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象山港黃墩支港菲律賓蛤仔種群COI和ITS1基因序列特征及遺傳多樣性分析

發(fā)布時(shí)間:2021-05-10 22:12
  為了解象山港黃墩支港菲律賓蛤仔種質(zhì)資源的遺傳多樣性現(xiàn)狀,采用COI和ITS1分子標(biāo)記對(duì)該種群進(jìn)行了基因序列特征和遺傳多樣性分析.結(jié)果表明:在該種群30個(gè)個(gè)體中擴(kuò)增得到的COI基因序列長(zhǎng)度均為709 bp,ITS1序列長(zhǎng)度范圍在693~729 bp(共有746個(gè)位點(diǎn)).COI基因序列的位點(diǎn)中有670個(gè)保守位點(diǎn)(占94.50%)、39個(gè)變異位點(diǎn)(占5.50%); ITS1序列的位點(diǎn)中有保守位點(diǎn)671個(gè)(占89.95%)、變異位點(diǎn)62個(gè)(占8.31%)和缺失/插入位點(diǎn)13個(gè)(占1.74%).COI基因序列的保守性高于ITS1序列.在COI基因序列中堿基(A+T)的占比(65.84%)高于(C+G),而ITS1序列中則是堿基(A+T)占比(37.59%)低于(C+G).COI和ITS1序列的遺傳距離分析均顯示群體內(nèi)遺傳分化不明顯.基于COI基因序列和ITS1序列構(gòu)建的遺傳進(jìn)化樹顯示:各科貝類分別相聚,象山港菲律賓蛤仔位于簾蛤科的分支中,其COI序列與雜色蛤進(jìn)化關(guān)系最近.遺傳進(jìn)化樹中各種貝類的聚類關(guān)系與傳統(tǒng)分類學(xué)結(jié)果相一致,可作為分類的參考. COI和ITS1序列的平均核苷酸差異數(shù)分別為5.49... 

【文章來源】:寧波大學(xué)學(xué)報(bào)(理工版). 2020,33(06)

【文章頁數(shù)】:6 頁

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]象山港大型底棲動(dòng)物生產(chǎn)力空間插值及模型比較[J]. 張夢(mèng)笛,呂粼,金狄狄,林霞,朱藝峰.  生態(tài)科學(xué). 2017(04)
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[7]基于轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)的蛤仔微衛(wèi)星標(biāo)記篩選[J]. 閆路路,秦艷杰,閆喜武,王琳楠,畢成隆,張津源.  生態(tài)學(xué)報(bào). 2015(05)
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[9]毛蚶、泥蚶和魁蚶ITS1核苷酸序列分析[J]. 孫桂金,潘杰,劉可春,王雪,彭維兵,何秋霞,王思鋒.  生物技術(shù)通報(bào). 2011(07)
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碩士論文
[1]黑帽懸猴(Cebus apella)線粒體基因組全序列分析和菲律賓蛤仔(Ruditapes philippinarum)群體遺傳學(xué)研究[D]. 畢曉欣.魯東大學(xué) 2012



本文編號(hào):3180153

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