中藥火麻仁基原植物大麻L(zhǎng)BD基因家族成員的鑒定與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-04-08 03:02
LBD(lateral organ boundaries)轉(zhuǎn)錄因子在植物生長(zhǎng)發(fā)育和次生代謝調(diào)控中起著重要作用。為了發(fā)掘大麻L(zhǎng)BD基因的功能,該研究在基因組和轉(zhuǎn)錄組水平上利用生物信息學(xué)手段,對(duì)大麻L(zhǎng)BD基因家族進(jìn)行系統(tǒng)鑒定,并對(duì)其表達(dá)模式進(jìn)行分析。結(jié)果表明,大麻L(zhǎng)BD基因家族含有32個(gè)成員,可分成2大類,7亞族,ClassⅠ分為5個(gè)亞族分別是ClassⅠa至ClassⅠe,ClassⅡ分為2個(gè)亞族分別是ClassⅡa和ClassⅡb;理化性質(zhì)分析顯示,大麻L(zhǎng)BD基因家族編碼的氨基酸數(shù)目為172~356,等電點(diǎn)為4.92~9.43,相對(duì)分子質(zhì)量為18 862.92~40 081.33,大部分成員定位于細(xì)胞核中;染色體定位顯示32個(gè)成員不均一地分布在大麻的10條染色體上;LBD轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)域、基因結(jié)構(gòu)和Motifs相對(duì)保守,不同類成員特征相近;基因上游啟動(dòng)子區(qū)含有多種植物激素及環(huán)境因子相關(guān)的順式作用元件,表明LBD基因的表達(dá)可能會(huì)受到激素和外界環(huán)境因素的誘導(dǎo);大麻L(zhǎng)BD基因在ZYS品種(低四氫大麻酚,高二...
【文章來源】:中國中藥雜志. 2020,45(22)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
大麻L(zhǎng)BD基因在染色體上的分布
大麻L(zhǎng)BD轉(zhuǎn)錄因子保守基序和基因結(jié)構(gòu)分析
LBD轉(zhuǎn)錄因子家族的3個(gè)保守基序
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]高大麻二酚(CBD)含量藥用大麻的新品種選育及生產(chǎn)[J]. 張際慶,陳士林,尉廣飛,寧康,王超群,王磊,陳華,董林林. 中國中藥雜志. 2019(21)
[2]藥用大麻種質(zhì)資源分類與研究策略[J]. 李秋實(shí),孟瑩,陳士林. 中國中藥雜志. 2019(20)
[3]中國工業(yè)大麻品種選育研究進(jìn)展[J]. 曹焜,王曉楠,孫宇峰,韓承偉,張曉艷,趙越,姜穎,韓喜財(cái),郭永霞. 中國麻業(yè)科學(xué). 2019(04)
[4]葡萄LBD基因家族的鑒定與表達(dá)分析[J]. 何紅紅,馬宗桓,張?jiān)?張娟,盧世雄,張志強(qiáng),趙鑫,吳玉霞,毛娟. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(21)
[5]蘿卜全基因組中LBD基因家族成員的鑒定與分析[J]. 劉同金,張曉雪,張曉輝,王海平,邱楊,宋江萍,李錫香. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2019(01)
[6]大麥ASYMMETRIC LEAVES2/LATERAL OR-GAN BOUNDARIES(AS2/LOB)基因家族的全基因組分析(英文)[J]. Bao-jian GUO,Jun WANG,Shen LIN,Zheng TIAN,Kai ZHOU,Hai-ye LUAN,Chao LYU,Xin-zhong ZHANG,Ru-gen XU. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2016(10)
[7]辣椒全基因組中LBD轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與表達(dá)分析[J]. 鄭忠凡,張亞利,胡燦,戴雄澤,劉峰,袁祖華. 園藝學(xué)報(bào). 2016(04)
[8]蒺藜苜蓿LBD轉(zhuǎn)錄因子基因家族全基因組分析[J]. 賈喜濤,劉文獻(xiàn),謝文剛,劉志鵬,劉志敏,王彥榮. 西北植物學(xué)報(bào). 2014(11)
[9]番茄LBD基因家族的全基因組序列鑒定及其進(jìn)化和表達(dá)分析[J]. 王小非,劉鑫,蘇玲,孫永江,張世忠,郝玉金,由春香. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(12)
[10]漢麻—一種高值特種生物質(zhì)資源及應(yīng)用[J]. 張華,張建春,張杰. 高分子通報(bào). 2011(08)
博士論文
[1]巨桉、毛果楊、雷蒙德氏棉LBD基因家族的研究[D]. 蘆強(qiáng).中國林業(yè)科學(xué)研究院 2017
碩士論文
[1]不同工業(yè)大麻品種耐鎘性及原花青素緩解鎘脅迫功能分析[D]. 黃玉敏.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2019
本文編號(hào):3124722
【文章來源】:中國中藥雜志. 2020,45(22)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
大麻L(zhǎng)BD基因在染色體上的分布
大麻L(zhǎng)BD轉(zhuǎn)錄因子保守基序和基因結(jié)構(gòu)分析
LBD轉(zhuǎn)錄因子家族的3個(gè)保守基序
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]高大麻二酚(CBD)含量藥用大麻的新品種選育及生產(chǎn)[J]. 張際慶,陳士林,尉廣飛,寧康,王超群,王磊,陳華,董林林. 中國中藥雜志. 2019(21)
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[3]中國工業(yè)大麻品種選育研究進(jìn)展[J]. 曹焜,王曉楠,孫宇峰,韓承偉,張曉艷,趙越,姜穎,韓喜財(cái),郭永霞. 中國麻業(yè)科學(xué). 2019(04)
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[5]蘿卜全基因組中LBD基因家族成員的鑒定與分析[J]. 劉同金,張曉雪,張曉輝,王海平,邱楊,宋江萍,李錫香. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2019(01)
[6]大麥ASYMMETRIC LEAVES2/LATERAL OR-GAN BOUNDARIES(AS2/LOB)基因家族的全基因組分析(英文)[J]. Bao-jian GUO,Jun WANG,Shen LIN,Zheng TIAN,Kai ZHOU,Hai-ye LUAN,Chao LYU,Xin-zhong ZHANG,Ru-gen XU. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2016(10)
[7]辣椒全基因組中LBD轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與表達(dá)分析[J]. 鄭忠凡,張亞利,胡燦,戴雄澤,劉峰,袁祖華. 園藝學(xué)報(bào). 2016(04)
[8]蒺藜苜蓿LBD轉(zhuǎn)錄因子基因家族全基因組分析[J]. 賈喜濤,劉文獻(xiàn),謝文剛,劉志鵬,劉志敏,王彥榮. 西北植物學(xué)報(bào). 2014(11)
[9]番茄LBD基因家族的全基因組序列鑒定及其進(jìn)化和表達(dá)分析[J]. 王小非,劉鑫,蘇玲,孫永江,張世忠,郝玉金,由春香. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(12)
[10]漢麻—一種高值特種生物質(zhì)資源及應(yīng)用[J]. 張華,張建春,張杰. 高分子通報(bào). 2011(08)
博士論文
[1]巨桉、毛果楊、雷蒙德氏棉LBD基因家族的研究[D]. 蘆強(qiáng).中國林業(yè)科學(xué)研究院 2017
碩士論文
[1]不同工業(yè)大麻品種耐鎘性及原花青素緩解鎘脅迫功能分析[D]. 黃玉敏.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2019
本文編號(hào):3124722
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