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柚芽變株系類胡蘿卜素代謝差異基因的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

發(fā)布時間:2021-05-08 11:34
  為了研究’琯溪蜜柚’果實紅肉突變株系類胡蘿卜素代謝和芽變的分子機制,本研究以’琯溪蜜柚’及其芽變一代品種’紅肉蜜柚’和芽變二代品種’三紅蜜柚’果實為材料,使用RNA-seq技術(shù)研究3個品種3個發(fā)育時期果肉類胡蘿卜素的代謝。經(jīng)生物信息學(xué)分析,共篩選出參與類胡蘿卜素生物合成顯著差異表達的10個基因,分別為八氫番茄紅素合成酶基因(PSY)、六氫番茄紅素脫氫酶基因(ZDS)、類胡蘿卜素異構(gòu)酶基因(CRTISO1、CRTISO2)、紫黃質(zhì)脫環(huán)氧酶基因(NPQ1)、9-順式-環(huán)氧類胡蘿卜素雙加氧酶基因(NCED3、NCED5)、脫落醛氧化酶基因(AAO3)、ABA 8’-羥化酶基因(CYP707A1)、類胡蘿卜素裂解雙加氧酶基因(CCD4)。共表達分析揭示了7個家族轉(zhuǎn)錄因子的表達模式與類胡蘿卜素合成基因高度相關(guān),分別為MADS、b ZIP、b HLH、MYB、AP2/ERF、NAC和WRKY。通過實時熒光定量PCR(q RT-PCR)驗證了部分基因的表達模式,結(jié)果與RNA-seq結(jié)果高度一致。此外,經(jīng)對’紅肉蜜柚’果肉轉(zhuǎn)色期的初生和次生代謝通路DEGs富集分析,發(fā)現(xiàn)類胡蘿卜素的積累過程中,細(xì)胞壁、... 

【文章來源】:熱帶作物學(xué)報. 2020,41(11)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:11 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 轉(zhuǎn)錄組測序與分析
        1.2.2 q RT-PCR驗證
2 結(jié)果與分析
    2.1 轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果統(tǒng)計
    2.2 差異基因分析
    2.3 差異表達基因的功能注釋和分析
    2.4 類胡蘿卜素代謝分析
    2.5‘紅肉蜜柚’果實轉(zhuǎn)色期的初生和次級代謝分析
    2.6 q RT-PCR驗證
3 討論


【參考文獻】:
期刊論文
[1]‘三紅蜜柚’果實類胡蘿卜素合成途徑部分酶基因的克隆及表達分析[J]. 余磊,潘騰飛,張蒙,鄭嘉敏,龔江美,韋愛玉,蔡燦軍,潘東明.  熱帶作物學(xué)報. 2018(10)
[2]不同套袋處理對琯溪蜜柚果實品質(zhì)的影響[J]. 趙曉玲,佘文琴,林慧穎.  中國南方果樹. 2012(04)
[3]采后ABA、GA3對芒果細(xì)胞壁降解酶、類胡蘿卜素含量的作用[J]. 周玉嬋,唐友林,譚興杰,郭俊彥.  植物生理學(xué)報. 1996(04)

博士論文
[1]柑橘精細(xì)定位平臺構(gòu)建及其在多胚和色澤芽變研究中的應(yīng)用[D]. 王霞.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018

碩士論文
[1]柚果實類胡蘿卜素合成途徑的研究[D]. 余磊.福建農(nóng)林大學(xué) 2018
[2]柚COMT基因的克隆與表達研究[D]. 扶麗紅.福建農(nóng)林大學(xué) 2015
[3]柚果實生長發(fā)育過程中類胡蘿卜素的分離及其積累研究[D]. 李偉明.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[4]紅肉蜜柚β-胡蘿卜素合成途徑相關(guān)酶基因的克隆[D]. 陳德欣.福建農(nóng)林大學(xué) 2007



本文編號:3175267

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