小鼠Oct4基因剪接體的鑒定和功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-08 06:12
小鼠干細(xì)胞作為重要生物材料在胚胎發(fā)育和臨床治療等研究方面具有重大理論和運(yùn)用價(jià)值。Oct4作為核心轉(zhuǎn)錄因子,對(duì)干細(xì)胞的自我更新和多能性維持具有重要調(diào)控作用。Oct4轉(zhuǎn)錄因子控制早期胚胎的發(fā)育和分化,在多種干細(xì)胞中高表達(dá),包括生殖細(xì)胞、胚胎干細(xì)胞(ESCs)、胚胎生殖細(xì)胞(EGCs)和胚胎腫瘤細(xì)胞(ECCs)。在小鼠中,Oct4在細(xì)胞多能性調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)中起核心作用。通過(guò)異位表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子Oct4、Sox2、Klf4和c-Myc,可以將體細(xì)胞重編程為誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(i PSCs)。人OCT4基因可以選擇性剪接成OCT4A、OCT4B和OCT4B1。但是,關(guān)于Oct4剪接體的功能研究迄今尚不充分。本研究以小鼠多能干細(xì)胞為研究對(duì)象,通過(guò)不同方法對(duì)Oct4基因剪接體的表達(dá)進(jìn)行鑒定,并對(duì)Oct4b基因剪接體的功能進(jìn)行分析研究。具體結(jié)果如下:1.小鼠Oct4基因的生物信息學(xué)分析利用生物信息學(xué)方法對(duì)Oct4基因檢索、比對(duì)和分析發(fā)現(xiàn),小鼠Oct4基因的不同剪接體定位于17號(hào)染色體上,并且Oct4a和Oct4b具有相同的2-5外顯子。Oct4a和Oct4b的剪切主要發(fā)生在外顯子1和內(nèi)含子1區(qū)域,導(dǎo)致它們具有不同的...
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:104 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
abstract
文獻(xiàn)綜述
第一章 Oct4基因的研究
1.1 OCT4基因及其表達(dá)
1.1.1 Oct4基因
1.1.2 Oct4在早期胚胎和多能干細(xì)胞中的表達(dá)
1.1.3 Oct4在其他細(xì)胞中的表達(dá)
1.2 OCT4基因的表達(dá)調(diào)控
1.2.1 Oct4表達(dá)的調(diào)控元件
1.2.2 小鼠Oct4表達(dá)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
1.2.3 轉(zhuǎn)錄后Oct4的表達(dá)調(diào)控
1.3 OCT4基因的功能
1.3.1 Oct4在多能性維持中的作用
1.3.2 Oct4在細(xì)胞重編程中的作用
1.3.3 Oct4在腫瘤中的作用
第二章 剪接體的研究
2.1 RNA的選擇性剪接
2.1.1 剪接體的概述
2.1.2 剪接體的調(diào)控
2.1.3 干細(xì)胞中的選擇性剪接
2.2 OCT4的選擇性剪接
2.2.1 OCT4剪接體的研究
2.2.2 OCT4假基因的研究
試驗(yàn)研究
前言
第三章 小鼠Oct4基因的生物信息學(xué)分析
3.1 材料和方法
3.1.1 試驗(yàn)材料
3.1.2 試驗(yàn)方法
3.2 結(jié)果
3.2.1 小鼠Oct4基因的定位和啟動(dòng)子分析
3.2.2 小鼠Oct4基因的保守性分析
3.2.3 小鼠Oct4基因在不同組織和細(xì)胞中的表達(dá)
3.2.4 小鼠Oct4基因不同剪接體的基因組序列
3.3 討論
3.4 小結(jié)
第四章 小鼠Oct4基因剪接體的鑒定
4.1 材料和方法
4.1.1 試驗(yàn)材料
4.1.2 試驗(yàn)方法
4.2 結(jié)果
4.2.1 小鼠Oct4基因剪接體的表達(dá)鑒定
4.2.2 小鼠Oct4基因剪接體在不同細(xì)胞中的表達(dá)
4.2.3 小鼠Oct4的蛋白表達(dá)檢測(cè)
4.2.4 P19細(xì)胞中Oct4蛋白的差異表達(dá)
4.2.5 不同Oct4蛋白抗體的檢測(cè)分析
4.3 討論
4.4 小結(jié)
第五章 小鼠Oct4b的蛋白表達(dá)和定位
5.1 材料和方法
5.1.1 試驗(yàn)材料
5.1.2 試驗(yàn)方法
5.2 結(jié)果
5.2.1 小鼠剪接體Oct4b表達(dá)載體的構(gòu)建
5.2.2 小鼠剪接體Oct4b的選擇性剪切
5.2.3 小鼠剪接體Oct4b的蛋白表達(dá)
5.2.4 小鼠剪接體Oct4b的蛋白定位
5.3 討論
5.4 小結(jié)
第六章 小鼠Oct4基因剪接體的功能分析
6.1 材料和方法
6.1.1 試驗(yàn)材料
6.1.2 試驗(yàn)方法
6.2 結(jié)果
6.2.1 小鼠Oct4b的IRES元件啟動(dòng)活性分析
6.2.2 小鼠Oct4b的IRES元件差異翻譯
6.2.3 小鼠Oct4b在P19細(xì)胞分化中的表達(dá)變化
6.2.4 小鼠Oct4b在miPS細(xì)胞分化中的表達(dá)變化
6.2.5 小鼠Oct4b在不同細(xì)胞分化中的對(duì)比
6.3 討論
6.4 小結(jié)
結(jié)論
論文創(chuàng)新點(diǎn)及下一步研究方向
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Alternative splicing: An important mechanism in stem cell biology[J]. Kenian Chen,Xiaojing Dai,Jiaqian Wu. World Journal of Stem Cells. 2015(01)
[2]The novel OCT4 spliced variant OCT4B1 can generate three protein isoforms by alternative splicing into OCT4B[J]. Yuan Gao a,b,1,Xia Wang a,1,Jin Han a,Zhifeng Xiao a,Bing Chen a,Guannan Su a,Jianwu Dai a,a Key Laboratory of Molecular Developmental Biology,Institute of Genetics and Developmental Biology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100190,China b The Graduate School,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100190,China. 遺傳學(xué)報(bào). 2010(07)
[3]Stem cell pluripotency and transcription factor Oct4[J]. GUANG JIN PAN, ZENG YI CHANG, HANS R. SCHOLER, DUANQING PEI Departments of Pharmacology and Biological Sciences & Biotechnology, Schools of Sciences and Medicine,Tsinghua University, Beijing 100084, China Center for Animal Transgenesis and Germ Cell Research, School of Veterinary Medicine, Department of Animal Biology, University of Pennsylvania, New Bolton Center, 382 West Street Road, Kennett Square, PA 19348, USA,Department of Pharmacology, University of Minnesota, Minneapolis, MN 55455, USA. Cell Research. 2002(Z2)
本文編號(hào):3174826
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:104 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
abstract
文獻(xiàn)綜述
第一章 Oct4基因的研究
1.1 OCT4基因及其表達(dá)
1.1.1 Oct4基因
1.1.2 Oct4在早期胚胎和多能干細(xì)胞中的表達(dá)
1.1.3 Oct4在其他細(xì)胞中的表達(dá)
1.2 OCT4基因的表達(dá)調(diào)控
1.2.1 Oct4表達(dá)的調(diào)控元件
1.2.2 小鼠Oct4表達(dá)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
1.2.3 轉(zhuǎn)錄后Oct4的表達(dá)調(diào)控
1.3 OCT4基因的功能
1.3.1 Oct4在多能性維持中的作用
1.3.2 Oct4在細(xì)胞重編程中的作用
1.3.3 Oct4在腫瘤中的作用
第二章 剪接體的研究
2.1 RNA的選擇性剪接
2.1.1 剪接體的概述
2.1.2 剪接體的調(diào)控
2.1.3 干細(xì)胞中的選擇性剪接
2.2 OCT4的選擇性剪接
2.2.1 OCT4剪接體的研究
2.2.2 OCT4假基因的研究
試驗(yàn)研究
前言
第三章 小鼠Oct4基因的生物信息學(xué)分析
3.1 材料和方法
3.1.1 試驗(yàn)材料
3.1.2 試驗(yàn)方法
3.2 結(jié)果
3.2.1 小鼠Oct4基因的定位和啟動(dòng)子分析
3.2.2 小鼠Oct4基因的保守性分析
3.2.3 小鼠Oct4基因在不同組織和細(xì)胞中的表達(dá)
3.2.4 小鼠Oct4基因不同剪接體的基因組序列
3.3 討論
3.4 小結(jié)
第四章 小鼠Oct4基因剪接體的鑒定
4.1 材料和方法
4.1.1 試驗(yàn)材料
4.1.2 試驗(yàn)方法
4.2 結(jié)果
4.2.1 小鼠Oct4基因剪接體的表達(dá)鑒定
4.2.2 小鼠Oct4基因剪接體在不同細(xì)胞中的表達(dá)
4.2.3 小鼠Oct4的蛋白表達(dá)檢測(cè)
4.2.4 P19細(xì)胞中Oct4蛋白的差異表達(dá)
4.2.5 不同Oct4蛋白抗體的檢測(cè)分析
4.3 討論
4.4 小結(jié)
第五章 小鼠Oct4b的蛋白表達(dá)和定位
5.1 材料和方法
5.1.1 試驗(yàn)材料
5.1.2 試驗(yàn)方法
5.2 結(jié)果
5.2.1 小鼠剪接體Oct4b表達(dá)載體的構(gòu)建
5.2.2 小鼠剪接體Oct4b的選擇性剪切
5.2.3 小鼠剪接體Oct4b的蛋白表達(dá)
5.2.4 小鼠剪接體Oct4b的蛋白定位
5.3 討論
5.4 小結(jié)
第六章 小鼠Oct4基因剪接體的功能分析
6.1 材料和方法
6.1.1 試驗(yàn)材料
6.1.2 試驗(yàn)方法
6.2 結(jié)果
6.2.1 小鼠Oct4b的IRES元件啟動(dòng)活性分析
6.2.2 小鼠Oct4b的IRES元件差異翻譯
6.2.3 小鼠Oct4b在P19細(xì)胞分化中的表達(dá)變化
6.2.4 小鼠Oct4b在miPS細(xì)胞分化中的表達(dá)變化
6.2.5 小鼠Oct4b在不同細(xì)胞分化中的對(duì)比
6.3 討論
6.4 小結(jié)
結(jié)論
論文創(chuàng)新點(diǎn)及下一步研究方向
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Alternative splicing: An important mechanism in stem cell biology[J]. Kenian Chen,Xiaojing Dai,Jiaqian Wu. World Journal of Stem Cells. 2015(01)
[2]The novel OCT4 spliced variant OCT4B1 can generate three protein isoforms by alternative splicing into OCT4B[J]. Yuan Gao a,b,1,Xia Wang a,1,Jin Han a,Zhifeng Xiao a,Bing Chen a,Guannan Su a,Jianwu Dai a,a Key Laboratory of Molecular Developmental Biology,Institute of Genetics and Developmental Biology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100190,China b The Graduate School,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100190,China. 遺傳學(xué)報(bào). 2010(07)
[3]Stem cell pluripotency and transcription factor Oct4[J]. GUANG JIN PAN, ZENG YI CHANG, HANS R. SCHOLER, DUANQING PEI Departments of Pharmacology and Biological Sciences & Biotechnology, Schools of Sciences and Medicine,Tsinghua University, Beijing 100084, China Center for Animal Transgenesis and Germ Cell Research, School of Veterinary Medicine, Department of Animal Biology, University of Pennsylvania, New Bolton Center, 382 West Street Road, Kennett Square, PA 19348, USA,Department of Pharmacology, University of Minnesota, Minneapolis, MN 55455, USA. Cell Research. 2002(Z2)
本文編號(hào):3174826
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