本研究基于甘薯（Ipomoea batatas（L.） Lam.）與綠原酸合成代謝相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)克隆了苯丙氨酸解氨酶基因Ib PAL,通過蛋白序列比對(duì)、系統(tǒng)進(jìn)化分析、二級(jí)和三維蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、跨膜結(jié)構(gòu)域以及啟動(dòng)子分析,對(duì)該基因的氨基酸序列和啟動(dòng)子序列的結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行了解析;通過qRT-PCR技術(shù)分析該基因在不同甘薯品種的根、莖、莖尖和葉中的表達(dá)情況,并對(duì)其進(jìn)行亞細(xì)胞定位驗(yàn)證。結(jié)果顯示,Ib PAL的CDS序列全長2130 bp,編碼709個(gè)氨基酸。其氨基酸序列與已知物種的氨基酸序列同源性在80%以上。Ib PAL蛋白以α螺旋和隨機(jī)卷曲為主,具有1個(gè)可能的跨膜螺旋區(qū)。該基因啟動(dòng)子中包含多個(gè)順式作用元件。表達(dá)模式分析結(jié)果表明,Ib PAL主要在莖和莖尖中表達(dá),其在甘薯品種‘EC16’4個(gè)組織器官中的表達(dá)量均顯著高于其他品種。亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示該基因在細(xì)胞膜和細(xì)胞核上均可以表達(dá)。 

【文章來源】：植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2020,38(03)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

甘薯Ib PAL基因的克隆

本研究分別提取甘薯品種‘EC15’、‘EC16’、‘福菜薯18’和‘福薯7-6’的根、莖、莖尖和葉進(jìn)行qRT-PCR分析。結(jié)果表明(圖6)，在根和莖中，‘EC16’的IbPAL基因表達(dá)量極顯著高于其他品種，‘EC15’與‘福菜薯18’、‘福薯7-6’之間沒有顯著差異;在莖尖中，‘EC16’極顯著高于其他品種，‘福薯7-6’極顯著低于其他品種;在葉中，4個(gè)品種之間均存在極顯著差異�！瓻C16’的4個(gè)組織器官中，IbPAL基因的表達(dá)量均顯著高于其他品種。圖4 Ib PAL蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)

Ib PAL蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3217881