基于CSSLs的水稻產(chǎn)量性狀雜種優(yōu)勢遺傳基礎解析和精胺合成酶基因OsSPMS1的功能研究
發(fā)布時間:2021-05-08 20:54
水稻是重要的糧食作物之一,為世界一半以上的人口提供食物和營養(yǎng)來源,提高水稻產(chǎn)量也一直是育種家最重要的研究目標之一。我國水稻高產(chǎn)育種技術經(jīng)歷了兩次革命性飛躍,一是矮稈基因sd1的利用,降低了株高,提高了單產(chǎn);二是成功利用細胞質(zhì)雄性不育基因,實現(xiàn)了雜交水稻的三系配套,有效利用了水稻雜種優(yōu)勢。雖然雜種優(yōu)勢在作物中已經(jīng)被廣泛利用,為解決糧食問題作出了重要貢獻,但是它的遺傳機制仍不清楚。近年來,隨著水稻分子生物學的發(fā)展,水稻育種已經(jīng)從傳統(tǒng)育種轉(zhuǎn)向傳統(tǒng)育種與現(xiàn)代分子技術相結合,特別是CRISPR/Cas9技術的不斷完善,對目標基因進行定點編輯進而提高水稻單產(chǎn)已經(jīng)成為可能,水稻產(chǎn)量性狀調(diào)控基因的挖掘就顯得尤為重要。本研究的工作主要包括以下兩個方面:一、基于CSSLs的水稻產(chǎn)量性狀雜種優(yōu)勢遺傳基礎解析我們利用一套重測序的128個水稻染色體片段代換系分別和水稻光溫敏雄性核不育系廣占63-4s、036s和連99s雜交,構建了204套測交系群體,分別命名為TC1-TC204(TC1:廣占2063-4s×CSSLs,200920年;TC2:廣占2063-4s×CSSLs,201120年;TC3:036s×CS...
【文章來源】:揚州大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:116 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
符號說明
第1章 文獻綜述
1.1 水稻雜種優(yōu)勢的利用和遺傳基礎研究進展
1.1.1 作物雜種優(yōu)勢的遺傳基礎
1.1.2 作物雜種優(yōu)勢的研究方法
1.1.3 雜種優(yōu)勢位點的挖掘
1.2 植物多胺代謝及其功能研究進展
1.2.1 多胺的種類
1.2.2 多胺的代謝通路
1.2.3 多胺的分布
1.2.4 多胺在植物生長發(fā)育中的作用
1.3 研究的目的和意義
第2章 水稻產(chǎn)量相關性狀雜種優(yōu)勢遺傳基礎解析
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 供試材料
2.2.2 試驗設計
2.2.3 性狀調(diào)查
2.3 數(shù)據(jù)分析
2.3.1 QTL和HL定位
2.3.2 方差分析
2.4 結果與分析
2.4.1 代換系群體和測交系群體產(chǎn)量性狀表型分析
2.4.2 產(chǎn)量性狀相關性分析
2.4.3 產(chǎn)量相關農(nóng)藝性狀QTL/HL定位
2.4.4 產(chǎn)量相關農(nóng)藝性狀遺傳組成分析
2.5 討論
2.5.1 CSSLs用于產(chǎn)量性狀QTL/HL定位和雜種優(yōu)勢分析的優(yōu)勢
2.5.2 CSSLs用于分子聚合育種的優(yōu)勢
2.5.3 產(chǎn)量性狀QTL/HL的“簇狀分布”
2.5.4 部分顯性和超顯性是產(chǎn)量構成性狀雜種優(yōu)勢形成的遺傳基礎
第3章 水稻精胺合成酶基因OsSPMS1的功能研究
3.1 前言
3.2 材料與方法
3.2.1 供試材料
3.2.2 實驗方法
3.3 結果與分析
3.3.1 水稻中亞精胺/精胺合成酶基因家族的生物信息學分析
3.3.2 OsSPMS1基因表達特異性分析
3.3.3 OsSPMS1蛋白的亞細胞定位
3.3.4 OsSPMS1轉(zhuǎn)基因株系的鑒定和農(nóng)藝性狀考察
3.3.5 OsSPMS1轉(zhuǎn)基因株系莖稈組織形態(tài)學分析
3.3.6 OsSPMS1對產(chǎn)量性狀的影響
3.3.7 OsSPMS1對內(nèi)源多胺含量的影響
3.3.8 OsSPMS1對籽粒萌發(fā)的影響
3.3.9 OsSPMS1對幼根伸長的影響
3.3.10 轉(zhuǎn)基因株系對干旱脅迫的響應
3.3.11 OsSPMS1轉(zhuǎn)基因材料與野生型幼穗組織轉(zhuǎn)錄組分析
3.3.12 高產(chǎn)背景下OsSPMS1基因CRISPR/Cas9突變體材料的創(chuàng)制
3.4 小結與討論
3.4.1 水稻OsSPMS1家族的分子進化分析
3.4.2 調(diào)控OsSPMS1影響乙烯合成
3.4.3 OsSPMS1在水稻抗逆中的作用
3.4.4 OsSPMS1通過多胺和乙烯合成代謝影響水稻生長發(fā)育的模型
3.4.5 OsSPMS1在水稻育種利用中的潛在價值
第4章 全文總結
參考文獻
附錄
附錄1 引物匯總
附錄2 大腸桿菌感受態(tài)細胞的轉(zhuǎn)化
附錄3 農(nóng)桿菌感受態(tài)細胞的轉(zhuǎn)化
附錄4 質(zhì)粒提取
附錄5 CTAB法提取水稻葉片DNA
附錄6 DNA膠回收步驟
附錄7 水稻各組織總RNA提取
附錄8 酵母雙雜交步驟
附錄9 GUS染色步驟
附錄10 煙草注射
附錄11 電鏡掃描步驟
附錄12 超薄切片步驟
附錄13 綠色植物基因組中含Spermine_synth結構域的62個基因信息
致謝
攻讀博士學位期間發(fā)表的學術論文目錄
【參考文獻】:
期刊論文
[1]外源多胺和乙烯對小麥籽粒品質(zhì)的影響[J]. 李佳,陳慶,呂曉康,劉楊,廖允成. 西北農(nóng)業(yè)學報. 2017(08)
[2]水稻根系分泌物有機酸、多胺與稻米蒸煮品質(zhì)及蛋白質(zhì)組分的關系[J]. 劉立軍,常二華,熊溢偉,卞金龍,王志琴,楊建昌. 揚州大學學報(農(nóng)業(yè)與生命科學版). 2014(03)
[3]利用三重測交群體剖析玉米株高與穗位高雜種優(yōu)勢的遺傳學基礎[J]. 宋方威,彭惠茹,劉婷,張義榮,孫其信,倪中福. 作物學報. 2011(07)
[4]水稻粒長基因GS3在聚合育種中的效應[J]. 楊梯豐,曾瑞珍,朱海濤,陳嵐,張澤民,丁效華,李文濤,張桂權. 分子植物育種. 2010(01)
[5]從遺傳學、基因組學回顧與展望雜種優(yōu)勢的應用[J]. 秦泰辰. 江蘇農(nóng)業(yè)學報. 2009(02)
[6]Additive20and20Over-dominant20Effects20Resulting20from20Epistatic20Loci20Are20the20Primary20Genetic20Basis20of20Heterosis20in20Rice[J]. Xiaojin Luo1,2,3,4,Yongcai Fu1,2,3,Peijiang Zhang5,Shuang Wu1,2,3,Feng Tian1,2,3,Jiayong Liu1,2,3,Zuofeng Zhu1,2,3,Jinshui Yang4 and Chuanqing Sun1,2,3(1Department of Plant Genetics and Breeding and State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,China Agricultural University,Beijing 100193,China;2National Centre for Evaluation of Agricultural Wild Plant(Rice),Beijing 100193,China;3Beijing Key Laboratory of Crop Genetic Improvement and Genome of Ministry of Agriculture,Beijing 100193,China;4State Key Laboratory of Genetic Engineering,Morgan-Tan International Center for Life Sciences,School of Life Sciences,Fudan University,Shanghai 200433,China;5Institute of Rice Research,Anhui Academy of Agricultural Sciences,Hefei 230031,China). Journal of Integrative Plant Biology. 2009(04)
[7]水稻劍葉和倒二葉形態(tài)性狀的雜種優(yōu)勢[J]. 李蘭芝,盧開陽,牟同敏,胡中立. 武漢大學學報(理學版). 2008(04)
[8]水稻籽粒多胺濃度與米質(zhì)的關系[J]. 王志琴,張耗,王學明,張自常,楊建昌. 作物學報. 2007(12)
[9]滲透脅迫與大豆幼苗葉片多胺含量的關系[J]. 胡炳義,牛明功,王啟明,李潮海,劉懷攀. 植物營養(yǎng)與肥料學報. 2006(06)
[10]超顯性效應對水稻雜種優(yōu)勢的重要作用[J]. 莊杰云,樊葉楊,吳建利,夏英武,鄭康樂. 中國科學(C輯:生命科學). 2001(02)
博士論文
[1]利用染色體片段置換系剖析水稻秈粳亞種間產(chǎn)量相關農(nóng)藝性狀雜種優(yōu)勢的遺傳基礎[D]. 王智權.南京農(nóng)業(yè)大學 2010
本文編號:3175984
【文章來源】:揚州大學江蘇省
【文章頁數(shù)】:116 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
符號說明
第1章 文獻綜述
1.1 水稻雜種優(yōu)勢的利用和遺傳基礎研究進展
1.1.1 作物雜種優(yōu)勢的遺傳基礎
1.1.2 作物雜種優(yōu)勢的研究方法
1.1.3 雜種優(yōu)勢位點的挖掘
1.2 植物多胺代謝及其功能研究進展
1.2.1 多胺的種類
1.2.2 多胺的代謝通路
1.2.3 多胺的分布
1.2.4 多胺在植物生長發(fā)育中的作用
1.3 研究的目的和意義
第2章 水稻產(chǎn)量相關性狀雜種優(yōu)勢遺傳基礎解析
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 供試材料
2.2.2 試驗設計
2.2.3 性狀調(diào)查
2.3 數(shù)據(jù)分析
2.3.1 QTL和HL定位
2.3.2 方差分析
2.4 結果與分析
2.4.1 代換系群體和測交系群體產(chǎn)量性狀表型分析
2.4.2 產(chǎn)量性狀相關性分析
2.4.3 產(chǎn)量相關農(nóng)藝性狀QTL/HL定位
2.4.4 產(chǎn)量相關農(nóng)藝性狀遺傳組成分析
2.5 討論
2.5.1 CSSLs用于產(chǎn)量性狀QTL/HL定位和雜種優(yōu)勢分析的優(yōu)勢
2.5.2 CSSLs用于分子聚合育種的優(yōu)勢
2.5.3 產(chǎn)量性狀QTL/HL的“簇狀分布”
2.5.4 部分顯性和超顯性是產(chǎn)量構成性狀雜種優(yōu)勢形成的遺傳基礎
第3章 水稻精胺合成酶基因OsSPMS1的功能研究
3.1 前言
3.2 材料與方法
3.2.1 供試材料
3.2.2 實驗方法
3.3 結果與分析
3.3.1 水稻中亞精胺/精胺合成酶基因家族的生物信息學分析
3.3.2 OsSPMS1基因表達特異性分析
3.3.3 OsSPMS1蛋白的亞細胞定位
3.3.4 OsSPMS1轉(zhuǎn)基因株系的鑒定和農(nóng)藝性狀考察
3.3.5 OsSPMS1轉(zhuǎn)基因株系莖稈組織形態(tài)學分析
3.3.6 OsSPMS1對產(chǎn)量性狀的影響
3.3.7 OsSPMS1對內(nèi)源多胺含量的影響
3.3.8 OsSPMS1對籽粒萌發(fā)的影響
3.3.9 OsSPMS1對幼根伸長的影響
3.3.10 轉(zhuǎn)基因株系對干旱脅迫的響應
3.3.11 OsSPMS1轉(zhuǎn)基因材料與野生型幼穗組織轉(zhuǎn)錄組分析
3.3.12 高產(chǎn)背景下OsSPMS1基因CRISPR/Cas9突變體材料的創(chuàng)制
3.4 小結與討論
3.4.1 水稻OsSPMS1家族的分子進化分析
3.4.2 調(diào)控OsSPMS1影響乙烯合成
3.4.3 OsSPMS1在水稻抗逆中的作用
3.4.4 OsSPMS1通過多胺和乙烯合成代謝影響水稻生長發(fā)育的模型
3.4.5 OsSPMS1在水稻育種利用中的潛在價值
第4章 全文總結
參考文獻
附錄
附錄1 引物匯總
附錄2 大腸桿菌感受態(tài)細胞的轉(zhuǎn)化
附錄3 農(nóng)桿菌感受態(tài)細胞的轉(zhuǎn)化
附錄4 質(zhì)粒提取
附錄5 CTAB法提取水稻葉片DNA
附錄6 DNA膠回收步驟
附錄7 水稻各組織總RNA提取
附錄8 酵母雙雜交步驟
附錄9 GUS染色步驟
附錄10 煙草注射
附錄11 電鏡掃描步驟
附錄12 超薄切片步驟
附錄13 綠色植物基因組中含Spermine_synth結構域的62個基因信息
致謝
攻讀博士學位期間發(fā)表的學術論文目錄
【參考文獻】:
期刊論文
[1]外源多胺和乙烯對小麥籽粒品質(zhì)的影響[J]. 李佳,陳慶,呂曉康,劉楊,廖允成. 西北農(nóng)業(yè)學報. 2017(08)
[2]水稻根系分泌物有機酸、多胺與稻米蒸煮品質(zhì)及蛋白質(zhì)組分的關系[J]. 劉立軍,常二華,熊溢偉,卞金龍,王志琴,楊建昌. 揚州大學學報(農(nóng)業(yè)與生命科學版). 2014(03)
[3]利用三重測交群體剖析玉米株高與穗位高雜種優(yōu)勢的遺傳學基礎[J]. 宋方威,彭惠茹,劉婷,張義榮,孫其信,倪中福. 作物學報. 2011(07)
[4]水稻粒長基因GS3在聚合育種中的效應[J]. 楊梯豐,曾瑞珍,朱海濤,陳嵐,張澤民,丁效華,李文濤,張桂權. 分子植物育種. 2010(01)
[5]從遺傳學、基因組學回顧與展望雜種優(yōu)勢的應用[J]. 秦泰辰. 江蘇農(nóng)業(yè)學報. 2009(02)
[6]Additive20and20Over-dominant20Effects20Resulting20from20Epistatic20Loci20Are20the20Primary20Genetic20Basis20of20Heterosis20in20Rice[J]. Xiaojin Luo1,2,3,4,Yongcai Fu1,2,3,Peijiang Zhang5,Shuang Wu1,2,3,Feng Tian1,2,3,Jiayong Liu1,2,3,Zuofeng Zhu1,2,3,Jinshui Yang4 and Chuanqing Sun1,2,3(1Department of Plant Genetics and Breeding and State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,China Agricultural University,Beijing 100193,China;2National Centre for Evaluation of Agricultural Wild Plant(Rice),Beijing 100193,China;3Beijing Key Laboratory of Crop Genetic Improvement and Genome of Ministry of Agriculture,Beijing 100193,China;4State Key Laboratory of Genetic Engineering,Morgan-Tan International Center for Life Sciences,School of Life Sciences,Fudan University,Shanghai 200433,China;5Institute of Rice Research,Anhui Academy of Agricultural Sciences,Hefei 230031,China). Journal of Integrative Plant Biology. 2009(04)
[7]水稻劍葉和倒二葉形態(tài)性狀的雜種優(yōu)勢[J]. 李蘭芝,盧開陽,牟同敏,胡中立. 武漢大學學報(理學版). 2008(04)
[8]水稻籽粒多胺濃度與米質(zhì)的關系[J]. 王志琴,張耗,王學明,張自常,楊建昌. 作物學報. 2007(12)
[9]滲透脅迫與大豆幼苗葉片多胺含量的關系[J]. 胡炳義,牛明功,王啟明,李潮海,劉懷攀. 植物營養(yǎng)與肥料學報. 2006(06)
[10]超顯性效應對水稻雜種優(yōu)勢的重要作用[J]. 莊杰云,樊葉楊,吳建利,夏英武,鄭康樂. 中國科學(C輯:生命科學). 2001(02)
博士論文
[1]利用染色體片段置換系剖析水稻秈粳亞種間產(chǎn)量相關農(nóng)藝性狀雜種優(yōu)勢的遺傳基礎[D]. 王智權.南京農(nóng)業(yè)大學 2010
本文編號:3175984
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