大豆抗病毒基因GmNH23的功能域分析及其SMV效應(yīng)蛋白的鑒定
發(fā)布時間:2021-06-12 23:18
植物體內(nèi)具有化學(xué)、物理、生物等多種策略抵抗病原體的入侵,植物防御系統(tǒng)中最重要的一種策略是依賴于由抗性基因(Resistance gene,R)編碼的蛋白,其能夠特異性識別病原體。大豆花葉病毒(Soybean mosaic virus,SMV)在全球大豆生產(chǎn)中是最普遍的病毒。SMV是Potyviridae家族中Potyvirus屬的成員,其基因組是單鏈正義RNA,編碼10種蛋白質(zhì),分別是P1、HC-Pro、P3、6K1、CI、6K2、NIa-VPg、NIa-Pro、NIb、CP。對不同SMV株系具有抗性的多個獨(dú)立抗性基因座已被鑒定,其中大多數(shù)是非Toll白介素受體-核苷酸結(jié)合位點(diǎn)-亮氨酸重復(fù)(Non-TIR-NBS-LRR)類型的R基因。煙草中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了抗TMV的N基因,N基因?qū)儆贜BS-LRR類的R基因。我們實(shí)驗(yàn)室的前期研究在大豆基因組上發(fā)現(xiàn)一個與N基因同源的并對TMV和SMV都具有抗性的基因,將其命名為GmNH23(Glycine max NHomolog 23)。本研究的目的是確定GmNH23編碼對SMV具有抗性的功能結(jié)構(gòu)域,將GmNH23蛋白按照結(jié)構(gòu)域預(yù)測網(wǎng)站將其分成5個部分,分...
【文章來源】:內(nèi)蒙古大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
大豆花葉病毒的基因組組織
內(nèi)蒙古大學(xué)碩士論文因分別簡稱為 p1、hc-pro、p3、6k1、ci、nia-vpg、nia-pro、nib、coat。本實(shí)驗(yàn)過表達(dá)載體為 pCAMBIA-Cluc,簡稱 pC-LUC。在載體上的多克隆位點(diǎn)內(nèi)選擇pn I 作為目的基因特異性引物的酶切位點(diǎn),由于 hc-pro 目的基因內(nèi)存在這兩個所以 hc-pro 使用 EcoRⅠ和 XholⅠ兩種酶切位點(diǎn)設(shè)計(jì)引物。利用 Primer3 軟件式合成引物:c-pro 外的目的基因引物設(shè)計(jì):Forward Primer 保護(hù)堿基+Sac I 酶切位點(diǎn)+分段基因上游引物Reverse Primer 保護(hù)堿基+ Kpn I 酶切位點(diǎn)+分段基因下游引物ro 引物設(shè)計(jì):Forward Primer 保護(hù)堿基+EcoR I 酶切位點(diǎn)+分段基因上游引物Reverse Primer 保護(hù)堿基+Xhol I 酶切位點(diǎn)+分段基因下游引物
tive control; 5-6: pGEM-T-duf and negative control; 7-8: pGEM-T-tn and negative control; 9-10: pGEM and negative control(b)DigestionidentificationofrecombinantplasmidsM:DM2000DNAMaker(frombottomtotop:1250 bp、500 bp、750 bp、1000 bp、2000 bp)1: pGEM-T-tir; 2: pGEM-T-nb; 3: pGEM-T-duf; 4: pGEM; 5: pGEM-T-nd3.2 GmNH23 截段基因過表達(dá)載體的構(gòu)建為了在植物中表達(dá) GmNH23 截段基因,將 3.1 中測序鑒定正確的目的基因構(gòu)建到植元表達(dá)載體 pC-LUC 中,得到的重組質(zhì)粒進(jìn)行質(zhì)粒 PCR 和酶切鑒定(如圖 3.2.1)。顯示 GmNH23 的 5 個截段基因的植物雙元載體均構(gòu)建成功。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大豆對大豆花葉病毒SC-11株系抗性的遺傳及基因定位[J]. 白麗,李海朝,馬瑩,王大剛,劉寧,智海劍. 大豆科學(xué). 2009(01)
[2]大豆抗花葉病毒及耐疫霉根腐病的SSR標(biāo)記分析[J]. 盧雙勇,韓英鵬,滕衛(wèi)麗,李文濱. 大豆科學(xué). 2008(05)
[3]大豆對SMVSC-13株系群的抗性遺傳及基因定位的研究[J]. 郭東全,王延偉,智海劍,蓋鈞鎰,李海朝,李凱. 大豆科學(xué). 2007(01)
[4]與大豆SMV3號株系抗性相關(guān)的分子標(biāo)記的鑒定[J]. 欒曉燕,李宗飛,滿為群,白羊年,馬巖松,劉鑫磊,鄭寶香,杜維廣. 分子植物育種. 2006(06)
[5]大豆SMV3號株系抗病基因的SSR標(biāo)記[J]. 滕衛(wèi)麗,李文濱,邱麗娟,韓英鵬,趙桂云,關(guān)榮霞,常汝鎮(zhèn). 大豆科學(xué). 2006(03)
[6]黃淮中北部大豆花葉病毒株系的鑒定與分布[J]. 郭東全,智海劍,王延偉,蓋鈞鎰,周新安,楊崇良,李凱,李海朝. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2005(04)
[7]大豆5個花葉病毒株系抗性基因的定位[J]. 王永軍,東方陽,王修強(qiáng),楊雅麟,喻德躍,蓋鈞鎰,吳曉雷,賀超英,張勁松,陳受宜. 遺傳學(xué)報(bào). 2004(01)
[8]黃淮和長江中下游地區(qū)大豆花葉病毒株系鑒定與分布[J]. 王修強(qiáng),蓋鈞鎰,濮祖芹. 大豆科學(xué). 2003(02)
[9]大豆對SMV3號株系的抗性遺傳分析及抗病基因的RAPD標(biāo)記研究[J]. 鄭翠明,常汝鎮(zhèn),邱麗娟. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2001(01)
本文編號:3226492
【文章來源】:內(nèi)蒙古大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
大豆花葉病毒的基因組組織
內(nèi)蒙古大學(xué)碩士論文因分別簡稱為 p1、hc-pro、p3、6k1、ci、nia-vpg、nia-pro、nib、coat。本實(shí)驗(yàn)過表達(dá)載體為 pCAMBIA-Cluc,簡稱 pC-LUC。在載體上的多克隆位點(diǎn)內(nèi)選擇pn I 作為目的基因特異性引物的酶切位點(diǎn),由于 hc-pro 目的基因內(nèi)存在這兩個所以 hc-pro 使用 EcoRⅠ和 XholⅠ兩種酶切位點(diǎn)設(shè)計(jì)引物。利用 Primer3 軟件式合成引物:c-pro 外的目的基因引物設(shè)計(jì):Forward Primer 保護(hù)堿基+Sac I 酶切位點(diǎn)+分段基因上游引物Reverse Primer 保護(hù)堿基+ Kpn I 酶切位點(diǎn)+分段基因下游引物ro 引物設(shè)計(jì):Forward Primer 保護(hù)堿基+EcoR I 酶切位點(diǎn)+分段基因上游引物Reverse Primer 保護(hù)堿基+Xhol I 酶切位點(diǎn)+分段基因下游引物
tive control; 5-6: pGEM-T-duf and negative control; 7-8: pGEM-T-tn and negative control; 9-10: pGEM and negative control(b)DigestionidentificationofrecombinantplasmidsM:DM2000DNAMaker(frombottomtotop:1250 bp、500 bp、750 bp、1000 bp、2000 bp)1: pGEM-T-tir; 2: pGEM-T-nb; 3: pGEM-T-duf; 4: pGEM; 5: pGEM-T-nd3.2 GmNH23 截段基因過表達(dá)載體的構(gòu)建為了在植物中表達(dá) GmNH23 截段基因,將 3.1 中測序鑒定正確的目的基因構(gòu)建到植元表達(dá)載體 pC-LUC 中,得到的重組質(zhì)粒進(jìn)行質(zhì)粒 PCR 和酶切鑒定(如圖 3.2.1)。顯示 GmNH23 的 5 個截段基因的植物雙元載體均構(gòu)建成功。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大豆對大豆花葉病毒SC-11株系抗性的遺傳及基因定位[J]. 白麗,李海朝,馬瑩,王大剛,劉寧,智海劍. 大豆科學(xué). 2009(01)
[2]大豆抗花葉病毒及耐疫霉根腐病的SSR標(biāo)記分析[J]. 盧雙勇,韓英鵬,滕衛(wèi)麗,李文濱. 大豆科學(xué). 2008(05)
[3]大豆對SMVSC-13株系群的抗性遺傳及基因定位的研究[J]. 郭東全,王延偉,智海劍,蓋鈞鎰,李海朝,李凱. 大豆科學(xué). 2007(01)
[4]與大豆SMV3號株系抗性相關(guān)的分子標(biāo)記的鑒定[J]. 欒曉燕,李宗飛,滿為群,白羊年,馬巖松,劉鑫磊,鄭寶香,杜維廣. 分子植物育種. 2006(06)
[5]大豆SMV3號株系抗病基因的SSR標(biāo)記[J]. 滕衛(wèi)麗,李文濱,邱麗娟,韓英鵬,趙桂云,關(guān)榮霞,常汝鎮(zhèn). 大豆科學(xué). 2006(03)
[6]黃淮中北部大豆花葉病毒株系的鑒定與分布[J]. 郭東全,智海劍,王延偉,蓋鈞鎰,周新安,楊崇良,李凱,李海朝. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2005(04)
[7]大豆5個花葉病毒株系抗性基因的定位[J]. 王永軍,東方陽,王修強(qiáng),楊雅麟,喻德躍,蓋鈞鎰,吳曉雷,賀超英,張勁松,陳受宜. 遺傳學(xué)報(bào). 2004(01)
[8]黃淮和長江中下游地區(qū)大豆花葉病毒株系鑒定與分布[J]. 王修強(qiáng),蓋鈞鎰,濮祖芹. 大豆科學(xué). 2003(02)
[9]大豆對SMV3號株系的抗性遺傳分析及抗病基因的RAPD標(biāo)記研究[J]. 鄭翠明,常汝鎮(zhèn),邱麗娟. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2001(01)
本文編號:3226492
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