花青素是一類廣泛存在于植物中的水溶性色素,作為一種強自由基清除劑,具有抗炎、抗氧化、降血壓、降血糖等多種保健功能。紫芽茶樹作為一種高花青素含量的優(yōu)異性茶樹資源,其研究與利用越來越受人們的關注。茶樹花青素代謝途徑的研究起步較晚,相比于模式植物而言還不夠成熟。部分參與花青素合成的基因雖已被克隆驗證,但是茶樹花青素代謝途徑是一個復雜的網絡結構,受到多個代謝途徑的共同影響,由一系列的酶催化完成,其機理的揭示有待進一步探究。茶樹紫芽品系9803新梢芽葉全年均表現為紫色,是研究花青素合成機制的天然材料。本研究對湖南農業(yè)大學自選紫芽品系9803與綠芽品系9806進行轉錄組測序及生物信息學分析,在轉錄組水平上篩選出了與茶樹紫芽花青素代謝相關的差異基因,為進一步揭示茶樹紫芽產生的分子機理奠定了基礎。主要研究結果如下:（1）通過Illumina深度測序,構建了茶樹紫芽品系9803和綠芽品系9806共6個轉錄組文庫,去除掉帶接頭及低質量的reads后,共獲得42.83G的高質量數據。（2）通過可變剪切分析,在紫芽品系9803和綠芽品系9806的比較中,發(fā)現286個差異AS事件,其中144個差異AS事件在紫芽... 

【文章來源】：湖南農業(yè)大學湖南省

【文章頁數】：61 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮寫詞（Abbreviation）
第1章 緒論
    1 植物花青素研究進展
        1.1 花青素的結構與性質
        1.2 花青素的生物合成途徑
        1.3 花青素代謝調控機制
            1.3.1 調控花青素合成的MYB轉錄因子
            1.3.2 調控花青素合成的b HLH轉錄因子
            1.3.3 調控花青素合成的WD40 轉錄因子
            1.3.4 MBW三聚復合物調控機制
        1.4 影響花青素生物合成的環(huán)境因素
    2 茶樹花青素研究進展
        2.1 茶樹花青素的生物化學性質及其功能
        2.2 茶樹花青素代謝途徑
        2.3 茶樹紫芽花青素的提取工藝
        2.4 影響茶樹花青素生物合成的環(huán)境因素
    3.轉錄組測序技術研究進展
        3.1 轉錄組測序技術的發(fā)展
            3.1.1 454測序技術
            3.1.2 Solexa測序技術
            3.1.3 SOLiD測序技術
        3.2 轉錄組測序技術的應用
            3.2.1 未知基因的發(fā)掘
            3.2.2 分子標記的開發(fā)
            3.2.3 相關代謝途徑的研究
    4 研究目的與意義
    5 研究內容與技術路線
        5.1 研究內容
        5.2 技術路線
第2章 茶樹紫芽花青素合成基因篩選及差異表達分析
    1 材料與方法
        1.1 材料
        1.2 試劑
        1.3 儀器
        1.4 方法
            1.4.1 花青素含量的測定
            1.4.2 RNA的提取
            1.4.3 RNA的質量檢測
            1.4.4 cDNA文庫的構建及轉錄組測序
            1.4.5 測序數據的過濾
            1.4.6 參考序列的比對
            1.4.7 可變剪切分析
            1.4.8 SNP和 InDel分析
            1.4.9 基因結構的優(yōu)化與新轉錄本預測
            1.4.10 基因表達水平分析
            1.4.11 RNA-Seq相關性分析
            1.4.12 差異基因的篩選
            1.4.13 差異基因表達分析
            1.4.14 熒光定量PCR驗證轉錄組數據
            1.4.15 數據分析
    2 結果與分析
        2.1 樣品花青素的含量
        2.2 RNA的提取
        2.3 mRNA測序數據總體情況
        2.4 參考序列比對結果
        2.5 可變剪切分析
        2.6 SNP和 InDel分析
        2.7 基因結構的優(yōu)化與新轉錄本預測
        2.8 基因表達水平分析
        2.9 RNA-Seq相關性分析
        2.10 差異基因的篩選
        2.11 差異基因表達分析
            2.11.1 差異基因GO富集分析
            2.11.2 差異基因KEGG富集分析
            2.11.3 差異基因聚類分析
        2.12 熒光定量PCR分析差異基因表達水平
    3 小結
    4 討論
第3章 全文總結
    3.1 主要研究成果
    3.2 創(chuàng)新點
    3.3 展望
參考文獻
致謝
作者簡介



本文編號：3133792