基于線粒體和核基因序列分析單環(huán)刺螠(Urechis unicinctus)種群遺傳多樣性
發(fā)布時(shí)間:2021-04-25 07:06
單環(huán)刺螠?zhǔn)且环N身體不分節(jié),兩側(cè)對(duì)稱(chēng),并有體腔的軟體海洋蠕蟲(chóng),具有豐富的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和藥用價(jià)值。隸屬螠蟲(chóng)動(dòng)物門(mén)(Echiurioidea)、螠綱(Echiurida)、無(wú)管螠目(Xenopneusta)、刺螠科(Urechidae)、刺螠屬(Urechis),是無(wú)管螠目在我國(guó)沿海分布的唯一種類(lèi)。其分布區(qū)狹窄,主要分布于中國(guó)渤海灣、韓國(guó)和日本海域。由于海洋污染導(dǎo)致單環(huán)刺螠棲息地減少,再加上過(guò)度捕撈致使其種群數(shù)量的大范圍縮減。然而,對(duì)于單環(huán)刺螠種群的遺傳多樣性和結(jié)構(gòu)都沒(méi)有采取過(guò)系統(tǒng)性研究。在本研究,我們收集了中國(guó)渤海灣(煙臺(tái)、大連、萊州、秦皇島、葫蘆島)、韓國(guó)慶尚道南?す6個(gè)地區(qū)105個(gè)單環(huán)刺螠樣品,并結(jié)合GenBank中9個(gè)COI和1個(gè)28S-rRNA日本樣品的基因序列,通過(guò)線粒體COI(457 bp),16S-rRNA(451bp)與核基因28S-rRNA(680 bp)基因片段,對(duì)單環(huán)刺螠種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析;贑OI序列,單環(huán)刺螠遺傳多樣性仍居于較高程度(單倍型多樣性:0.9595,核苷酸多樣性:0.0101)。在3個(gè)基因標(biāo)記中,由28S-rRNA序列所定義的遺傳多樣性最...
【文章來(lái)源】:魯東大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
第1章 引言
1.1 單環(huán)刺螠的研究概況
1.1.1 形態(tài)特征
1.1.2 分布及分類(lèi)地位
1.1.3 生殖和發(fā)育
1.1.4 營(yíng)養(yǎng)價(jià)值與藥用價(jià)值
1.1.5 研究現(xiàn)狀
1.1.6 待解決問(wèn)題
1.2 種群遺傳多樣性概述與研究方法
1.2.1 種群遺傳多樣性概述
1.2.2 種群遺傳多樣性研究方法
1.2.2.1 形態(tài)學(xué)方法
1.2.2.2 細(xì)胞方法
1.2.2.3 分子標(biāo)記方法
1.2.3 分子系統(tǒng)樹(shù)的構(gòu)建
1.2.3.1 距離矩陣法(Distance-matrixmethods)
1.2.3.2 最大簡(jiǎn)約法(Maximumparsimony)
1.2.3.3 最大似然法(MaximumLikelihoodmethod)
1.2.3.4 貝葉斯法(Bayesianmethod)
1.3 線粒體與核基因在海洋生物群體遺傳學(xué)的應(yīng)用
1.3.1 線粒體COI基因在海洋生物群體遺傳學(xué)的應(yīng)用
1.3.2 線粒體16S-rRNA基因在海洋動(dòng)物群體遺傳學(xué)的應(yīng)用
1.3.3 核基因28S-rRNA在海洋動(dòng)物群體遺傳學(xué)的應(yīng)用
1.4 本研究的目的與意義
第2章 材料與方法
2.1 供試材料
2.2 DNA的提取
2.3 PCR擴(kuò)增
2.4 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)
2.5 序列測(cè)定
2.6 數(shù)據(jù)處理
2.6.1 序列分析
2.6.2 單倍型系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系
2.6.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)
2.6.4 種群歷史動(dòng)態(tài)
第3章 結(jié)果分析
3.1 單環(huán)刺螠遺傳多樣性
3.2 單環(huán)刺螠種群遺傳結(jié)構(gòu)
3.3 單環(huán)刺螠群體歷史動(dòng)態(tài)
第4章 討論
4.1 單環(huán)刺螠遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu)
4.2 單環(huán)刺螠種群歷史動(dòng)態(tài)
第5章 總結(jié)
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3158943
【文章來(lái)源】:魯東大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
第1章 引言
1.1 單環(huán)刺螠的研究概況
1.1.1 形態(tài)特征
1.1.2 分布及分類(lèi)地位
1.1.3 生殖和發(fā)育
1.1.4 營(yíng)養(yǎng)價(jià)值與藥用價(jià)值
1.1.5 研究現(xiàn)狀
1.1.6 待解決問(wèn)題
1.2 種群遺傳多樣性概述與研究方法
1.2.1 種群遺傳多樣性概述
1.2.2 種群遺傳多樣性研究方法
1.2.2.1 形態(tài)學(xué)方法
1.2.2.2 細(xì)胞方法
1.2.2.3 分子標(biāo)記方法
1.2.3 分子系統(tǒng)樹(shù)的構(gòu)建
1.2.3.1 距離矩陣法(Distance-matrixmethods)
1.2.3.2 最大簡(jiǎn)約法(Maximumparsimony)
1.2.3.3 最大似然法(MaximumLikelihoodmethod)
1.2.3.4 貝葉斯法(Bayesianmethod)
1.3 線粒體與核基因在海洋生物群體遺傳學(xué)的應(yīng)用
1.3.1 線粒體COI基因在海洋生物群體遺傳學(xué)的應(yīng)用
1.3.2 線粒體16S-rRNA基因在海洋動(dòng)物群體遺傳學(xué)的應(yīng)用
1.3.3 核基因28S-rRNA在海洋動(dòng)物群體遺傳學(xué)的應(yīng)用
1.4 本研究的目的與意義
第2章 材料與方法
2.1 供試材料
2.2 DNA的提取
2.3 PCR擴(kuò)增
2.4 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)
2.5 序列測(cè)定
2.6 數(shù)據(jù)處理
2.6.1 序列分析
2.6.2 單倍型系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系
2.6.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)
2.6.4 種群歷史動(dòng)態(tài)
第3章 結(jié)果分析
3.1 單環(huán)刺螠遺傳多樣性
3.2 單環(huán)刺螠種群遺傳結(jié)構(gòu)
3.3 單環(huán)刺螠群體歷史動(dòng)態(tài)
第4章 討論
4.1 單環(huán)刺螠遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu)
4.2 單環(huán)刺螠種群歷史動(dòng)態(tài)
第5章 總結(jié)
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3158943
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