采用同源克隆方法從‘京紅’桃及其晚熟芽變果實中克隆出PpTIFY10b基因,初步分析了該基因的理化性質(zhì),并利用熒光定量PCR（RT-PCR）分析了該基因在‘京紅’桃以及其突變體中的表達情況,以期揭示桃果實成熟機制提供基本數(shù)據(jù)支持。結(jié)果表明:該基因開放閱讀框為639 bp,編碼213個氨基酸,等電點為9.04,為以絲氨酸為主的親水性不穩(wěn)定蛋白。同源性比對和結(jié)構(gòu)分析表明,該基因與其它植物TIFY10b蛋白具有較高的相似性,其中與梅的一致性最高,均含有1個TIFY功能結(jié)構(gòu)域和1個CCT基序。熒光定量PCR結(jié)果表明,該基因在桃及其晚熟芽變果實的生理成熟期表達量最高,但二者的表達規(guī)律有顯著差異,即晚熟芽變在S1、S4時期的基因表達量上調(diào),且明顯高于‘京紅’,表明PpTIFY10b基因參與了果實成熟調(diào)控。該研究為了解桃果實成熟期調(diào)控機制提供了新穎的理論數(shù)據(jù)。 

【文章來源】：北方園藝. 2020,(22)北大核心

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

電泳檢測圖

PpTIFY10b蛋白中TIFY結(jié)構(gòu)域分析

利用TMHMM預(yù)測表明,該蛋白的213個氨基酸都位于胞外,并不存在跨膜結(jié)構(gòu)域,可推斷PpTIFY10b是一種非跨膜蛋白,不發(fā)生跨膜運動(圖4A)。SingalP預(yù)測表明,該蛋白信號肽剪切位點的概率僅為0.1,故不存在信號肽(圖4B)。該蛋白的二級結(jié)構(gòu)以α-螺旋(h)和無規(guī)則卷曲(c)為主要結(jié)構(gòu),分別占24.41%和62.91%,其次為延長鏈(e)和轉(zhuǎn)角(t),分別占7.51%、5.16%,具體氨基酸位置見圖4C。利用同源建模方法對一級氨基酸序列搜索靶序列,預(yù)測出PpTIFY10b蛋白的三級結(jié)構(gòu)為一個α-螺旋的模型(圖4E),是擬南芥Myc3 N-末端結(jié)構(gòu)域(44～242)與JAZ10 Jas結(jié)構(gòu)域(166～192)的復(fù)合體的模板,由PpTIFY10b蛋白一級結(jié)構(gòu)中的第154～170位氨基酸構(gòu)成(圖4D)。圖4 PpTIFY10b蛋白的結(jié)構(gòu)預(yù)測圖

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3128209