基因。3 討論

赤眼鱒β-actin基因c DNA全長(zhǎng)共1 816 bp(GenBank:MT119965),開放閱讀框(95-1222)1 128 bp,編碼375個(gè)氨基酸,5’端非編碼區(qū)為94 bp,3’端非編碼區(qū)為594 bp,推算的分子量約為41.75 kDa,理論等電點(diǎn)5.30。3’端非編碼區(qū)還含有1個(gè)“AATAAA”的m RNA加尾信號(hào)(圖1)。圖1 赤眼鱒β-actin基因序列

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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