本研究采用生物信息學(xué)方法,對(duì)草魚HSP70基因編碼蛋白質(zhì)的理化特性和結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析和預(yù)測(cè)。結(jié)果表明,草魚HSP70基因編碼573個(gè)氨基酸,組成的蛋白質(zhì)為不穩(wěn)定的水溶性蛋白。二級(jí)結(jié)構(gòu)為混合型,三級(jí)結(jié)構(gòu)是由α-螺旋、β-折疊、β-轉(zhuǎn)角和無(wú)規(guī)則卷曲構(gòu)成。 

【文章來(lái)源】：現(xiàn)代畜牧獸醫(yī). 2020,(06)

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草魚HSP70基因編碼蛋白質(zhì)的疏水性預(yù)測(cè)

蛋白質(zhì)主鏈的折疊產(chǎn)生氫鍵維系的有規(guī)則的構(gòu)象，把它稱之為二級(jí)結(jié)構(gòu)。草魚HSP70基因編碼蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果如圖2所示。由圖2可知，二級(jí)結(jié)構(gòu)元件中，α-螺旋（Hh）所占比例較高，為45.82%；β-折疊（Ee）占14.81%,無(wú)規(guī)則卷曲（Cc）占39.37%。其中Hh所占比大于45%,Ee所占比小于20%。因此，可推測(cè)出草魚HSP70基因編碼蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)為混合型。其三級(jí)結(jié)構(gòu)見圖3，表明該蛋白質(zhì)有較多的β-折疊。3 討論

大量研究表明，HSP70還可防止松弛的前體蛋白聚集，促進(jìn)細(xì)胞增殖，參與細(xì)胞骨架的構(gòu)成與修復(fù)，并在酶活性的調(diào)節(jié)中發(fā)揮重要作用[4]。HSP70在炎癥發(fā)生中起著重要的負(fù)性調(diào)節(jié)作用，例如細(xì)胞內(nèi)HSP70能降低細(xì)胞外主要的致炎物L(fēng)PS刺激所致的促炎細(xì)胞因子和炎性介質(zhì)的合成與釋放[5]。目前，國(guó)內(nèi)外對(duì)于人、豬、牛和鼠等動(dòng)物HSP70基因的研究已有報(bào)道[6-9]。但對(duì)HSP70基因編碼蛋白質(zhì)的生物信息學(xué)研究?jī)H限于豬[10]。本研究分析預(yù)測(cè)了草魚HSP70基因編碼蛋白質(zhì)的理化特性、疏水性、二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)。從預(yù)測(cè)結(jié)果看，HSP70基因編碼產(chǎn)物是由573個(gè)氨基酸折疊而成的不穩(wěn)定疏水可溶蛋白質(zhì)，草魚HSP70蛋白質(zhì)理論等電點(diǎn)為5.78，可得出草魚HSP70蛋白為酸性蛋白。HSP70基因編碼蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)由α-螺旋、β-折疊和無(wú)規(guī)則卷曲組成。而蛋白質(zhì)的α-螺旋和β-折疊的化學(xué)鍵能較高，能較牢固地維持蛋白質(zhì)的高級(jí)結(jié)構(gòu)，因此，二級(jí)結(jié)構(gòu)對(duì)抗原表位有很大影響，通常作為蛋白功能分析的重要指標(biāo)[11]。研究HSP70的作用機(jī)理，對(duì)于動(dòng)物的生產(chǎn)、生活有著非常深遠(yuǎn)的現(xiàn)實(shí)意義[12]。環(huán)境溫度過(guò)高時(shí)，動(dòng)物機(jī)體為保護(hù)自身的細(xì)胞不受損傷會(huì)產(chǎn)生大量的HSP70，而且在一定范圍內(nèi)，隨應(yīng)激時(shí)間的延長(zhǎng)，HSP70的表達(dá)量會(huì)顯著升高[13]。高溫抑制細(xì)胞活力,引起氧化損傷,并增加HSPs表達(dá),而HSPs在草魚肝細(xì)胞的熱應(yīng)激中有重要作用[14]。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)研究進(jìn)展[J]. 唐媛,李春花,張瑗,尚進(jìn),鄒凌云,李立奇.  現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2013(26)
[2]熱應(yīng)激蛋白70(HSP70)研究進(jìn)展[J]. 龔遠(yuǎn)英,鮑恩東.  畜牧與獸醫(yī). 2002(08)
[3]熱暴露對(duì)果蠅壽命及熱應(yīng)激蛋白（Hsp70）含量的影響[J]. 郭俊生,趙法,王楓,陳洪章.  解放軍預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 1998(04)

博士論文
[1]幾種重要外源因子對(duì)草魚肝細(xì)胞活力、抗氧化、凋亡和熱應(yīng)激蛋白表達(dá)的影響[D]. 崔彥婷.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014



本文編號(hào)：3112167