基于CRISPR/Cas9系統(tǒng)的水稻OsMPK15基因編輯
發(fā)布時(shí)間:2021-04-12 13:14
促分裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated protein kinase,MAPK)普遍存在于包括酵母、植物、哺乳動(dòng)物等在內(nèi)的真核生物中,在進(jìn)化過(guò)程中高度保守,已明確的功能包括細(xì)胞分裂、細(xì)胞分化、生物與非生物脅迫應(yīng)答、激素應(yīng)答等,涉及生物生長(zhǎng)發(fā)育的全過(guò)程。實(shí)驗(yàn)室前期從日本晴水稻根組織中克隆了水稻MAPK基因OsMPK15的cDNA編碼區(qū),并發(fā)現(xiàn)OsMPK15基因在水稻多種組織中呈現(xiàn)差異表達(dá)特征,其中在葉和葉鞘中表達(dá)量最高。該基因?qū)Νh(huán)境脅迫信號(hào)和激素信號(hào)均有響應(yīng),其中對(duì)干旱和ABA最為敏感。提示該基因可能涉及水稻葉片的相關(guān)功能,極有可能還參與水稻非生物脅迫應(yīng)答過(guò)程。為鑒定OsMPK15基因的功能,本文采用CRISPR/Cas9基因組編輯技術(shù)構(gòu)建OsMPK15基因敲除水稻,旨在進(jìn)一步研究該基因在水稻生長(zhǎng)發(fā)育中的作用。采用CRISPR/Cas9技術(shù)構(gòu)建了OsMPK15基因敲除載體,通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法轉(zhuǎn)化日本晴水稻愈傷組織,經(jīng)篩選獲得3個(gè)純合轉(zhuǎn)基因株系,分別命名為mpk15-1、mpk15-7、mpk15-8。靶位點(diǎn)特異性分析顯示,3個(gè)株系均未發(fā)生脫靶效應(yīng)。觀察比較mpk15-...
【文章來(lái)源】:河南師范大學(xué)河南省
【文章頁(yè)數(shù)】:79 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
CRISPR/Cas系統(tǒng)作用的3個(gè)階段(引自MakarovaKS,2011)
Cas9 包含兩個(gè)瓣葉結(jié)構(gòu),分別為識(shí)別瓣葉和核酸酶瓣葉[13]。識(shí)別瓣葉 gRNA:DNA 復(fù)合體的識(shí)別與結(jié)合,核酸酶瓣葉負(fù)責(zé)切割 DNA 雙鏈。核酸酶瓣葉包含 HNH 和 RuvC 兩個(gè)核酸結(jié)構(gòu)域[14],用來(lái)切割和降解傳元件。NHN 切割與 sgRNA 互補(bǔ)結(jié)合的 DNA 單鏈,RuvC 切割另一,這兩個(gè)核酸結(jié)構(gòu)域各司其職,對(duì)入侵的外源遺傳元件進(jìn)行切割或降通過(guò)靶序列 20 個(gè)核苷酸的簡(jiǎn)單改造,Cas9 可重新編輯以靶向切割任何,靶向序列通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)引導(dǎo)至靶基因位點(diǎn),需要注意的是,所選因位點(diǎn)后必須緊接著 5'-NGG-3('protospacer-adjacent motif, PAM)位點(diǎn)對(duì)于化膿性鏈球菌 Cas9(Streptococcus pyogenes Cas9,SpCas9)的活性少的。將 crRNA 與 tracrRNA 融合,在 5'末端插入 20bp 的靶序列(間隔 sgRNA[15,16]。sgRNA 的改造使 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)最大限度地簡(jiǎn)化為兩Cas9 蛋白和 sgRNA,從而創(chuàng)建了一個(gè)簡(jiǎn)單、高效的基因組工程工具。
配酶切割法法利用的是一類(lèi)特殊的 DNA 酶,它們能夠在單個(gè)或多個(gè)核苷酸形行切割,包括 T7 endonuclease I, T7EI、Surveyor 核酸酶、Cruise酶在錯(cuò)配堿基位點(diǎn)上的活性顯著高于正確互補(bǔ)配對(duì)的堿基位點(diǎn)。因首先是 PCR 擴(kuò)增靶序列,然后待檢測(cè) DNA 擴(kuò)增產(chǎn)物與野生型 D合,高溫變性后,退火形成 DNA 雜交雙鏈,進(jìn)而采用 EMC 法檢糖凝膠電泳圖中條帶數(shù)目和片段大小來(lái)判斷靶序列上是否存在 1-3)。與 PCR/RE 法相比 EMC 法適用于任何靶序列,使用更為也可以在一定程度上切割非錯(cuò)配的同源雙鏈 DNA[65,66],所以檢測(cè)CR / RE 法,同時(shí)也比較耗時(shí)費(fèi)力[9,60]。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]A simple and efficient method for CRISPR/Cas9-induced mutant screening[J]. Yufeng Hua,Chun Wang,Jian Huang,Kejian Wang. Journal of Genetics and Genomics. 2017(04)
[2]彩葉草對(duì)模擬干旱脅迫的生理響應(yīng)[J]. 劉愛(ài)榮,張遠(yuǎn)兵,張雪平,王雪娟,黃守程,謝宜勤. 廣西植物. 2015(05)
[3]Heterotrimeric G protein α subunit is involved in rice brassinosteroid response[J]. Lei Wang~(1,2) Yun-Yuan Xu~1 Qi-Bin Ma~(1,2) Dan Li~(1,2) Zhi-Hong Xu~(1,3) Kang Chong~(1,3) 1 Key Laboratory of Photosynthesis and Environmental Molecular Physiology,Institute of Botany,Chinese Academy of Sciences,Nanxincun 20,Xiangshan,Beijing 100093,China,2 Graduate School of the Chinese Academv of Sciences,100046 Beijing,China;3 National Plant Gene Research Center (Beijing),Beijing 100093,China. Cell Research. 2006(12)
[4]紫外分光光度技術(shù)測(cè)定植物細(xì)胞中H2O2的含量[J]. 夏金嬋,苗雨晨,宋純鵬,苗琛. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2005(06)
[5]花粉的保存及其生活力測(cè)定[J]. 王欽麗,盧龍斗,吳小琴,陳祖鏗,林金星. 植物學(xué)通報(bào). 2002(03)
[6]抗壞血酸過(guò)氧化物酶活性測(cè)定的探討[J]. 沈文飚,徐朗萊,葉茂炳,張榮銑. 植物生理學(xué)通訊. 1996(03)
[7]植物胚胎學(xué)實(shí)驗(yàn)方法 (一)花粉生活力的測(cè)定[J]. 胡適宜. 植物學(xué)通報(bào). 1993(02)
[8]杏果實(shí)成熟衰老過(guò)程中活性氧和幾種生理指標(biāo)的變化(簡(jiǎn)報(bào))[J]. 任小林,李嘉瑞. 植物生理學(xué)通訊. 1991(01)
[9]水稻葉片葉綠素含量與株型的關(guān)系及葉位葉綠素含量的變化[J]. 沈福成. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 1986(01)
本文編號(hào):3133359
【文章來(lái)源】:河南師范大學(xué)河南省
【文章頁(yè)數(shù)】:79 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
CRISPR/Cas系統(tǒng)作用的3個(gè)階段(引自MakarovaKS,2011)
Cas9 包含兩個(gè)瓣葉結(jié)構(gòu),分別為識(shí)別瓣葉和核酸酶瓣葉[13]。識(shí)別瓣葉 gRNA:DNA 復(fù)合體的識(shí)別與結(jié)合,核酸酶瓣葉負(fù)責(zé)切割 DNA 雙鏈。核酸酶瓣葉包含 HNH 和 RuvC 兩個(gè)核酸結(jié)構(gòu)域[14],用來(lái)切割和降解傳元件。NHN 切割與 sgRNA 互補(bǔ)結(jié)合的 DNA 單鏈,RuvC 切割另一,這兩個(gè)核酸結(jié)構(gòu)域各司其職,對(duì)入侵的外源遺傳元件進(jìn)行切割或降通過(guò)靶序列 20 個(gè)核苷酸的簡(jiǎn)單改造,Cas9 可重新編輯以靶向切割任何,靶向序列通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)引導(dǎo)至靶基因位點(diǎn),需要注意的是,所選因位點(diǎn)后必須緊接著 5'-NGG-3('protospacer-adjacent motif, PAM)位點(diǎn)對(duì)于化膿性鏈球菌 Cas9(Streptococcus pyogenes Cas9,SpCas9)的活性少的。將 crRNA 與 tracrRNA 融合,在 5'末端插入 20bp 的靶序列(間隔 sgRNA[15,16]。sgRNA 的改造使 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)最大限度地簡(jiǎn)化為兩Cas9 蛋白和 sgRNA,從而創(chuàng)建了一個(gè)簡(jiǎn)單、高效的基因組工程工具。
配酶切割法法利用的是一類(lèi)特殊的 DNA 酶,它們能夠在單個(gè)或多個(gè)核苷酸形行切割,包括 T7 endonuclease I, T7EI、Surveyor 核酸酶、Cruise酶在錯(cuò)配堿基位點(diǎn)上的活性顯著高于正確互補(bǔ)配對(duì)的堿基位點(diǎn)。因首先是 PCR 擴(kuò)增靶序列,然后待檢測(cè) DNA 擴(kuò)增產(chǎn)物與野生型 D合,高溫變性后,退火形成 DNA 雜交雙鏈,進(jìn)而采用 EMC 法檢糖凝膠電泳圖中條帶數(shù)目和片段大小來(lái)判斷靶序列上是否存在 1-3)。與 PCR/RE 法相比 EMC 法適用于任何靶序列,使用更為也可以在一定程度上切割非錯(cuò)配的同源雙鏈 DNA[65,66],所以檢測(cè)CR / RE 法,同時(shí)也比較耗時(shí)費(fèi)力[9,60]。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]A simple and efficient method for CRISPR/Cas9-induced mutant screening[J]. Yufeng Hua,Chun Wang,Jian Huang,Kejian Wang. Journal of Genetics and Genomics. 2017(04)
[2]彩葉草對(duì)模擬干旱脅迫的生理響應(yīng)[J]. 劉愛(ài)榮,張遠(yuǎn)兵,張雪平,王雪娟,黃守程,謝宜勤. 廣西植物. 2015(05)
[3]Heterotrimeric G protein α subunit is involved in rice brassinosteroid response[J]. Lei Wang~(1,2) Yun-Yuan Xu~1 Qi-Bin Ma~(1,2) Dan Li~(1,2) Zhi-Hong Xu~(1,3) Kang Chong~(1,3) 1 Key Laboratory of Photosynthesis and Environmental Molecular Physiology,Institute of Botany,Chinese Academy of Sciences,Nanxincun 20,Xiangshan,Beijing 100093,China,2 Graduate School of the Chinese Academv of Sciences,100046 Beijing,China;3 National Plant Gene Research Center (Beijing),Beijing 100093,China. Cell Research. 2006(12)
[4]紫外分光光度技術(shù)測(cè)定植物細(xì)胞中H2O2的含量[J]. 夏金嬋,苗雨晨,宋純鵬,苗琛. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2005(06)
[5]花粉的保存及其生活力測(cè)定[J]. 王欽麗,盧龍斗,吳小琴,陳祖鏗,林金星. 植物學(xué)通報(bào). 2002(03)
[6]抗壞血酸過(guò)氧化物酶活性測(cè)定的探討[J]. 沈文飚,徐朗萊,葉茂炳,張榮銑. 植物生理學(xué)通訊. 1996(03)
[7]植物胚胎學(xué)實(shí)驗(yàn)方法 (一)花粉生活力的測(cè)定[J]. 胡適宜. 植物學(xué)通報(bào). 1993(02)
[8]杏果實(shí)成熟衰老過(guò)程中活性氧和幾種生理指標(biāo)的變化(簡(jiǎn)報(bào))[J]. 任小林,李嘉瑞. 植物生理學(xué)通訊. 1991(01)
[9]水稻葉片葉綠素含量與株型的關(guān)系及葉位葉綠素含量的變化[J]. 沈福成. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 1986(01)
本文編號(hào):3133359
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