目的通過腫瘤數(shù)據(jù)庫分析SOX基因家族在肝癌中的表達,及其對肝癌患者預(yù)后的影響。方法采用cBioPortal數(shù)據(jù)庫檢索分析SOX基因家族中12個基因在肝癌組織中的突變頻率及變異情況;利用Ualcan數(shù)據(jù)庫比較分析肝癌組織及癌旁組織中12個基因mRNA的表達;結(jié)合Kaplan-Meier plotter數(shù)據(jù)庫的臨床信息進一步分析SOX基因家族中12個基因在肝癌患者中潛在的預(yù)后價值。結(jié)果 SOX基因家族大多數(shù)成員擴增突變,SOX15為缺失突變。SOX4、SOX8、SOX11、SOX12、SOX15、SOX17、SOX18及SOX21基因在肝癌組織中mRNA表達均高于癌旁組織（P <0.05）,SOX1、SOX3、SOX14及SRY基因差異無統(tǒng)計學意義（P> 0.05）。SOX1、SOX3、SOX8、SOX14、SOX15、SOX17、SOX18、SOX21及SRY基因在肝癌患者中的表達均上調(diào)（HR <1,Logrank P <0.05）,利于患者預(yù)后;SOX4、SOX11及SOX12基因高表達與患者不良預(yù)后相關(guān)（HR> 1,Logrank P <0.05）... 

【文章來源】：中國生物制品學雜志. 2020,33(11)CSCD

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

SOX家族基因在不同類型肝癌中的突變頻率

SOX家族基因在肝癌中變異情況

SOX1及SOX3在1、2和3期肝癌組織中的表達均明顯上調(diào)（HR<1,Logrank P<0.05），利于預(yù)后，與乙肝病毒感染和酒精攝取無關(guān)。SOX4在2和3期肝癌組織中的表達均明顯下調(diào)（HR>1,Logrank P<0.05），不利于預(yù)后，而在1期非酒精性及非病毒性肝癌組織中的表達明顯上調(diào)（HR<1,Logrank P<0.05），利于預(yù)后，SOX4與酒精性及病毒性肝癌患者預(yù)后相關(guān)性差異無統(tǒng)計學意義（Logrank P>0.05）。SOX8在1、2和3期乙肝病毒性、非病毒性及非酒精性肝癌組織中的表達均明顯上調(diào)（HR<1,Logrank P<0.05），利于預(yù)后，而SOX8與酒精性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學意義（Logrank P>0.05）。SOX11在1和3期肝癌組織中的表達均明顯下調(diào)（HR>1,Logrank P<0.05），與預(yù)后不良相關(guān)，與2期患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學意義（Logrank P>0.05），與乙肝病毒感染及酒精攝取無關(guān)。SOX12在3期非乙肝病毒性、酒精性及非酒精性肝癌組織中的表達均明顯下調(diào)（HR>1,Logrank P<0.05），與預(yù)后不良相關(guān)，而在1和2期病毒性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學意義（Logrank P>0.05）。SOX14及SRY在肝癌組織中的表達均明顯上調(diào)（HR<1,Logrank P<0.05），利于預(yù)后，與乙肝病毒感染、酒精攝及腫瘤分期無關(guān)。SOX15在2和3期乙肝病毒性、非病毒性及非酒精性肝癌組織中的表達均明顯上調(diào)（HR<1,Logrank P<0.05），利于預(yù)后，而與1期乙肝病毒性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學意義（Logrank P>0.05）。SOX18在1期乙肝病毒性、非病毒性及非酒精性肝癌組織中的表達均明顯上調(diào)（HR<1,Logrank P<0.05），利于預(yù)后，而與1和3期乙肝病毒性及酒精性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學意義（Logrank P>0.05）。SOX21在非乙肝病毒性肝癌中的表達明顯上調(diào)（HR<1,Logrank P<0.05），利于預(yù)后，與乙肝病毒性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學意義（Logrank P>0.05），與腫瘤分期及酒精攝取無關(guān)。見表1～3和圖4。圖4 肝癌患者SOX家族基因的OS分析


本文編號：3226554