發(fā)布時(shí)間：2021-04-27 00:29

　　目的通過對(duì)多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出的肝細(xì)胞癌（HCC）患者癌組織和血液中外泌體差異表達(dá)基因的分析,挖掘與HCC預(yù)后密切相關(guān)的外泌體關(guān)鍵基因,并揭示HCC發(fā)展的分子機(jī)制。方法應(yīng)用GEO、TCGA以及exoRbase數(shù)據(jù)庫(kù)篩選出HCC患者癌組織和血液中差異表達(dá)的外泌體基因,并通過Survival R語言程序獲得與預(yù)后密切相關(guān)的關(guān)鍵基因,通過構(gòu)建CeRNA網(wǎng)絡(luò)對(duì)關(guān)鍵基因進(jìn)行可視化分析,并應(yīng)用基因富集分析（GSEA）對(duì)關(guān)鍵基因進(jìn)行功能預(yù)測(cè)。結(jié)果從GEO、TCGA及exoRbase數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出HCC癌組織及血液中差異表達(dá)的外泌體mRNA 38個(gè),lncRNA 23個(gè),miRNA 274個(gè),進(jìn)一步確定了與預(yù)后密切相關(guān)的8個(gè)外泌體關(guān)鍵基因,即lncRNA GTF2IRD2P1、hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-206、hsa-miR-613、PTMA、CDC42、HNRNPA3、STK4;通過構(gòu)建CeRNA網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)hsa-miR-613可分別競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合lncRNA GTF2IRD2P1、CDC42、PTMA、HNRNPA3,hsa-miR-206可分別競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合lncRNA GTF2IRD... 

【文章來源】：精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)雜志. 2020,35(04)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 數(shù)據(jù)庫(kù)中差異表達(dá)的外泌體基因的篩選
    1.2 與預(yù)后密切相關(guān)的關(guān)鍵基因的篩選及可視化分析
    1.3 外泌體關(guān)鍵基因的功能富集分析
2 結(jié) 果
    2.1 數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出的差異表達(dá)的外泌體基因
    2.2 差異表達(dá)的外泌體基因的預(yù)后分析結(jié)果
    2.3 關(guān)鍵基因的功能富集分析結(jié)果
3 討 論



本文編號(hào)：3162410