【目的】分析羅氏沼蝦（Macrobrachium rosenbergii）胰蛋白酶（TRY）基因的生物信息學(xué)及其mRNA的表達(dá)情況,為深入探究TRY基因的生物學(xué)功能和提高羅氏沼蝦產(chǎn)量提供參考依據(jù)�！痉椒ā坷肕egAlign、ProtParam、ProtScale和MLRC等在線軟件對(duì)羅氏沼蝦TRY基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)其在羅氏沼蝦腹部神經(jīng)、胃、心臟、鰓、性腺、肝胰腺、肌肉和腸道等8個(gè)組織中的表達(dá)情況,進(jìn)一步分析TRY基因在羅氏沼蝦生長(zhǎng)快速家系（FG）和生長(zhǎng)慢速家系（SG）個(gè)體肌肉組織中的表達(dá)規(guī)律。【結(jié)果】羅氏沼蝦TRY氨基酸序列與刀額新對(duì)蝦（Metapenaeus ensis）TRY氨基酸序列的同源性最高,與凡納濱對(duì)蝦（Litopenaeus vannamei）TRY氨基酸序列的同源性最低。羅氏沼蝦TRY蛋白的分子量為28.54 kD,理論等電點(diǎn)為4.44,屬于疏水性蛋白。羅氏沼蝦TRY蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)中α-螺旋占17.67%,延伸鏈占21.05%,無規(guī)則卷曲占61.28%。羅氏沼蝦TRY基因在所檢組織中均有表達(dá),在雌性和雄性個(gè)體的肝胰腺組織中均高表達(dá),而在雌... 

【文章來源】：西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,33(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

羅氏沼蝦TRY氨基酸序列與其他水產(chǎn)動(dòng)物TRY氨基酸序列的同源比對(duì)分析結(jié)果

基于TRY蛋白氨基酸序列相似性構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹

根據(jù)NCBI已公布的EST序列可知,羅氏沼蝦TRY基因編碼266個(gè)氨基酸。同源性比較結(jié)果(圖1)顯示,羅氏沼蝦TRY氨基酸序列與刀額新對(duì)蝦(Metapenaeus ensis)TRY氨基酸序列的同源性最高,與三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)TRY氨基酸序列的同源性最低。利用Lasergene v8.0構(gòu)建羅氏沼蝦(AMQ98968.1)、凡納濱對(duì)蝦(AEZ68613.1)、中國對(duì)蝦(ACQ45454.1)、脊尾白蝦(ABQ02534.1)、眼斑龍蝦(ADB66713.1)、中華絨螯蟹(AKN46052.1)、三疣梭子蟹(AHJ81099.1)、刀額新對(duì)蝦(ABQ02531.1)和擬穴青蟹(AGO02163.1)的氨基酸序列系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,結(jié)果(圖2)顯示,羅氏沼蝦和刀額新對(duì)蝦的遺傳距離最近,與凡納濱對(duì)蝦的遺傳距離最遠(yuǎn),說明羅氏沼蝦與刀額新對(duì)蝦的親緣關(guān)系最近,與凡納濱對(duì)蝦的親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。2.1.2 TRY蛋白理化性質(zhì)和結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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