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根癌農(nóng)桿菌趨化操縱子中甲基受體趨化蛋白編碼基因atu0514的功能鑒定

發(fā)布時(shí)間:2021-04-13 16:18
  根癌農(nóng)桿菌屬于革蘭氏陰性菌,能夠?qū)⒆陨鞹i質(zhì)粒上的一段T-DNA序列轉(zhuǎn)移并整合到植物基因組中,從而引起多數(shù)雙子葉植物產(chǎn)生冠癭瘤。在自然環(huán)境中,根癌農(nóng)桿菌通常位于植物的根際周?chē)?趨化是其與宿主相互作用的重要的第一個(gè)過(guò)程。只有根癌農(nóng)桿菌對(duì)宿主釋放的化學(xué)信號(hào)進(jìn)行趨化響應(yīng),才能與植物宿主細(xì)胞發(fā)生接觸,侵染和致瘤的過(guò)程。趨化是能動(dòng)細(xì)菌的一種重要的適應(yīng)性行為,它能促使細(xì)菌向引誘物方向運(yùn)動(dòng)或遠(yuǎn)離排斥物。這些化學(xué)效應(yīng)物主要被甲基受體趨化蛋白(MCP)所感知。根癌農(nóng)桿菌C58的基因組中有20個(gè)編碼MCP同源蛋白的基因。只有atu0514基因位于編碼根癌農(nóng)桿菌趨化系統(tǒng)的操縱子內(nèi)部。與大多數(shù)細(xì)菌中的MCP不同,atu0514編碼的MCP沒(méi)有胞外結(jié)構(gòu)域,并且由配體結(jié)構(gòu)域protoglobin、HAMP和胞質(zhì)信號(hào)域MA組成。因此,需要研究atu0514基因編碼蛋白的功能和定位。本實(shí)驗(yàn)以野生型的根癌農(nóng)桿菌C58為實(shí)驗(yàn)材料,通過(guò)無(wú)標(biāo)記反向篩選的方法,獲得atu0514基因缺失株,并通過(guò)質(zhì);匮a(bǔ),得到回補(bǔ)菌株。通過(guò)對(duì)野生型菌株、atu0514突變株和回補(bǔ)株的生長(zhǎng)曲線測(cè)定,發(fā)現(xiàn)缺失atu0514基因不影響根癌農(nóng)桿菌的生... 

【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省

【文章頁(yè)數(shù)】:80 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

根癌農(nóng)桿菌趨化操縱子中甲基受體趨化蛋白編碼基因atu0514的功能鑒定


圖1-1大腸桿菌的趨化信號(hào)通路(Guo?etal.,?2017)??Fig?1-1?Chemotactic?signaling?pathways?in?Escherichia?coli?(Guo?et?al.,?2017)??3??

拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)圖,受體,甲基,拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)


??[?1-8?TM?!?I?1>8TM?]??T?T?n?(III?IIII??■?§?i?■?I?11?(I?i?i?i?I??—?「A…逢邏??J—L?gan<3?binding?domain?^?—?Signaling?domain??I??Transmembrane?(TM)?helix?|?HAMP?region?^??Bacteria?(%)?丨 ̄^?4?JP—?5?8??Archaca?(%)?38?2?〇?17?29?\?14?]??圖1-3基于膜拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和LBD的甲基受體趨化蛋白的分類(lèi)(Salah?and?Roujeinikova,2017)??Fig?1-3?Classification?of?methyl?accepting?chemotactic?proteins?based?on?membrane?topology??and?LBD?(Salah?and?Roujeinikova,?2017)??1.3.2可溶性甲基受體趨化蛋白的研宄??按照配體結(jié)合結(jié)構(gòu)域(LBD)所在的位置,可以將甲基受體趨化蛋白分為兩種,??分別是跨膜受體和可溶性胞內(nèi)受體。根據(jù)SMART數(shù)據(jù)庫(kù)完整基因組中的8384個(gè)由??MA結(jié)構(gòu)域來(lái)定義的化學(xué)受體進(jìn)行分析,其中,14%的化學(xué)受體位于細(xì)胞質(zhì)中并缺乏跨??膜結(jié)構(gòu)域,被稱(chēng)為可溶性化學(xué)受體。而在古細(xì)菌中,細(xì)胞質(zhì)化學(xué)感受器更為豐富,約??43%的化學(xué)受體位于細(xì)胞質(zhì)中(Schultz?et?al.,1998)。之前,細(xì)胞質(zhì)化學(xué)受體被稱(chēng)為是??IV類(lèi)化學(xué)感受器(Zhulin,?2001),隨后根據(jù)N端MA結(jié)構(gòu)域多肽鏈的長(zhǎng)度進(jìn)一步分為??兩類(lèi)(Lacaleta

可溶性,受體,化學(xué),細(xì)胞


?第1章綜述???酶活性,并且能夠與染色體DNA相互作用,從而固定受體簇的定位。??如圖1-4G所示,一些胞質(zhì)化學(xué)感受器具有動(dòng)態(tài)定位。如黃色粘桿菌(A(vxococcw^??xanf/ms)中的可溶性受體FrzCD,FrzCD控制細(xì)菌聚集和饑餓狀態(tài)下子實(shí)體的形成??(Zusmanetal.,2007)。FrzCD對(duì)細(xì)胞間的相互作用非常敏感,并且橫跨細(xì)胞長(zhǎng)度以螺??旋狀的細(xì)絲排列,顯示了一種動(dòng)態(tài)定位!鲇袃煞N形式的滑行運(yùn)動(dòng),二者均依??賴于細(xì)胞的翻轉(zhuǎn)而非鞭毛的運(yùn)動(dòng)。熒光定位顯示FrzCD定位于覆蓋細(xì)胞長(zhǎng)度的螺旋絲??中,并且FrzCD在這些結(jié)構(gòu)中是動(dòng)態(tài)的,不斷改變它的位置、數(shù)量和強(qiáng)度(Moineetal.,??2014)。??Primarily?Polar??A.?HemAT?B?.?YfmS?C?.?IcpA、”?D.Mcp、??Distinct?from??Diffuse?and?Polar?transmembrane?Dynamic??E.AerC.a?F.TIpC^?G.?FrzCD??■■■■??Oxygen?Nitrogen?fixation??圖1-4可溶性化學(xué)受體的細(xì)胞定位(Collins?etal.,?2014)??Fig?1-4?Cellular?localization?of?soluble?chemical?receptors?(Collins?et?al.,?2014)??1.4研宄目的及意義??自然環(huán)境中,根癌農(nóng)桿菌通常位于植物根際附近,趨化是其與受傷的植物宿主相??互作用的第一個(gè)過(guò)程,這一過(guò)程非常重要。只有根癌農(nóng)桿菌響應(yīng)并趨向于植物宿主釋??放的化學(xué)信號(hào),才能與植物宿主細(xì)胞發(fā)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]農(nóng)桿菌T4SS的結(jié)構(gòu)及其底物轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)理的最新進(jìn)展[J]. 徐麗萍,孫盼,郭敏亮.  生命科學(xué). 2016(03)
[2]農(nóng)桿菌T-復(fù)合物的形成與轉(zhuǎn)運(yùn)研究進(jìn)展[J]. 郭敏亮,高佃坤,金英善.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2009(11)
[3]產(chǎn)生無(wú)標(biāo)記農(nóng)桿菌突變體方法的建立及優(yōu)化(英文)[J]. 郭敏亮,諸慶,高佃坤.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2009(05)



本文編號(hào):3135623

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