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中華蜜蜂泛素結(jié)合酶基因AccUBE2N和AccUBE2G1的表達(dá)特性與功能分析

發(fā)布時(shí)間:2021-06-15 18:22
  中華蜜蜂(Apis cerana cerana)是我國(guó)特有的優(yōu)良蜜蜂品種,在促進(jìn)經(jīng)濟(jì)發(fā)展和維持生態(tài)平衡方面發(fā)揮著重要作用。由于對(duì)外界刺激較為敏感,中華蜜蜂受環(huán)境脅迫影響較大,這制約了中華蜜蜂種群的生存與發(fā)展,研究中華蜜蜂的抗逆性能與防御機(jī)制對(duì)于中華蜜蜂種群的持續(xù)健康發(fā)展具有重要意義。泛素結(jié)合酶(Ubiquitin-conjugating enzyme E2,UBE2)在氧化應(yīng)激響應(yīng)、DNA損傷修復(fù)和調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)等多種細(xì)胞活動(dòng)中具有重要功能。本研究以中華蜜蜂為實(shí)驗(yàn)材料,分離得到兩個(gè)泛素結(jié)合酶基因,分別命名為AccUBE2N和AccUBE2G1,并對(duì)它們進(jìn)行功能研究,從分子水平上闡述中華蜜蜂抗逆性能與泛素結(jié)合酶的聯(lián)系,主要研究結(jié)果如下:(1)對(duì)AccUBE2N和AccUBE2G1進(jìn)行序列分析,結(jié)果表明,AccUBE2N的開(kāi)放閱讀框的長(zhǎng)度為456bp,編碼由151個(gè)氨基酸殘基組成的蛋白質(zhì),預(yù)測(cè)該蛋白的分子量為17.18kDa,預(yù)測(cè)等電點(diǎn)為5.72;AccUBE2G1的開(kāi)放閱讀框?yàn)?07bp,編碼由168個(gè)氨基酸殘基組成的蛋白質(zhì),預(yù)測(cè)分子量為19.28kDa,等電點(diǎn)為4.99。(2)氨基酸序列... 

【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

中華蜜蜂泛素結(jié)合酶基因AccUBE2N和AccUBE2G1的表達(dá)特性與功能分析


泛素化示意圖(Yeetal.,2009)

氨基酸序列,核苷酸序列,氨基酸序列,基因


3.1 中華蜜蜂 AccUBE2N 基因的分離與生物信息學(xué)分析3.1.1 AccUBE2N 開(kāi)放閱讀框的分離與序列分析本實(shí)驗(yàn)根據(jù) NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)公布的中華蜜蜂 UBE2N 基因的核苷酸序列(GenBan注冊(cè)號(hào):NW_016018011.1),設(shè)計(jì)特異性引物 NF 和 NR(表 2-1),并以中華蜜蜂總RNA 的反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 cDNA 為模板,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng) 1%的 TAE 瓊脂糖凝膠電泳檢驗(yàn)證,將含有目的條帶的凝膠回收,回收產(chǎn)物與連接載體 pEASY-T1 simple 進(jìn)行連接 20min 后轉(zhuǎn)化至大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞 DH5α 中。篩選出轉(zhuǎn)化結(jié)果為陽(yáng)性的菌液進(jìn)行測(cè)序,使用DNAMAN 軟件將測(cè)序結(jié)果與 NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)的中華蜜蜂 UBE2N 基因序列進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)兩序列一致,初步分離得到 AccUBE2N 基因的開(kāi)放閱讀框。序列特性分析表明,AccUBE2N 基因的開(kāi)放閱讀框?yàn)?456bp,編碼由 151 個(gè)氨基酸組成的蛋白質(zhì),預(yù)測(cè)該蛋白的分子量為 17.18kDa,預(yù)測(cè)等電點(diǎn)為 5.72(圖 3-1)。

外顯子,中華蜜蜂,基因結(jié)構(gòu),總長(zhǎng)度


山東農(nóng)業(yè)大學(xué)專業(yè)學(xué)位碩士學(xué)位論文為了進(jìn)一步了解中華蜜蜂 UBE2N 基因組的結(jié)構(gòu)特性,本實(shí)驗(yàn)對(duì)中華蜜蜂 UBE2N基因結(jié)構(gòu)組成進(jìn)行了分析,并與意大利蜜蜂(Apis mellifera)、埃及伊蚊(Aedes aegypti)、家蠅(Musca domestica)和麗蠅蛹集金小蜂(Nasonia vitripennis)的 UBE2N 基因組結(jié)構(gòu)組成進(jìn)行了比較(圖 3-2)。結(jié)果顯示,AccUBE2N 基因的全長(zhǎng)序列為 2579bp,由5'非翻譯區(qū)(5' untranslated regions,5' UTR)、3'非翻譯區(qū)(3' untranslated regions, 3'UTR)、2 個(gè)外顯子和 2 個(gè)內(nèi)含子組成(圖 3-1A)。比較不同昆蟲(chóng)的基因結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)盡管基因序列的總長(zhǎng)度具有較大差異,但都含有一個(gè)或兩個(gè)外顯子;不同昆蟲(chóng)外顯子的總長(zhǎng)度在進(jìn)化過(guò)程中呈現(xiàn)保守性,但位置大不相同。綜合考慮 UBE2N 基因全長(zhǎng)以及結(jié)構(gòu)組成的大小、位置,中華蜜蜂和意大利蜜蜂的 UBE2N 基因相結(jié)構(gòu)似度更高。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3231547

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