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柚芽變株系類胡蘿卜素代謝差異基因的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-05-08 11:34
  為了研究’琯溪蜜柚’果實(shí)紅肉突變株系類胡蘿卜素代謝和芽變的分子機(jī)制,本研究以’琯溪蜜柚’及其芽變一代品種’紅肉蜜柚’和芽變二代品種’三紅蜜柚’果實(shí)為材料,使用RNA-seq技術(shù)研究3個(gè)品種3個(gè)發(fā)育時(shí)期果肉類胡蘿卜素的代謝。經(jīng)生物信息學(xué)分析,共篩選出參與類胡蘿卜素生物合成顯著差異表達(dá)的10個(gè)基因,分別為八氫番茄紅素合成酶基因(PSY)、六氫番茄紅素脫氫酶基因(ZDS)、類胡蘿卜素異構(gòu)酶基因(CRTISO1、CRTISO2)、紫黃質(zhì)脫環(huán)氧酶基因(NPQ1)、9-順式-環(huán)氧類胡蘿卜素雙加氧酶基因(NCED3、NCED5)、脫落醛氧化酶基因(AAO3)、ABA 8’-羥化酶基因(CYP707A1)、類胡蘿卜素裂解雙加氧酶基因(CCD4)。共表達(dá)分析揭示了7個(gè)家族轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)模式與類胡蘿卜素合成基因高度相關(guān),分別為MADS、b ZIP、b HLH、MYB、AP2/ERF、NAC和WRKY。通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR(q RT-PCR)驗(yàn)證了部分基因的表達(dá)模式,結(jié)果與RNA-seq結(jié)果高度一致。此外,經(jīng)對(duì)’紅肉蜜柚’果肉轉(zhuǎn)色期的初生和次生代謝通路DEGs富集分析,發(fā)現(xiàn)類胡蘿卜素的積累過(guò)程中,細(xì)胞壁、... 

【文章來(lái)源】:熱帶作物學(xué)報(bào). 2020,41(11)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與分析
        1.2.2 q RT-PCR驗(yàn)證
2 結(jié)果與分析
    2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果統(tǒng)計(jì)
    2.2 差異基因分析
    2.3 差異表達(dá)基因的功能注釋和分析
    2.4 類胡蘿卜素代謝分析
    2.5‘紅肉蜜柚’果實(shí)轉(zhuǎn)色期的初生和次級(jí)代謝分析
    2.6 q RT-PCR驗(yàn)證
3 討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]‘三紅蜜柚’果實(shí)類胡蘿卜素合成途徑部分酶基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 余磊,潘騰飛,張蒙,鄭嘉敏,龔江美,韋愛玉,蔡燦軍,潘東明.  熱帶作物學(xué)報(bào). 2018(10)
[2]不同套袋處理對(duì)琯溪蜜柚果實(shí)品質(zhì)的影響[J]. 趙曉玲,佘文琴,林慧穎.  中國(guó)南方果樹. 2012(04)
[3]采后ABA、GA3對(duì)芒果細(xì)胞壁降解酶、類胡蘿卜素含量的作用[J]. 周玉嬋,唐友林,譚興杰,郭俊彥.  植物生理學(xué)報(bào). 1996(04)

博士論文
[1]柑橘精細(xì)定位平臺(tái)構(gòu)建及其在多胚和色澤芽變研究中的應(yīng)用[D]. 王霞.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018

碩士論文
[1]柚果實(shí)類胡蘿卜素合成途徑的研究[D]. 余磊.福建農(nóng)林大學(xué) 2018
[2]柚COMT基因的克隆與表達(dá)研究[D]. 扶麗紅.福建農(nóng)林大學(xué) 2015
[3]柚果實(shí)生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中類胡蘿卜素的分離及其積累研究[D]. 李偉明.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[4]紅肉蜜柚β-胡蘿卜素合成途徑相關(guān)酶基因的克隆[D]. 陳德欣.福建農(nóng)林大學(xué) 2007



本文編號(hào):3175267

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