利用隱馬可夫模型檢索和同源比對(duì)的方法,從茶樹基因組鑒定出108個(gè)NAC成員（CsNAC）.理化特征、進(jìn)化關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)和保守基序分析表明,CsNAC蛋白長度在134～1950個(gè)氨基酸之間,分子量介于15.4～222kD,等電點(diǎn)介于4.60～9.91,大部分為親水性蛋白（除CsNAC97）.其中,CsNAC3、8、14、23、32、74、82、90、106蛋白含跨膜結(jié)構(gòu)域.進(jìn)化分析將CsNAC家族分為18個(gè)亞類,ONAC022和NAP亞類成員最多,AtNAC3和OsNAC8亞類成員最少.CsNAC基因啟動(dòng)子區(qū)富含響應(yīng)干旱、低溫、鹽脅迫以及病原菌侵染的序列元件.據(jù)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析結(jié)果,CsNAC基因家族成員在不同組織和脅迫處理后呈現(xiàn)顯著的表達(dá)差異.低溫和干旱脅迫下的CsNAC共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)中,ABA參與調(diào)控其關(guān)鍵基因的表達(dá);KEGG分析顯示,信號(hào)傳遞、糖代謝、植物與病原菌互作等途徑存在顯著富集. 

【文章來源】：信陽師范學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,33(04)北大核心

【文章頁數(shù)】：12 頁

【文章目錄】：
0 引言
1 材料和方法
    1.1 茶樹NAC轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定和序列分析
    1.2 CsNAC基因家族系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
    1.3 CsNAC基因結(jié)構(gòu)和保守結(jié)構(gòu)域分析
    1.4 CsNAC基因啟動(dòng)子順式作用元件分析
    1.5 CsNAC基因表達(dá)分析
    1.6 CsNAC基因共表達(dá)和相互作用分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 茶樹NAC家族的組成及其分子特征
    2.2 CsNAC家族的系統(tǒng)進(jìn)化
    2.3 CsNAC的結(jié)構(gòu)和保守基序分析
    2.4 CsNAC基因啟動(dòng)子元件分析
    2.5 CsNAC基因的表達(dá)分析
    2.6 逆境反應(yīng)中CsNAC基因調(diào)控通路的功能富集及調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]茶樹TCP家族的全基因組鑒定及其表達(dá)分析[J]. 周棋贏,韓月華,祝悅,陳賽,李先文,彭波,袁紅雨.  園藝學(xué)報(bào). 2019(10)
[2]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能[J]. 張慧珍,白雪芹,曾幼玲.  植物生理學(xué)報(bào). 2019(07)
[3]小麥轉(zhuǎn)錄因子基因TaNAC67參與調(diào)控穗長和每穗小穗數(shù)[J]. 張宏娟,李玉瑩,苗麗麗,王景一,李超男,楊德龍,毛新國,景蕊蓮.  作物學(xué)報(bào). 2019(11)
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[5]轉(zhuǎn)錄因子NAC及其在植物生長發(fā)育中的作用[J]. 李桂玲,李思云,劉衛(wèi)群.  分子植物育種. 2019(03)



本文編號(hào)：3207738