異旋孢腔菌（Cochliobolus heterostrophus）引起的玉米小斑病是一種重要的玉米葉部病害。目前對玉米小斑病菌致病力的研究主要集中在T和O兩個生理小種的基因組獲得以及T小種毒素合成的分子機制。玉米小斑病菌在侵入寄主過程中需要應(yīng)對多種自身或寄主產(chǎn)生的應(yīng)激反應(yīng),同時生產(chǎn)毒素,維持致病力。此過程涉及多個轉(zhuǎn)錄因子的參與。轉(zhuǎn)錄因子HapX是鐵穩(wěn)態(tài)的主要調(diào)節(jié)劑,對多種病原真菌維持毒力至關(guān)重要。玉米小斑病菌中的ChhapX對鐵穩(wěn)態(tài)及致病力的影響,以及其是否通過已證實的保守鐵調(diào)節(jié)系統(tǒng)來響應(yīng)鐵離子變化協(xié)調(diào)自身鐵平衡,尚不明確。本研究以玉米小斑病菌ChhapX為研究對象,建立并優(yōu)化農(nóng)桿菌介導(dǎo)的玉米小斑病菌遺傳轉(zhuǎn)化體系,獲得ChhapX敲除突變體,分析轉(zhuǎn)錄因子ChhapX對玉米小斑病菌鐵穩(wěn)態(tài)、生長發(fā)育及致病力的影響,為明確玉米小斑病菌致病機制奠定基礎(chǔ)。其方法及結(jié)果如下:1.玉米小斑病菌轉(zhuǎn)錄因子ChhapX基因序列克隆及蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析。本文根據(jù)煙曲霉（Aspergillus fumigatus）的HapX基因序列,經(jīng)NCBI比對獲得玉米小斑病菌ChhapX基因全序列,并對其進行生物信息學(xué)... 

【文章來源】：沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】：82 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

ChhapX系統(tǒng)進化分析

第二章玉米小斑病菌ChHapX基因生物信息學(xué)分析18外顯子Type堿基數(shù)BaseNumber起始密碼子Startcodon終止密碼子Stopcodon氨基酸個數(shù)NumberofAAIntr12649313564222.2.4理化性質(zhì)分析利用ExPaSyProtparam(http://web.Expasy.org/protparam/)分析ChhapX氨基酸組成及理化性質(zhì)，結(jié)果表明ChhapX等電點（pI）值為6.28，不穩(wěn)定系數(shù)大于40，屬于不穩(wěn)定性蛋白，脂肪系數(shù)為56.52，親水性平均值為-0.786，是親水性蛋白。（表2-3）。表2-3ChhapX的組成及理化性質(zhì)Table2-3CompositionandphysicochemicalpropertyofChhapX基因Gene氨基酸殘基數(shù)Numberofaminoacids分子量Molecularweight（Da）等電點TheoreticalpI不穩(wěn)定指數(shù)Instabilityindex脂肪指數(shù)Aliphaticindex親水性平均值GrandaverageofhydropathicityChhapX42246345.996.2855.2756.52-0.7862.2.5亞細(xì)胞定位預(yù)測利用亞細(xì)胞定位網(wǎng)站http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/Cell-PLoc-2/分析，結(jié)果表明ChhapX定位在細(xì)胞核上（圖2-2）。圖2-2ChhapX亞細(xì)胞定位預(yù)測Figure2-2SubcellularlocalizationpredictionofChhapX2.2.6跨膜結(jié)構(gòu)域分析利用CBS在線預(yù)測工具（http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/）進行ChhapX跨膜結(jié)構(gòu)域分析。結(jié)果表明，ChhapX位于膜外，不存在跨膜區(qū)（圖2-3）。圖2-3ChhapX蛋白跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測Figure2-3TransmembranedomainspredictionofChhapXprotein

第二章玉米小斑病菌ChHapX基因生物信息學(xué)分析18外顯子Type堿基數(shù)BaseNumber起始密碼子Startcodon終止密碼子Stopcodon氨基酸個數(shù)NumberofAAIntr12649313564222.2.4理化性質(zhì)分析利用ExPaSyProtparam(http://web.Expasy.org/protparam/)分析ChhapX氨基酸組成及理化性質(zhì)，結(jié)果表明ChhapX等電點（pI）值為6.28，不穩(wěn)定系數(shù)大于40，屬于不穩(wěn)定性蛋白，脂肪系數(shù)為56.52，親水性平均值為-0.786，是親水性蛋白。（表2-3）。表2-3ChhapX的組成及理化性質(zhì)Table2-3CompositionandphysicochemicalpropertyofChhapX基因Gene氨基酸殘基數(shù)Numberofaminoacids分子量Molecularweight（Da）等電點TheoreticalpI不穩(wěn)定指數(shù)Instabilityindex脂肪指數(shù)Aliphaticindex親水性平均值GrandaverageofhydropathicityChhapX42246345.996.2855.2756.52-0.7862.2.5亞細(xì)胞定位預(yù)測利用亞細(xì)胞定位網(wǎng)站http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/Cell-PLoc-2/分析，結(jié)果表明ChhapX定位在細(xì)胞核上（圖2-2）。圖2-2ChhapX亞細(xì)胞定位預(yù)測Figure2-2SubcellularlocalizationpredictionofChhapX2.2.6跨膜結(jié)構(gòu)域分析利用CBS在線預(yù)測工具（http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/）進行ChhapX跨膜結(jié)構(gòu)域分析。結(jié)果表明，ChhapX位于膜外，不存在跨膜區(qū)（圖2-3）。圖2-3ChhapX蛋白跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測Figure2-3TransmembranedomainspredictionofChhapXprotein

【參考文獻】：
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本文編號：3233309