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白斑綜合征病毒wsv-pol和wsv006的變異分析及與宿主互作基因的篩選

發(fā)布時間:2021-05-31 13:29
  白斑綜合征病毒(White Spot Syndrome Virus,WSSV)作為對蝦養(yǎng)殖中存在的代表性病原之一,一直受到全球?qū)ξr養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的廣泛關(guān)注,但其致病分子機(jī)制卻未明確。本文以2016-2017年從我國部分地區(qū)的對蝦養(yǎng)殖病害區(qū)采集到的患病對蝦為樣本,以WSSV DNA聚合酶基因—wsv-pol和wsv006基因為研究對象,從其變異情況以及與宿主互作基因的篩選兩個方面進(jìn)行研究。主要研究結(jié)果如下:第一部分:為研究wsv-pol、wsv006基因的變異情況,本研究通過特異性擴(kuò)增wsv-pol功能區(qū)以及wsv006全長核苷酸序列,比較核苷酸及氨基酸的變化情況,分析WSSV在不同地區(qū)的分子流行病學(xué)變異特征。本實驗取用2016和2017年1-7月在全國18個地區(qū)的WSSV病害爆發(fā)區(qū)采集的91份患病樣本,用特異性引物擴(kuò)增目的片段,繼而連接轉(zhuǎn)化后進(jìn)行測序,并對測序結(jié)果進(jìn)行分析。wsv-pol擴(kuò)增結(jié)果顯示,2016年的47份樣本中,只在山東日照、河北滄州和河北唐山三個地區(qū)的樣本中出現(xiàn)目的條帶,檢出率為17%;在2017年的44份樣本中,只在福建霞美鎮(zhèn)、廣東湛江、山東東營和上海四個地區(qū)的樣本中檢測出... 

【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】:90 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

白斑綜合征病毒wsv-pol和wsv006的變異分析及與宿主互作基因的篩選


wsv-pol在2017年樣本中的擴(kuò)增結(jié)果

陽性對照,陰圖,樣本


圖 2-2 wsv-pol 在 2017 年樣本中的擴(kuò)增結(jié)果。M:DNA 分子標(biāo)準(zhǔn)量;1-44:2017 年樣本;+:陽性對照;-:陰圖 2-1 wsv-pol 在 2016 年樣本中的擴(kuò)增結(jié)果。M:DNA 分子標(biāo)準(zhǔn)量;1-47:2016 年樣本;+:陽性對照;-:陰gure 2-1 Amplification result of wsv-pol target fragment from samples ie: M: DNAMaker ; 1-47: samples in 2016;+:positive control;-:negativ

陽性對照,樣本


圖 2-3 wsv006 在 2016 年樣本中的擴(kuò)增結(jié)果。:M:DNA 分子標(biāo)準(zhǔn)量;1-47:2016 年樣本;+:陽性對照;-:陰性對照Figure 2-3 Amplification result of wsv006 target fragment from samples in 2016.ote: M: DNAMaker ; 1-47: samples in 2016;+:positive control;-:negative contr

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[4]應(yīng)用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選LKB1相互作用蛋白[J]. 徐卿,李洪濤,林峰,姚陽.  安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2018(02)
[5]桿狀病毒經(jīng)口感染因子之間相互作用分析[J]. 鄭秦,范穎,王海萍,許偉凡,孔祥碩,吳小鋒.  病毒學(xué)報. 2018(01)
[6]丹參均一化酵母雙雜交文庫的構(gòu)建及與SmJAZ8互作蛋白的篩選[J]. 楊夢丹,趙英,麻鵬達(dá).  中國中藥雜志. 2018(03)
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博士論文
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[4]同源重組技術(shù)在釀酒酵母表達(dá)載體構(gòu)建中的應(yīng)用[D]. 陳向嶺.復(fù)旦大學(xué) 2005

碩士論文
[1]日本對蝦類甲殼肽(crustin-like)基因在溶藻弧菌和白斑綜合征病毒感染過程中的作用機(jī)制研究[D]. 孫保貞.浙江農(nóng)林大學(xué) 2017
[2]COP9信號亞基5在日本囊對蝦中的抗病毒功能研究[D]. 張強(qiáng).山東大學(xué) 2017
[3]對蝦白斑綜合征病毒(WSSV)三個基因的變異、克隆表達(dá)及其在WSSV感染中的作用[D]. 秦夢雪.上海海洋大學(xué) 2017
[4]WSSV流行變異比較及不同毒株致病差異分析[D]. 孫新穎.上海海洋大學(xué) 2016
[5]HD-3復(fù)方中草藥對凡納濱對蝦免疫酶影響和抗WSSV感染分析[D]. 景亞運.大連海洋大學(xué) 2016
[6]基于細(xì)胞培養(yǎng)篩選抗對蝦白斑綜合征病毒(WSSV)中草藥及其實驗效果評價[D]. 國子娟.上海海洋大學(xué) 2014
[7]乳鏈菌腫瘤特異性標(biāo)記系統(tǒng)及跨界thyA同源重組載體的構(gòu)建[D]. 陳雅瑩.廣州醫(yī)科大學(xué) 2014
[8]利用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選家蠶BR-C轉(zhuǎn)錄因子的相互作用蛋白[D]. 王永虎.西南大學(xué) 2013
[9]齊墩果酸衍生物的合成與表征及其抑菌活性的研究[D]. 賀興隆.遼寧師范大學(xué) 2011



本文編號:3208353

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