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谷子和青狗尾草bZIP基因家族鑒定與谷子SibZIP8基因的功能研究

發(fā)布時(shí)間:2021-04-05 14:50
  干旱是影響糧食作物產(chǎn)量的主要逆境因素之一。谷子及其野生種青狗尾草抗旱耐瘠,是植物抗逆性研究的理想模型。bZIP轉(zhuǎn)錄因子在植物抵抗非生物脅迫方面發(fā)揮重要作用。bZIP轉(zhuǎn)錄因子在多種植物中已被鑒定,然而在谷子和青狗尾草中還未見相關(guān)報(bào)道。本研究利用生物信息學(xué)和分子生物學(xué)的方法,對谷子Setaria italica bZIP(SibZIP)和青狗尾草Setaria viridis bZIP(SvbZIP)的蛋白理化性質(zhì)、染色體定位、同源性關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)、保守域等進(jìn)行全面的分析,并利用轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)對谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP基因的表達(dá)譜進(jìn)行了分析,為后續(xù)功能研究提供信息。主要研究結(jié)果如下:(1)利用HMMER在全基因組水平共鑒定了90個(gè)谷子SibZIP基因和89個(gè)青狗尾草SvbZIP基因,參考之前模式植物擬南芥的命名方法,根據(jù)基因在染色體的位置,分別命名為SibZIP1-SibZIP90和SvbZIP1-SvbZIP89。另外通過構(gòu)建谷子、青狗尾草、擬南芥和水稻的342條bZIP氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹,將谷子和青狗尾草bZIP基因各分成10個(gè)亞族,分別是A、B、C、D、E、F、G... 

【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省

【文章頁數(shù)】:59 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

谷子和青狗尾草bZIP基因家族鑒定與谷子SibZIP8基因的功能研究


谷子和青狗尾草bZIP基因家族染色體定位比較分析

谷子,狗尾草,擬南芥,水稻


-19-圖2-2谷子SibZIP,青狗尾草SvbZIP,擬南芥AtbZIP和水稻OsbZIP系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2-2PhylogenetictreeofMilletSibZIP,GreenfoxtailSvbZIP,ArabidopsisAtbZIPandriceOsbZIP圖2-3谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2-3PhylogenetictreeofMilletSibZIPandGreenfoxtailSvbZIP

谷子,狗尾草,擬南芥


-19-圖2-2谷子SibZIP,青狗尾草SvbZIP,擬南芥AtbZIP和水稻OsbZIP系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2-2PhylogenetictreeofMilletSibZIP,GreenfoxtailSvbZIP,ArabidopsisAtbZIPandriceOsbZIP圖2-3谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2-3PhylogenetictreeofMilletSibZIPandGreenfoxtailSvbZIP

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]谷子抗旱性鑒定研究進(jìn)展[J]. 崔紀(jì)菡,范佳興,李順國,趙宇,劉猛,宋世佳,任曉利,劉斐,南春梅,夏雪巖.  東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(01)
[2]不同品種谷子幼苗對干旱脅迫的生理響應(yīng)及SiZFP252基因的表達(dá)分析[J]. 張耀元,張彬,馬芳芳,丁美嬌,胡韜光,李萍,韓淵懷.  山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(09)
[3]谷子萌芽期對干旱脅迫的響應(yīng)及抗旱性評價(jià)[J]. 代小冬,楊育峰,朱燦燦,魯曉民,王春義,楊曉平,楊國紅,李君霞.  華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2015(04)
[4]不同品種谷子種子萌發(fā)期對干旱脅迫的生理響應(yīng)及其抗旱性評價(jià)[J]. 裴帥帥,尹美強(qiáng),溫銀元,黃明鏡,張彬,郭平毅,王玉國,原向陽.  核農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(10)
[5]谷子抗旱研究進(jìn)展[J]. 張雁明,劉曉東,馬建萍,溫琪汾,韓淵懷.  山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(03)
[6]不同生態(tài)區(qū)主要育成谷子品種芽期耐旱性鑒定[J]. 秦嶺,楊延兵,管延安,張華文,王海蓮,劉賓,陳二影.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2013(01)
[7]谷子孕穗期一些生理性狀與品種抗旱性的關(guān)系[J]. 張文英,智慧,柳斌輝,李偉,王永芳,李海權(quán),賈冠清,栗雨勤,刁現(xiàn)民.  華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2011(03)
[8]干旱脅迫對谷子孕穗期光合特性的影響[J]. 張文英,智慧,柳斌輝,李明哲,李偉,謝俊雪,宋慶榮,刁現(xiàn)民.  河北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(06)
[9]植物bZIP轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能[J]. 張計(jì)育,渠慎春,郭忠仁,杜小麗,都貝貝,章鎮(zhèn).  西北植物學(xué)報(bào). 2011(05)
[10]Genome-wide Expansion and Expression Divergence of the Basic Leucine Zipper Transcription Factors in Higher Plants with an Emphasis on Sorghum[J]. Jeevanandam Vanitha,Srinivasan Ramachandran.  Journal of Integrative Plant Biology. 2011(03)

碩士論文
[1]二氧化硫在谷子和擬南芥干旱脅迫過程中的生理作用[D]. 劉佳.山西大學(xué) 2015
[2]不同谷子品種抗旱性比較及干旱相關(guān)基因表達(dá)分析[D]. 張雁明.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]谷子耐旱資源篩選及其遺傳多樣性分析[D]. 朱學(xué)海.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008



本文編號:3119836

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