象山港黃墩支港菲律賓蛤仔種群COI和ITS1基因序列特征及遺傳多樣性分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-10 22:12
為了解象山港黃墩支港菲律賓蛤仔種質(zhì)資源的遺傳多樣性現(xiàn)狀,采用COI和ITS1分子標(biāo)記對(duì)該種群進(jìn)行了基因序列特征和遺傳多樣性分析.結(jié)果表明:在該種群30個(gè)個(gè)體中擴(kuò)增得到的COI基因序列長(zhǎng)度均為709 bp,ITS1序列長(zhǎng)度范圍在693~729 bp(共有746個(gè)位點(diǎn)).COI基因序列的位點(diǎn)中有670個(gè)保守位點(diǎn)(占94.50%)、39個(gè)變異位點(diǎn)(占5.50%); ITS1序列的位點(diǎn)中有保守位點(diǎn)671個(gè)(占89.95%)、變異位點(diǎn)62個(gè)(占8.31%)和缺失/插入位點(diǎn)13個(gè)(占1.74%).COI基因序列的保守性高于ITS1序列.在COI基因序列中堿基(A+T)的占比(65.84%)高于(C+G),而ITS1序列中則是堿基(A+T)占比(37.59%)低于(C+G).COI和ITS1序列的遺傳距離分析均顯示群體內(nèi)遺傳分化不明顯.基于COI基因序列和ITS1序列構(gòu)建的遺傳進(jìn)化樹顯示:各科貝類分別相聚,象山港菲律賓蛤仔位于簾蛤科的分支中,其COI序列與雜色蛤進(jìn)化關(guān)系最近.遺傳進(jìn)化樹中各種貝類的聚類關(guān)系與傳統(tǒng)分類學(xué)結(jié)果相一致,可作為分類的參考. COI和ITS1序列的平均核苷酸差異數(shù)分別為5.49...
【文章來源】:寧波大學(xué)學(xué)報(bào)(理工版). 2020,33(06)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同地理群體菲律賓蛤仔表型性狀的相關(guān)性與通徑分析[J]. 梁健,王俊杰,郭永軍,李永仁,閆喜武. 水產(chǎn)科學(xué). 2020(01)
[2]基于GLM模型Logistic回歸的菲律賓蛤仔地理群體判別[J]. 董建宇,胡成業(yè),楊曉龍,李文濤,張秀梅. 海洋與湖沼. 2018(06)
[3]象山港大型底棲動(dòng)物生產(chǎn)力空間插值及模型比較[J]. 張夢(mèng)笛,呂粼,金狄狄,林霞,朱藝峰. 生態(tài)科學(xué). 2017(04)
[4]10個(gè)菲律賓蛤仔野生群體的遺傳多樣性研究[J]. 胡利莎,張振,馬培振,王海艷. 海洋與湖沼. 2016(03)
[5]菲律賓蛤仔人工選育群體與野生群體的遺傳多樣性分析[J]. 聶鴻濤,李佳,霍忠明,郭煒,閆喜武. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2016(03)
[6]菲律賓蛤仔ESTSSR標(biāo)記與生長(zhǎng)性狀的相關(guān)分析[J]. 牛泓博,聶鴻濤,朱德鵬,楊鳳,閆喜武. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2015(06)
[7]基于轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)的蛤仔微衛(wèi)星標(biāo)記篩選[J]. 閆路路,秦艷杰,閆喜武,王琳楠,畢成隆,張津源. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2015(05)
[8]菲律賓蛤仔EST-SSRs標(biāo)記開發(fā)及不同地理群體遺傳多樣性[J]. 閆喜武,虞志飛,秦艷杰,楊霏,王金海,張躍環(huán),楊鳳,張國(guó)范. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2011(15)
[9]毛蚶、泥蚶和魁蚶ITS1核苷酸序列分析[J]. 孫桂金,潘杰,劉可春,王雪,彭維兵,何秋霞,王思鋒. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(07)
[10]西施舌5個(gè)地理群體ITS1序列變異及系統(tǒng)發(fā)生分析[J]. 孟學(xué)平,高如承,申欣,王帥,程漢良,董志國(guó),閻斌倫. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2010(20)
碩士論文
[1]黑帽懸猴(Cebus apella)線粒體基因組全序列分析和菲律賓蛤仔(Ruditapes philippinarum)群體遺傳學(xué)研究[D]. 畢曉欣.魯東大學(xué) 2012
本文編號(hào):3180153
【文章來源】:寧波大學(xué)學(xué)報(bào)(理工版). 2020,33(06)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同地理群體菲律賓蛤仔表型性狀的相關(guān)性與通徑分析[J]. 梁健,王俊杰,郭永軍,李永仁,閆喜武. 水產(chǎn)科學(xué). 2020(01)
[2]基于GLM模型Logistic回歸的菲律賓蛤仔地理群體判別[J]. 董建宇,胡成業(yè),楊曉龍,李文濤,張秀梅. 海洋與湖沼. 2018(06)
[3]象山港大型底棲動(dòng)物生產(chǎn)力空間插值及模型比較[J]. 張夢(mèng)笛,呂粼,金狄狄,林霞,朱藝峰. 生態(tài)科學(xué). 2017(04)
[4]10個(gè)菲律賓蛤仔野生群體的遺傳多樣性研究[J]. 胡利莎,張振,馬培振,王海艷. 海洋與湖沼. 2016(03)
[5]菲律賓蛤仔人工選育群體與野生群體的遺傳多樣性分析[J]. 聶鴻濤,李佳,霍忠明,郭煒,閆喜武. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2016(03)
[6]菲律賓蛤仔ESTSSR標(biāo)記與生長(zhǎng)性狀的相關(guān)分析[J]. 牛泓博,聶鴻濤,朱德鵬,楊鳳,閆喜武. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2015(06)
[7]基于轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)的蛤仔微衛(wèi)星標(biāo)記篩選[J]. 閆路路,秦艷杰,閆喜武,王琳楠,畢成隆,張津源. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2015(05)
[8]菲律賓蛤仔EST-SSRs標(biāo)記開發(fā)及不同地理群體遺傳多樣性[J]. 閆喜武,虞志飛,秦艷杰,楊霏,王金海,張躍環(huán),楊鳳,張國(guó)范. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2011(15)
[9]毛蚶、泥蚶和魁蚶ITS1核苷酸序列分析[J]. 孫桂金,潘杰,劉可春,王雪,彭維兵,何秋霞,王思鋒. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(07)
[10]西施舌5個(gè)地理群體ITS1序列變異及系統(tǒng)發(fā)生分析[J]. 孟學(xué)平,高如承,申欣,王帥,程漢良,董志國(guó),閻斌倫. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2010(20)
碩士論文
[1]黑帽懸猴(Cebus apella)線粒體基因組全序列分析和菲律賓蛤仔(Ruditapes philippinarum)群體遺傳學(xué)研究[D]. 畢曉欣.魯東大學(xué) 2012
本文編號(hào):3180153
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3180153.html
最近更新
教材專著