基于腫瘤數(shù)據(jù)庫分析SOX基因家族在肝癌中的表達(dá)及預(yù)后意義
發(fā)布時間:2021-06-12 23:53
目的通過腫瘤數(shù)據(jù)庫分析SOX基因家族在肝癌中的表達(dá),及其對肝癌患者預(yù)后的影響。方法采用cBioPortal數(shù)據(jù)庫檢索分析SOX基因家族中12個基因在肝癌組織中的突變頻率及變異情況;利用Ualcan數(shù)據(jù)庫比較分析肝癌組織及癌旁組織中12個基因mRNA的表達(dá);結(jié)合Kaplan-Meier plotter數(shù)據(jù)庫的臨床信息進(jìn)一步分析SOX基因家族中12個基因在肝癌患者中潛在的預(yù)后價值。結(jié)果 SOX基因家族大多數(shù)成員擴增突變,SOX15為缺失突變。SOX4、SOX8、SOX11、SOX12、SOX15、SOX17、SOX18及SOX21基因在肝癌組織中mRNA表達(dá)均高于癌旁組織(P <0.05),SOX1、SOX3、SOX14及SRY基因差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P> 0.05)。SOX1、SOX3、SOX8、SOX14、SOX15、SOX17、SOX18、SOX21及SRY基因在肝癌患者中的表達(dá)均上調(diào)(HR <1,Logrank P <0.05),利于患者預(yù)后;SOX4、SOX11及SOX12基因高表達(dá)與患者不良預(yù)后相關(guān)(HR> 1,Logrank P <0.05)...
【文章來源】:中國生物制品學(xué)雜志. 2020,33(11)CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
SOX家族基因在不同類型肝癌中的突變頻率
SOX家族基因在肝癌中變異情況
SOX1及SOX3在1、2和3期肝癌組織中的表達(dá)均明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,與乙肝病毒感染和酒精攝取無關(guān)。SOX4在2和3期肝癌組織中的表達(dá)均明顯下調(diào)(HR>1,Logrank P<0.05),不利于預(yù)后,而在1期非酒精性及非病毒性肝癌組織中的表達(dá)明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,SOX4與酒精性及病毒性肝癌患者預(yù)后相關(guān)性差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05)。SOX8在1、2和3期乙肝病毒性、非病毒性及非酒精性肝癌組織中的表達(dá)均明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,而SOX8與酒精性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05)。SOX11在1和3期肝癌組織中的表達(dá)均明顯下調(diào)(HR>1,Logrank P<0.05),與預(yù)后不良相關(guān),與2期患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05),與乙肝病毒感染及酒精攝取無關(guān)。SOX12在3期非乙肝病毒性、酒精性及非酒精性肝癌組織中的表達(dá)均明顯下調(diào)(HR>1,Logrank P<0.05),與預(yù)后不良相關(guān),而在1和2期病毒性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05)。SOX14及SRY在肝癌組織中的表達(dá)均明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,與乙肝病毒感染、酒精攝及腫瘤分期無關(guān)。SOX15在2和3期乙肝病毒性、非病毒性及非酒精性肝癌組織中的表達(dá)均明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,而與1期乙肝病毒性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05)。SOX18在1期乙肝病毒性、非病毒性及非酒精性肝癌組織中的表達(dá)均明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,而與1和3期乙肝病毒性及酒精性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05)。SOX21在非乙肝病毒性肝癌中的表達(dá)明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,與乙肝病毒性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05),與腫瘤分期及酒精攝取無關(guān)。見表1~3和圖4。圖4 肝癌患者SOX家族基因的OS分析
本文編號:3226554
【文章來源】:中國生物制品學(xué)雜志. 2020,33(11)CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
SOX家族基因在不同類型肝癌中的突變頻率
SOX家族基因在肝癌中變異情況
SOX1及SOX3在1、2和3期肝癌組織中的表達(dá)均明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,與乙肝病毒感染和酒精攝取無關(guān)。SOX4在2和3期肝癌組織中的表達(dá)均明顯下調(diào)(HR>1,Logrank P<0.05),不利于預(yù)后,而在1期非酒精性及非病毒性肝癌組織中的表達(dá)明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,SOX4與酒精性及病毒性肝癌患者預(yù)后相關(guān)性差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05)。SOX8在1、2和3期乙肝病毒性、非病毒性及非酒精性肝癌組織中的表達(dá)均明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,而SOX8與酒精性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05)。SOX11在1和3期肝癌組織中的表達(dá)均明顯下調(diào)(HR>1,Logrank P<0.05),與預(yù)后不良相關(guān),與2期患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05),與乙肝病毒感染及酒精攝取無關(guān)。SOX12在3期非乙肝病毒性、酒精性及非酒精性肝癌組織中的表達(dá)均明顯下調(diào)(HR>1,Logrank P<0.05),與預(yù)后不良相關(guān),而在1和2期病毒性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05)。SOX14及SRY在肝癌組織中的表達(dá)均明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,與乙肝病毒感染、酒精攝及腫瘤分期無關(guān)。SOX15在2和3期乙肝病毒性、非病毒性及非酒精性肝癌組織中的表達(dá)均明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,而與1期乙肝病毒性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05)。SOX18在1期乙肝病毒性、非病毒性及非酒精性肝癌組織中的表達(dá)均明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,而與1和3期乙肝病毒性及酒精性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05)。SOX21在非乙肝病毒性肝癌中的表達(dá)明顯上調(diào)(HR<1,Logrank P<0.05),利于預(yù)后,與乙肝病毒性肝癌患者預(yù)后差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Logrank P>0.05),與腫瘤分期及酒精攝取無關(guān)。見表1~3和圖4。圖4 肝癌患者SOX家族基因的OS分析
本文編號:3226554
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