白斑綜合征病毒wsv-pol和wsv006的變異分析及與宿主互作基因的篩選
發(fā)布時間:2021-05-31 13:29
白斑綜合征病毒(White Spot Syndrome Virus,WSSV)作為對蝦養(yǎng)殖中存在的代表性病原之一,一直受到全球?qū)ξr養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的廣泛關(guān)注,但其致病分子機(jī)制卻未明確。本文以2016-2017年從我國部分地區(qū)的對蝦養(yǎng)殖病害區(qū)采集到的患病對蝦為樣本,以WSSV DNA聚合酶基因—wsv-pol和wsv006基因為研究對象,從其變異情況以及與宿主互作基因的篩選兩個方面進(jìn)行研究。主要研究結(jié)果如下:第一部分:為研究wsv-pol、wsv006基因的變異情況,本研究通過特異性擴(kuò)增wsv-pol功能區(qū)以及wsv006全長核苷酸序列,比較核苷酸及氨基酸的變化情況,分析WSSV在不同地區(qū)的分子流行病學(xué)變異特征。本實驗取用2016和2017年1-7月在全國18個地區(qū)的WSSV病害爆發(fā)區(qū)采集的91份患病樣本,用特異性引物擴(kuò)增目的片段,繼而連接轉(zhuǎn)化后進(jìn)行測序,并對測序結(jié)果進(jìn)行分析。wsv-pol擴(kuò)增結(jié)果顯示,2016年的47份樣本中,只在山東日照、河北滄州和河北唐山三個地區(qū)的樣本中出現(xiàn)目的條帶,檢出率為17%;在2017年的44份樣本中,只在福建霞美鎮(zhèn)、廣東湛江、山東東營和上海四個地區(qū)的樣本中檢測出...
【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
wsv-pol在2017年樣本中的擴(kuò)增結(jié)果
圖 2-2 wsv-pol 在 2017 年樣本中的擴(kuò)增結(jié)果。M:DNA 分子標(biāo)準(zhǔn)量;1-44:2017 年樣本;+:陽性對照;-:陰圖 2-1 wsv-pol 在 2016 年樣本中的擴(kuò)增結(jié)果。M:DNA 分子標(biāo)準(zhǔn)量;1-47:2016 年樣本;+:陽性對照;-:陰gure 2-1 Amplification result of wsv-pol target fragment from samples ie: M: DNAMaker ; 1-47: samples in 2016;+:positive control;-:negativ
圖 2-3 wsv006 在 2016 年樣本中的擴(kuò)增結(jié)果。:M:DNA 分子標(biāo)準(zhǔn)量;1-47:2016 年樣本;+:陽性對照;-:陰性對照Figure 2-3 Amplification result of wsv006 target fragment from samples in 2016.ote: M: DNAMaker ; 1-47: samples in 2016;+:positive control;-:negative contr
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]擬南芥CARK4與RCAR12相互作用的研究[J]. 陳靜波,李小意,李晶祥,黃琪,李旭鋒,楊毅. 四川大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(02)
[2]酵母雙雜交技術(shù)在病原生物蛋白質(zhì)研究中的應(yīng)用[J]. 劉紹偉,王洋,田喜鳳. 中國病原生物學(xué)雜志. 2018(02)
[3]線粒體:能量、信號、功能的調(diào)控樞紐[J]. 鄭銘. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2018(01)
[4]應(yīng)用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選LKB1相互作用蛋白[J]. 徐卿,李洪濤,林峰,姚陽. 安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2018(02)
[5]桿狀病毒經(jīng)口感染因子之間相互作用分析[J]. 鄭秦,范穎,王海萍,許偉凡,孔祥碩,吳小鋒. 病毒學(xué)報. 2018(01)
[6]丹參均一化酵母雙雜交文庫的構(gòu)建及與SmJAZ8互作蛋白的篩選[J]. 楊夢丹,趙英,麻鵬達(dá). 中國中藥雜志. 2018(03)
[7]線粒體遺傳系統(tǒng)與線粒體疾病概述[J]. 范艷艷,吳姣榕,肖義軍. 生物學(xué)教學(xué). 2018(01)
[8]應(yīng)用同源重組技術(shù)快速構(gòu)建乙型流感M蛋白通用疫苗的表達(dá)載體[J]. 高承剛,楊偉,李衛(wèi)東,伍胤杰,鄭俊杰,李開偉,釧鴻云,趙衛(wèi)中,鄭勇,史小軍,廖國陽. 西部醫(yī)學(xué). 2017(08)
[9]氨氮脅迫下白斑綜合征病毒對凡納濱對蝦的致病性[J]. 方金龍,王元,房文紅,李新蒼,陳甜甜,周俊芳. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2017(04)
[10]對蝦養(yǎng)殖現(xiàn)狀、發(fā)展趨勢與對策的思考[J]. 李海波. 旅游縱覽(下半月). 2017(01)
博士論文
[1]利用酵母雙雜交解析WSSV感染凡納濱對蝦途徑的研究[D]. 謝世筠.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2016
[2]中國對蝦(Fenneropenaeus chinensis)抗白斑綜合征病毒(WSSV)候選基因分析[D]. 李旭鵬.中國海洋大學(xué) 2014
[3]對蝦白斑綜合癥病毒性質(zhì)和蛋白激酶wsv083的研究[D]. 秦崇濤.福建農(nóng)林大學(xué) 2012
[4]同源重組技術(shù)在釀酒酵母表達(dá)載體構(gòu)建中的應(yīng)用[D]. 陳向嶺.復(fù)旦大學(xué) 2005
碩士論文
[1]日本對蝦類甲殼肽(crustin-like)基因在溶藻弧菌和白斑綜合征病毒感染過程中的作用機(jī)制研究[D]. 孫保貞.浙江農(nóng)林大學(xué) 2017
[2]COP9信號亞基5在日本囊對蝦中的抗病毒功能研究[D]. 張強(qiáng).山東大學(xué) 2017
[3]對蝦白斑綜合征病毒(WSSV)三個基因的變異、克隆表達(dá)及其在WSSV感染中的作用[D]. 秦夢雪.上海海洋大學(xué) 2017
[4]WSSV流行變異比較及不同毒株致病差異分析[D]. 孫新穎.上海海洋大學(xué) 2016
[5]HD-3復(fù)方中草藥對凡納濱對蝦免疫酶影響和抗WSSV感染分析[D]. 景亞運.大連海洋大學(xué) 2016
[6]基于細(xì)胞培養(yǎng)篩選抗對蝦白斑綜合征病毒(WSSV)中草藥及其實驗效果評價[D]. 國子娟.上海海洋大學(xué) 2014
[7]乳鏈菌腫瘤特異性標(biāo)記系統(tǒng)及跨界thyA同源重組載體的構(gòu)建[D]. 陳雅瑩.廣州醫(yī)科大學(xué) 2014
[8]利用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選家蠶BR-C轉(zhuǎn)錄因子的相互作用蛋白[D]. 王永虎.西南大學(xué) 2013
[9]齊墩果酸衍生物的合成與表征及其抑菌活性的研究[D]. 賀興隆.遼寧師范大學(xué) 2011
本文編號:3208353
【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
wsv-pol在2017年樣本中的擴(kuò)增結(jié)果
圖 2-2 wsv-pol 在 2017 年樣本中的擴(kuò)增結(jié)果。M:DNA 分子標(biāo)準(zhǔn)量;1-44:2017 年樣本;+:陽性對照;-:陰圖 2-1 wsv-pol 在 2016 年樣本中的擴(kuò)增結(jié)果。M:DNA 分子標(biāo)準(zhǔn)量;1-47:2016 年樣本;+:陽性對照;-:陰gure 2-1 Amplification result of wsv-pol target fragment from samples ie: M: DNAMaker ; 1-47: samples in 2016;+:positive control;-:negativ
圖 2-3 wsv006 在 2016 年樣本中的擴(kuò)增結(jié)果。:M:DNA 分子標(biāo)準(zhǔn)量;1-47:2016 年樣本;+:陽性對照;-:陰性對照Figure 2-3 Amplification result of wsv006 target fragment from samples in 2016.ote: M: DNAMaker ; 1-47: samples in 2016;+:positive control;-:negative contr
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]擬南芥CARK4與RCAR12相互作用的研究[J]. 陳靜波,李小意,李晶祥,黃琪,李旭鋒,楊毅. 四川大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(02)
[2]酵母雙雜交技術(shù)在病原生物蛋白質(zhì)研究中的應(yīng)用[J]. 劉紹偉,王洋,田喜鳳. 中國病原生物學(xué)雜志. 2018(02)
[3]線粒體:能量、信號、功能的調(diào)控樞紐[J]. 鄭銘. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2018(01)
[4]應(yīng)用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選LKB1相互作用蛋白[J]. 徐卿,李洪濤,林峰,姚陽. 安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2018(02)
[5]桿狀病毒經(jīng)口感染因子之間相互作用分析[J]. 鄭秦,范穎,王海萍,許偉凡,孔祥碩,吳小鋒. 病毒學(xué)報. 2018(01)
[6]丹參均一化酵母雙雜交文庫的構(gòu)建及與SmJAZ8互作蛋白的篩選[J]. 楊夢丹,趙英,麻鵬達(dá). 中國中藥雜志. 2018(03)
[7]線粒體遺傳系統(tǒng)與線粒體疾病概述[J]. 范艷艷,吳姣榕,肖義軍. 生物學(xué)教學(xué). 2018(01)
[8]應(yīng)用同源重組技術(shù)快速構(gòu)建乙型流感M蛋白通用疫苗的表達(dá)載體[J]. 高承剛,楊偉,李衛(wèi)東,伍胤杰,鄭俊杰,李開偉,釧鴻云,趙衛(wèi)中,鄭勇,史小軍,廖國陽. 西部醫(yī)學(xué). 2017(08)
[9]氨氮脅迫下白斑綜合征病毒對凡納濱對蝦的致病性[J]. 方金龍,王元,房文紅,李新蒼,陳甜甜,周俊芳. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2017(04)
[10]對蝦養(yǎng)殖現(xiàn)狀、發(fā)展趨勢與對策的思考[J]. 李海波. 旅游縱覽(下半月). 2017(01)
博士論文
[1]利用酵母雙雜交解析WSSV感染凡納濱對蝦途徑的研究[D]. 謝世筠.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2016
[2]中國對蝦(Fenneropenaeus chinensis)抗白斑綜合征病毒(WSSV)候選基因分析[D]. 李旭鵬.中國海洋大學(xué) 2014
[3]對蝦白斑綜合癥病毒性質(zhì)和蛋白激酶wsv083的研究[D]. 秦崇濤.福建農(nóng)林大學(xué) 2012
[4]同源重組技術(shù)在釀酒酵母表達(dá)載體構(gòu)建中的應(yīng)用[D]. 陳向嶺.復(fù)旦大學(xué) 2005
碩士論文
[1]日本對蝦類甲殼肽(crustin-like)基因在溶藻弧菌和白斑綜合征病毒感染過程中的作用機(jī)制研究[D]. 孫保貞.浙江農(nóng)林大學(xué) 2017
[2]COP9信號亞基5在日本囊對蝦中的抗病毒功能研究[D]. 張強(qiáng).山東大學(xué) 2017
[3]對蝦白斑綜合征病毒(WSSV)三個基因的變異、克隆表達(dá)及其在WSSV感染中的作用[D]. 秦夢雪.上海海洋大學(xué) 2017
[4]WSSV流行變異比較及不同毒株致病差異分析[D]. 孫新穎.上海海洋大學(xué) 2016
[5]HD-3復(fù)方中草藥對凡納濱對蝦免疫酶影響和抗WSSV感染分析[D]. 景亞運.大連海洋大學(xué) 2016
[6]基于細(xì)胞培養(yǎng)篩選抗對蝦白斑綜合征病毒(WSSV)中草藥及其實驗效果評價[D]. 國子娟.上海海洋大學(xué) 2014
[7]乳鏈菌腫瘤特異性標(biāo)記系統(tǒng)及跨界thyA同源重組載體的構(gòu)建[D]. 陳雅瑩.廣州醫(yī)科大學(xué) 2014
[8]利用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選家蠶BR-C轉(zhuǎn)錄因子的相互作用蛋白[D]. 王永虎.西南大學(xué) 2013
[9]齊墩果酸衍生物的合成與表征及其抑菌活性的研究[D]. 賀興隆.遼寧師范大學(xué) 2011
本文編號:3208353
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