發(fā)布時間：2021-04-12 13:18

　　背景大腸癌是嚴(yán)重危害人類生命健康、降低人類生存質(zhì)量的下消化道惡性腫瘤,包括結(jié)腸癌和直腸癌。早期識別、診斷和治療大腸癌對改善疾病預(yù)后有著重要的意義。然而,目前大腸癌的發(fā)病機制尚未明確闡述,DNA甲基化作為表觀遺傳學(xué)修飾的重要組成部分,與包括大腸癌在內(nèi)的多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。篩選疾病特異性甲基化基因、構(gòu)建疾病特異甲基化表達譜是當(dāng)前研究的熱點之一。目的應(yīng)用基因芯片技術(shù)對大腸癌和癌旁正常黏膜組織標(biāo)本進行差異甲基化分析,初篩樣本中差異甲基化位點和區(qū)域,構(gòu)建大腸癌特異性甲基化基因表達譜。對篩選出的差異甲基化位點和區(qū)域進行GO和KEGG分析,為進一步闡明大腸癌發(fā)生發(fā)展的分子機制、尋找潛在的特異性早期大腸癌診斷分子標(biāo)志物及可能的基因靶向治療位點提供理論依據(jù)。方法應(yīng)用美國Illumina公司基因甲基化450k芯片對上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟醫(yī)院6例大腸癌患者的癌組織和癌旁正常黏膜組織標(biāo)本進行差異甲基化分析,包括差異甲基化位點分析、差異甲基化區(qū)域分析及亞組差異甲基化位點分析,共分析位點431467個,按P值篩選出差異甲基化位點和區(qū)域,按甲基化β差值區(qū)分高甲基化和低甲基化。并對篩選出的差異甲基化位點和... 

【文章來源】：上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：52 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

各樣本的電泳圖譜

上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文表 2 各樣本過濾掉的探針比例Table 2 The proportion of probes filtered out in samples稱 過濾探針比例 樣本名稱 過濾探針C 0.00024 04-P 0.0002C 0.00017 31-P 0.0001C 0.00062 36-P 0.0007C 0.00056 46-P 0.0005C 0.00020 68-P 0.0002C 0.00067 82-P 0.0006

0.00017 31-P 0.00016 0.00062 36-P 0.00070 0.00056 46-P 0.00056 0.00020 68-P 0.00021 0.00067 82-P 0.00062圖 2-1 各樣本原始 β 值的探針密度分布Fig. 2-1 The probe density plot of raw data of each sample

【參考文獻】：
期刊論文
[1]非編碼RNA在Barrett食管中作用的研究[J]. 余捷,薛寒冰.  胃腸病學(xué). 2017(07)
[2]腫瘤的表觀遺傳學(xué)研究[J]. 孫樹漢.  中國腫瘤生物治療雜志. 2008(01)



本文編號：3133364