目的:幽門螺桿菌（Helicobacter pylori,H.pylori）感染是多種胃疾病的重要病因,截止目前其致病機制仍不十分清楚。近年來,隨著根除治療的廣泛實施,H.pylori對抗生素的耐藥性逐年增加。本研究在前期工作基礎(chǔ)之上主要聚焦于兩個方面,1.篩選鑒定與H.pylori克拉霉素（clarithromycin,CAM）,左氧氟沙星（levofloxacin,LVX）和甲硝唑（metronidazole,MNZ）耐藥相關(guān)基因突變位點;2.構(gòu)建H.pylori感染相關(guān)胃癌差異基因ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡,探討相關(guān)分子的生物學功能和預后相關(guān)性。本研究將為H.pylori感染相關(guān)耐藥性與致病性的進一步深入研究提供線索和理論依據(jù)。研究方法:1.利用分子對接模擬分析本組前期研究獲得的9個23S rRNA耐藥相關(guān)突變位點、35個rdxA耐藥相關(guān)突變位點、4個gyrA耐藥相關(guān)突變位點與CAM,LVX和MNZ之間的相互作用,以明確可能的耐藥相關(guān)突變位點。進一步利用自然轉(zhuǎn)化方法對篩選出的部分位點進行體外驗證。2.從TCGA數(shù)據(jù)庫中提取有或無H.pylori感染的胃癌患者RNA表達數(shù)據(jù),包括20例H.... 

【文章來源】：中國醫(yī)科大學遼寧省

【文章頁數(shù)】：62 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略語
第一部分 :幽門螺桿菌抗生素耐藥基因突變位點分析鑒定
    1 前言
    2 材料與方法
        2.1 主要試劑耗材和儀器設(shè)備
            2.1.1 主要試劑耗材
            2.1.2 主要儀器設(shè)備
        2.2 方法
            2.2.1 研究對象
            2.2.2 抗生素與耐藥相關(guān)基因的分子對接分析
            2.2.3 耐藥相關(guān)突變位點的自然轉(zhuǎn)化驗證
    3 結(jié)果
        3.1 H.pylori23Sr RNA突變位點分子對接分析
        3.2 H.pylori rdx A突變位點分子對接分析
        3.3 H.pylori gyr A突變位點分子對接分析
        3.4 H.pylori耐藥相關(guān)突變位點的自然轉(zhuǎn)化驗證
    4 討論
    5 結(jié)論
第二部分 :幽門螺桿菌感染相關(guān)胃癌ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡分析
    1 前言
    2 材料與方法
        2.1 主要試劑耗材和儀器設(shè)備
            2.1.1 主要試劑耗材
            2.1.2 主要儀器設(shè)備
        2.2 方法
            2.2.1 研究對象
            2.2.2 生物信息學分析
            2.2.3 H.pylori感染的判定
            2.2.4 組織總RNA提取、反轉(zhuǎn)錄及實時熒光定量PCR
        2.3 統(tǒng)計學分析
    3 結(jié)果
        3.1 H.pylori感染相關(guān)胃癌DElnc RNA,DEmi RNA和 DEm RNA的篩選鑒定
        3.2 H.pylori感染相關(guān)胃癌ce RNA網(wǎng)絡的建立
        3.3 參與ce RNA網(wǎng)絡的m RNA細胞功能和通路富集分析
        3.4 參與ce RNA網(wǎng)絡的lnc RNA和 mi RNA的預后分析
        3.5 差異表達lnc RNA的 q RT-PCR驗證
    4 討論
    5 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評價
參考文獻
綜述
    參考文獻
攻讀學位期間取得的研究成果
致謝
個人簡歷



本文編號：3158900