基于RNAi干擾美國白蛾神經(jīng)肽F及其受體基因功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-04-09 20:40
美國白蛾(Hyphantria cunea Drury)是一種世界性檢疫害蟲,危害多種植物,給社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展、生態(tài)環(huán)境造成嚴(yán)重?fù)p失。昆蟲神經(jīng)肽能夠激活G蛋白偶聯(lián)受體(G Protein coupled receptors,GPCRs),從而調(diào)控多種生理功能,破壞昆蟲神經(jīng)肽信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)可以達(dá)到控制害蟲的目的。本研究以美國白蛾為研究對(duì)象,克隆獲得神經(jīng)肽(Neuropeptides F,NPF)和短神經(jīng)肽(Short neuropeptide F,sNPF)及其受體基因cDNA全長(zhǎng),并利用RNAi技術(shù)(dsRNA和siRNA)進(jìn)行基因功能研究,對(duì)NPF/NPFR基因功能和對(duì)美國白蛾取食及生殖、饑餓脅迫進(jìn)行了功能分析,具體結(jié)論如下:1、成功鑒定出 HcNPF、HcsNPF、HcNPFR、HcsNPFR-A10 與 HcsNPFR-A11 基因,獲得其全長(zhǎng)基因序列,基因閱讀框(ORF)長(zhǎng)246~1401bp,編碼81~466個(gè)氨基酸,蛋白的分子質(zhì)量為9.25kDa~52.94kDa,pI為6.73~9.25,HcsNPFR-A10為酸性蛋白,其余為堿性蛋白。HcNPF和HscNPF均含信號(hào)肽。成熟肽的...
【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2美國白蛾各組織總RNA??Fig.?2-2?Total?RNA?of?different?tissues?in?H.?cunca??注:1:頭;2:中腸;3:卵巢;4:精巢
ale程序計(jì)??算美國白蛾NPF蛋白的疏水性圖譜,HcNPFR的疏水性較強(qiáng),最大值達(dá)到3.456,且位??于N端的信號(hào)肽剪切處,最小值為-3.133。氨基酸疏水性較強(qiáng)位在75,85,111,150,??185,?247,?276位附近,而氨基酸親水性較強(qiáng)位在59,265,354位附近。HcNPF蛋白??中亮氨酸Leu?(48?jìng)(gè))的相對(duì)含量最多占氨基酸總數(shù)的12.28%。信號(hào)肽預(yù)測(cè)結(jié)果顯??示,HcNPFR不含信號(hào)肽序列。跨膜結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示,HcNPFR蛋白擁有7個(gè)跨膜螺??旋結(jié)構(gòu)(圖2-6)。HcNPFR蛋白的保守結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果顯示,HcNPFR蛋白具有G蛋??白偶聯(lián)受體家族典型的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)7個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,屬于GPCRs家族(圖2-7)。??TMHMM?posterior?probabilities?for?HcNPFR??1.2??.?.?■???■?.?.???"OffiE??50?100?150?200?250?300?350??transmembrane???inside??outside????圖2-6?TMHMM軟件分析HcNPFR跨膜區(qū)結(jié)果??Fig.?2-6?Prediction?of?transmembrane?regions?of?HcNPFR?using?TMHMM?software??I?.?.?,?.?T?,?.?.?.?y?.?.?.?,?,?T?.?.?>?F?"f?.?w???■.?y?■?...?y?T??^?B?balls?I?v?■?kails??b?b?ib?m?hath??Superfanilies?7t-nj_fIPnR!=:
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國林業(yè)檢疫性有害生物發(fā)生動(dòng)態(tài)分析[J]. 董瀛謙,李娟,潘佳亮,朱寧波,姜雄,宋玉雙. 植物檢疫. 2019(06)
[2]美國白蛾HcSID-1基因的克隆、表達(dá)模式分析及其在幼蟲中的功能驗(yàn)證[J]. 王越,張?zhí)K芳,徐瑤,劉福,孔祥波,張真. 林業(yè)科學(xué). 2019(10)
[3]害蟲遺傳防控技術(shù)的研究與應(yīng)用[J]. 徐雪嬌,何瑋毅,楊婕,陳瑋,尤民生. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2019(08)
[4]RNAi在昆蟲基因功能研究中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 張濤,郅軍銳,葉茂. 山地農(nóng)業(yè)生物學(xué)報(bào). 2018(06)
[5]RNAi技術(shù)在農(nóng)業(yè)害蟲防治中的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 王聰,蔡普默,張琪文,楊燕川,陳家驊. 中國植保導(dǎo)刊. 2018(06)
[6]美國白蛾Wnt-1基因的基因組編輯[J]. 劉慧慧,張永安,王玉珠,曾寶勝,劉群,張真. 林業(yè)科學(xué). 2017(03)
[7]美國白蛾發(fā)生現(xiàn)狀及治理策略探討[J]. 林曉,邱立新,曲濤,盧修亮. 中國森林病蟲. 2016(05)
[8]家蠶神經(jīng)肽及其受體的功能和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 李曉童,時(shí)連根. 昆蟲學(xué)報(bào). 2016(07)
[9]昆蟲神經(jīng)肽F的研究進(jìn)展[J]. 黃一村,時(shí)敏,陳學(xué)新. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報(bào). 2015(06)
[10]害蟲遺傳不育技術(shù)中致死基因的研究與應(yīng)用[J]. 王玉生,蔡玉音,武強(qiáng),嚴(yán)盈,張桂芬,劉桂清,萬方浩. 生物安全學(xué)報(bào). 2015(02)
博士論文
[1]褐飛虱神經(jīng)肽及其受體基因功能研究[D]. 王斯亮.浙江大學(xué) 2019
[2]桔小實(shí)蠅Tachykinin和Natalisin信號(hào)系統(tǒng)的生理功能及其藥靶潛力評(píng)估[D]. 桂順華.西南大學(xué) 2017
碩士論文
[1]棉鈴蟲神經(jīng)肽allatotropin G蛋白偶聯(lián)受體的克隆和鑒定[D]. 王郡.合肥工業(yè)大學(xué) 2016
本文編號(hào):3128278
【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2美國白蛾各組織總RNA??Fig.?2-2?Total?RNA?of?different?tissues?in?H.?cunca??注:1:頭;2:中腸;3:卵巢;4:精巢
ale程序計(jì)??算美國白蛾NPF蛋白的疏水性圖譜,HcNPFR的疏水性較強(qiáng),最大值達(dá)到3.456,且位??于N端的信號(hào)肽剪切處,最小值為-3.133。氨基酸疏水性較強(qiáng)位在75,85,111,150,??185,?247,?276位附近,而氨基酸親水性較強(qiáng)位在59,265,354位附近。HcNPF蛋白??中亮氨酸Leu?(48?jìng)(gè))的相對(duì)含量最多占氨基酸總數(shù)的12.28%。信號(hào)肽預(yù)測(cè)結(jié)果顯??示,HcNPFR不含信號(hào)肽序列。跨膜結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示,HcNPFR蛋白擁有7個(gè)跨膜螺??旋結(jié)構(gòu)(圖2-6)。HcNPFR蛋白的保守結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果顯示,HcNPFR蛋白具有G蛋??白偶聯(lián)受體家族典型的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)7個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,屬于GPCRs家族(圖2-7)。??TMHMM?posterior?probabilities?for?HcNPFR??1.2??.?.?■???■?.?.???"OffiE??50?100?150?200?250?300?350??transmembrane???inside??outside????圖2-6?TMHMM軟件分析HcNPFR跨膜區(qū)結(jié)果??Fig.?2-6?Prediction?of?transmembrane?regions?of?HcNPFR?using?TMHMM?software??I?.?.?,?.?T?,?.?.?.?y?.?.?.?,?,?T?.?.?>?F?"f?.?w???■.?y?■?...?y?T??^?B?balls?I?v?■?kails??b?b?ib?m?hath??Superfanilies?7t-nj_fIPnR!=:
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國林業(yè)檢疫性有害生物發(fā)生動(dòng)態(tài)分析[J]. 董瀛謙,李娟,潘佳亮,朱寧波,姜雄,宋玉雙. 植物檢疫. 2019(06)
[2]美國白蛾HcSID-1基因的克隆、表達(dá)模式分析及其在幼蟲中的功能驗(yàn)證[J]. 王越,張?zhí)K芳,徐瑤,劉福,孔祥波,張真. 林業(yè)科學(xué). 2019(10)
[3]害蟲遺傳防控技術(shù)的研究與應(yīng)用[J]. 徐雪嬌,何瑋毅,楊婕,陳瑋,尤民生. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2019(08)
[4]RNAi在昆蟲基因功能研究中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 張濤,郅軍銳,葉茂. 山地農(nóng)業(yè)生物學(xué)報(bào). 2018(06)
[5]RNAi技術(shù)在農(nóng)業(yè)害蟲防治中的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 王聰,蔡普默,張琪文,楊燕川,陳家驊. 中國植保導(dǎo)刊. 2018(06)
[6]美國白蛾Wnt-1基因的基因組編輯[J]. 劉慧慧,張永安,王玉珠,曾寶勝,劉群,張真. 林業(yè)科學(xué). 2017(03)
[7]美國白蛾發(fā)生現(xiàn)狀及治理策略探討[J]. 林曉,邱立新,曲濤,盧修亮. 中國森林病蟲. 2016(05)
[8]家蠶神經(jīng)肽及其受體的功能和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 李曉童,時(shí)連根. 昆蟲學(xué)報(bào). 2016(07)
[9]昆蟲神經(jīng)肽F的研究進(jìn)展[J]. 黃一村,時(shí)敏,陳學(xué)新. 應(yīng)用昆蟲學(xué)報(bào). 2015(06)
[10]害蟲遺傳不育技術(shù)中致死基因的研究與應(yīng)用[J]. 王玉生,蔡玉音,武強(qiáng),嚴(yán)盈,張桂芬,劉桂清,萬方浩. 生物安全學(xué)報(bào). 2015(02)
博士論文
[1]褐飛虱神經(jīng)肽及其受體基因功能研究[D]. 王斯亮.浙江大學(xué) 2019
[2]桔小實(shí)蠅Tachykinin和Natalisin信號(hào)系統(tǒng)的生理功能及其藥靶潛力評(píng)估[D]. 桂順華.西南大學(xué) 2017
碩士論文
[1]棉鈴蟲神經(jīng)肽allatotropin G蛋白偶聯(lián)受體的克隆和鑒定[D]. 王郡.合肥工業(yè)大學(xué) 2016
本文編號(hào):3128278
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