面向國產(chǎn)處理器大數(shù)據(jù)一體機的基因壓縮技術(shù)研究
發(fā)布時間:2021-05-08 05:27
大數(shù)據(jù)一體機作為大數(shù)據(jù)時代的基礎(chǔ)設(shè)施,其自主安全可控顯得尤為重要。基因數(shù)據(jù)因其巨大的社會價值、經(jīng)濟價值及軍事價值,其安全是國家安全的一部分。因此,存儲、分析與處理基因數(shù)據(jù)是國產(chǎn)處理器大數(shù)據(jù)一體機的重要應(yīng)用之一。文中首先介紹了國產(chǎn)處理器大數(shù)據(jù)一體機和基因序列文件主要格式,然后分為無參考序列基因壓縮算法和基于參考序列基因壓縮算法綜述了FASTA格式基因數(shù)據(jù)壓縮技術(shù)及基因壓縮并行化技術(shù)的發(fā)展歷程和研究現(xiàn)狀,同時在國產(chǎn)處理器大數(shù)據(jù)一體機上驗證了近年來優(yōu)秀基因壓縮算法的性能。研究面向國產(chǎn)處理器大數(shù)據(jù)一體機的基因壓縮技術(shù)對解決基因數(shù)據(jù)安全和基因壓縮技術(shù)自主可控具有很重要的意義,也為我國基因處理技術(shù)的全面國產(chǎn)化提供了參考。
【文章來源】:南京郵電大學學報(自然科學版). 2020,40(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:16 頁
【文章目錄】:
1 相關(guān)工作
1.1 無參考序列基因壓縮算法
1.2 基于參考序列基因壓縮算法
1.3 基因壓縮并行化技術(shù)
2 性能驗證及分析
2.1 實驗平臺及數(shù)據(jù)集
2.2 無參考序列基因壓縮算法性能分析
2.3 基于參考序列基因壓縮算法性能分析
3 結(jié)束語
【參考文獻】:
期刊論文
[1]大數(shù)據(jù)一體機關(guān)鍵技術(shù)及應(yīng)用研究[J]. 陳國良,堯海昌,李航,葉青,劉尚東,季一木,王汝傳. 南京郵電大學學報(自然科學版). 2018(01)
[2]DNA序列數(shù)據(jù)壓縮技術(shù)綜述[J]. 紀震,周家銳,姜來,Q.H.Wu. 電子學報. 2010(05)
本文編號:3174760
【文章來源】:南京郵電大學學報(自然科學版). 2020,40(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:16 頁
【文章目錄】:
1 相關(guān)工作
1.1 無參考序列基因壓縮算法
1.2 基于參考序列基因壓縮算法
1.3 基因壓縮并行化技術(shù)
2 性能驗證及分析
2.1 實驗平臺及數(shù)據(jù)集
2.2 無參考序列基因壓縮算法性能分析
2.3 基于參考序列基因壓縮算法性能分析
3 結(jié)束語
【參考文獻】:
期刊論文
[1]大數(shù)據(jù)一體機關(guān)鍵技術(shù)及應(yīng)用研究[J]. 陳國良,堯海昌,李航,葉青,劉尚東,季一木,王汝傳. 南京郵電大學學報(自然科學版). 2018(01)
[2]DNA序列數(shù)據(jù)壓縮技術(shù)綜述[J]. 紀震,周家銳,姜來,Q.H.Wu. 電子學報. 2010(05)
本文編號:3174760
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