谷子和青狗尾草bZIP基因家族鑒定與谷子SibZIP8基因的功能研究
發(fā)布時間：2021-04-05 14:50
干旱是影響糧食作物產量的主要逆境因素之一。谷子及其野生種青狗尾草抗旱耐瘠,是植物抗逆性研究的理想模型。bZIP轉錄因子在植物抵抗非生物脅迫方面發(fā)揮重要作用。bZIP轉錄因子在多種植物中已被鑒定,然而在谷子和青狗尾草中還未見相關報道。本研究利用生物信息學和分子生物學的方法,對谷子Setaria italica bZIP（SibZIP）和青狗尾草Setaria viridis bZIP（SvbZIP）的蛋白理化性質、染色體定位、同源性關系、基因結構、保守域等進行全面的分析,并利用轉錄組測序的數(shù)據對谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP基因的表達譜進行了分析,為后續(xù)功能研究提供信息。主要研究結果如下:（1）利用HMMER在全基因組水平共鑒定了90個谷子SibZIP基因和89個青狗尾草SvbZIP基因,參考之前模式植物擬南芥的命名方法,根據基因在染色體的位置,分別命名為SibZIP1-SibZIP90和SvbZIP1-SvbZIP89。另外通過構建谷子、青狗尾草、擬南芥和水稻的342條bZIP氨基酸序列的系統(tǒng)進化樹,將谷子和青狗尾草bZIP基因各分成10個亞族,分別是A、B、C、D、E、F、G...
【文章來源】：山西農業(yè)大學山西省
【文章頁數(shù)】：59 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
谷子和青狗尾草bZIP基因家族染色體定位比較分析
-19-圖2-2谷子SibZIP，青狗尾草SvbZIP，擬南芥AtbZIP和水稻OsbZIP系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2-2PhylogenetictreeofMilletSibZIP,GreenfoxtailSvbZIP,ArabidopsisAtbZIPandriceOsbZIP圖2-3谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2-3PhylogenetictreeofMilletSibZIPandGreenfoxtailSvbZIP
-19-圖2-2谷子SibZIP，青狗尾草SvbZIP，擬南芥AtbZIP和水稻OsbZIP系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2-2PhylogenetictreeofMilletSibZIP,GreenfoxtailSvbZIP,ArabidopsisAtbZIPandriceOsbZIP圖2-3谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2-3PhylogenetictreeofMilletSibZIPandGreenfoxtailSvbZIP
【參考文獻】：
期刊論文
[1]谷子抗旱性鑒定研究進展[J]. 崔紀菡,范佳興,李順國,趙宇,劉猛,宋世佳,任曉利,劉斐,南春梅,夏雪巖. 東北農業(yè)大學學報. 2017(01)
[2]不同品種谷子幼苗對干旱脅迫的生理響應及SiZFP252基因的表達分析[J]. 張耀元,張彬,馬芳芳,丁美嬌,胡韜光,李萍,韓淵懷. 山西農業(yè)大學學報(自然科學版). 2016(09)
[3]谷子萌芽期對干旱脅迫的響應及抗旱性評價[J]. 代小冬,楊育峰,朱燦燦,魯曉民,王春義,楊曉平,楊國紅,李君霞. 華北農學報. 2015(04)
[4]不同品種谷子種子萌發(fā)期對干旱脅迫的生理響應及其抗旱性評價[J]. 裴帥帥,尹美強,溫銀元,黃明鏡,張彬,郭平毅,王玉國,原向陽. 核農學報. 2014(10)
[5]谷子抗旱研究進展[J]. 張雁明,劉曉東,馬建萍,溫琪汾,韓淵懷. 山西農業(yè)科學. 2013(03)
[6]不同生態(tài)區(qū)主要育成谷子品種芽期耐旱性鑒定[J]. 秦嶺,楊延兵,管延安,張華文,王海蓮,劉賓,陳二影. 植物遺傳資源學報. 2013(01)
[7]谷子孕穗期一些生理性狀與品種抗旱性的關系[J]. 張文英,智慧,柳斌輝,李偉,王永芳,李海權,賈冠清,栗雨勤,刁現(xiàn)民. 華北農學報. 2011(03)
[8]干旱脅迫對谷子孕穗期光合特性的影響[J]. 張文英,智慧,柳斌輝,李明哲,李偉,謝俊雪,宋慶榮,刁現(xiàn)民. 河北農業(yè)科學. 2011(06)
[9]植物bZIP轉錄因子的生物學功能[J]. 張計育,渠慎春,郭忠仁,杜小麗,都貝貝,章鎮(zhèn). 西北植物學報. 2011(05)
[10]Genome-wide Expansion and Expression Divergence of the Basic Leucine Zipper Transcription Factors in Higher Plants with an Emphasis on Sorghum[J]. Jeevanandam Vanitha,Srinivasan Ramachandran. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(03)
碩士論文
[1]二氧化硫在谷子和擬南芥干旱脅迫過程中的生理作用[D]. 劉佳.山西大學 2015
[2]不同谷子品種抗旱性比較及干旱相關基因表達分析[D]. 張雁明.山西農業(yè)大學 2014
[3]谷子耐旱資源篩選及其遺傳多樣性分析[D]. 朱學海.中國農業(yè)科學院 2008
本文編號：3119836
【文章來源】：山西農業(yè)大學山西省
【文章頁數(shù)】：59 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
谷子和青狗尾草bZIP基因家族染色體定位比較分析
-19-圖2-2谷子SibZIP，青狗尾草SvbZIP，擬南芥AtbZIP和水稻OsbZIP系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2-2PhylogenetictreeofMilletSibZIP,GreenfoxtailSvbZIP,ArabidopsisAtbZIPandriceOsbZIP圖2-3谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2-3PhylogenetictreeofMilletSibZIPandGreenfoxtailSvbZIP
-19-圖2-2谷子SibZIP，青狗尾草SvbZIP，擬南芥AtbZIP和水稻OsbZIP系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2-2PhylogenetictreeofMilletSibZIP,GreenfoxtailSvbZIP,ArabidopsisAtbZIPandriceOsbZIP圖2-3谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2-3PhylogenetictreeofMilletSibZIPandGreenfoxtailSvbZIP
【參考文獻】：
期刊論文
[1]谷子抗旱性鑒定研究進展[J]. 崔紀菡,范佳興,李順國,趙宇,劉猛,宋世佳,任曉利,劉斐,南春梅,夏雪巖. 東北農業(yè)大學學報. 2017(01)
[2]不同品種谷子幼苗對干旱脅迫的生理響應及SiZFP252基因的表達分析[J]. 張耀元,張彬,馬芳芳,丁美嬌,胡韜光,李萍,韓淵懷. 山西農業(yè)大學學報(自然科學版). 2016(09)
[3]谷子萌芽期對干旱脅迫的響應及抗旱性評價[J]. 代小冬,楊育峰,朱燦燦,魯曉民,王春義,楊曉平,楊國紅,李君霞. 華北農學報. 2015(04)
[4]不同品種谷子種子萌發(fā)期對干旱脅迫的生理響應及其抗旱性評價[J]. 裴帥帥,尹美強,溫銀元,黃明鏡,張彬,郭平毅,王玉國,原向陽. 核農學報. 2014(10)
[5]谷子抗旱研究進展[J]. 張雁明,劉曉東,馬建萍,溫琪汾,韓淵懷. 山西農業(yè)科學. 2013(03)
[6]不同生態(tài)區(qū)主要育成谷子品種芽期耐旱性鑒定[J]. 秦嶺,楊延兵,管延安,張華文,王海蓮,劉賓,陳二影. 植物遺傳資源學報. 2013(01)
[7]谷子孕穗期一些生理性狀與品種抗旱性的關系[J]. 張文英,智慧,柳斌輝,李偉,王永芳,李海權,賈冠清,栗雨勤,刁現(xiàn)民. 華北農學報. 2011(03)
[8]干旱脅迫對谷子孕穗期光合特性的影響[J]. 張文英,智慧,柳斌輝,李明哲,李偉,謝俊雪,宋慶榮,刁現(xiàn)民. 河北農業(yè)科學. 2011(06)
[9]植物bZIP轉錄因子的生物學功能[J]. 張計育,渠慎春,郭忠仁,杜小麗,都貝貝,章鎮(zhèn). 西北植物學報. 2011(05)
[10]Genome-wide Expansion and Expression Divergence of the Basic Leucine Zipper Transcription Factors in Higher Plants with an Emphasis on Sorghum[J]. Jeevanandam Vanitha,Srinivasan Ramachandran. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(03)
碩士論文
[1]二氧化硫在谷子和擬南芥干旱脅迫過程中的生理作用[D]. 劉佳.山西大學 2015
[2]不同谷子品種抗旱性比較及干旱相關基因表達分析[D]. 張雁明.山西農業(yè)大學 2014
[3]谷子耐旱資源篩選及其遺傳多樣性分析[D]. 朱學海.中國農業(yè)科學院 2008
本文編號：3119836
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