以十五年生‘綠嶺’核桃樹為試材,采用高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的方法,研究了不同地溫（地溫16.4℃,W0;地溫21.7℃,W1;地溫27.1℃,W2）對(duì)核桃根系基因表達(dá)量的影響,以期挖掘與溫度調(diào)控相關(guān)的功能基因,探明自然溫度調(diào)控下核桃根系的應(yīng)答反應(yīng)的分子機(jī)制。結(jié)果表明:W1vsW0、W2vsW0和W2vsW1顯著上調(diào)基因分別為430、2 110、2 385個(gè),顯著下調(diào)基因分別為247、2 494、3 015個(gè)。GO富集分析表明,W1vsW0、W2vsW0和W2vsW1的差異表達(dá)基因均主要富集在生物學(xué)過程和分子功能兩大類別,共同顯著富集的GO類別有氨基糖分解代謝過程、單體生物合成過程、幾丁質(zhì)分解過程、含氨基葡萄糖化合物分解代謝過程、氧化還原過程和氧化還原酶活性;但W1vsW0的差異基因顯著富集的分子功能多與物質(zhì)的合成代謝相關(guān),而W2vsW1的差異基因顯著富集的分子功能多與轉(zhuǎn)錄因子相關(guān)。KEGG富集分析表明,W1vsW0、W2vsW0和W2vsW1的差異表達(dá)基因分別被注釋到74、118、117條KEGG代謝通路,共同被注釋到的有71條,其中顯著富集的通路有次生代謝產(chǎn)物的生物合成和苯丙烷生物合成等;... 

【文章來源】：北方園藝. 2020,(17)北大核心

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

差異表達(dá)基因分析火山圖

根系是植物從環(huán)境中攝取水分的主要途徑,植物根系水分傳導(dǎo)(LR)是根-土系統(tǒng)水分傳輸模擬和評(píng)價(jià)植物根系吸水功能的一個(gè)重要參數(shù),它受土壤水分條件和溫度等因素的綜合影響[19]。根系吸水能力隨土壤溫度的變化會(huì)發(fā)生相應(yīng)變化。根系中水分利用相關(guān)的基因表達(dá)量隨溫度升高的變化趨勢(shì)并不一致(圖5)。水通道蛋白TIP1-1和蛋白質(zhì)脫水誘導(dǎo)的19同源物6的表達(dá)量隨溫度的升高表現(xiàn)為先升高后降低的趨勢(shì),而且二者在高溫時(shí)的表達(dá)量要遠(yuǎn)低于其它2個(gè)溫度。脫水素-HIRD11的表達(dá)量與水通道蛋白TIP1-1和蛋白質(zhì)脫水誘導(dǎo)的19同源物6相比表現(xiàn)出相反的趨勢(shì),該基因在高溫時(shí)的表達(dá)量是其它2個(gè)溫度下表達(dá)量的10倍左右。結(jié)果表明,適當(dāng)?shù)脑鰷乜梢蕴岣咚值倪\(yùn)輸效率,但過高的溫度會(huì)使水分運(yùn)輸?shù)男鼠E然下降。圖5 水分利用相關(guān)基因的表達(dá)量

各樣品組合間差異表達(dá)基因繪制維恩圖(圖2)。其中圓圈代表比較組合,每個(gè)圓圈中的數(shù)字之和代表相互比較樣品的差異基因總個(gè)數(shù),圓圈重疊的部分表示其共有的差異基因。W1vsW0的差異表達(dá)基因和W2vsW0有303個(gè)是相同的;W1vsW0和W2vsW1有489個(gè)是相同的,W2vsW0的差異表達(dá)基因和W2vsW1有 3 783個(gè)是相同的;W1vsW0、W2vsW0和W2vsW1的差異表達(dá)基因有196個(gè)是相同的,其中顯著上調(diào)的基因有30個(gè),顯著下調(diào)的基因13個(gè),這43個(gè)顯著表達(dá)基因很可能在溫度調(diào)控中起著直接或間接的作用。2.4.2 差異基因GO富集分析

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號(hào)：3208211