背景骨質(zhì)疏松是一種常見的慢性疾病,以骨量減少和骨強度下降為特征,導(dǎo)致骨脆性增加而易發(fā)生骨折。骨質(zhì)疏松是重要公共衛(wèi)生問題,尤其在中老人女性中更為突出。由于骨強度測量困難,臨床上仍使用骨密度作為骨質(zhì)疏松的診斷標(biāo)準(zhǔn)。骨密度的遺傳力為50%-85%,而目前發(fā)現(xiàn)的所有遺傳方面的發(fā)病機(jī)制,包括由全基因組學(xué)關(guān)聯(lián)研究（GWAS）發(fā)現(xiàn)的位點,僅能解釋不到6%的遺傳力。大量的研究發(fā)現(xiàn)這些丟失的遺傳力其他的遺傳學(xué)機(jī)制導(dǎo)致,其中包括基因與基因之間的相互作用。但是倆基因之間的二維作用解釋的遺傳力有限。通過基因與基因之間的關(guān)系,構(gòu)建網(wǎng)絡(luò),可以提高檢驗效能,為發(fā)現(xiàn)疾病剩下的遺傳力提供新思路。同時,結(jié)合基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)兩個組學(xué)的信息,可以彌補基因組學(xué)研究的不足,提供基因的功能學(xué)信息。此外,對發(fā)現(xiàn)的潛在功能基因進(jìn)行精細(xì)定位、找到致因位點,可以更好的理解基因與骨密度之間關(guān)聯(lián)的生物學(xué)機(jī)制,為骨質(zhì)疏松的治療提供基因靶點。目的（1）鑒定與女性骨密度有關(guān)的基因及模塊。（2）探討鑒定出的基因及模塊如何影響骨密度。（3）對潛在功能基因進(jìn)行精細(xì)定位,尋找致因位點。材料與方法使用了全球女性骨密度樣本量最大的GWAS數(shù)據(jù)和轉(zhuǎn)錄組水平樣本... 

【文章來源】：南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：148 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖I-1成功加載WGCNA的操作界面

?博士學(xué)位論文???的基因進(jìn)行基因注釋和功能富集分析，得到可能與骨密度有關(guān)的信號通路或者??基因本體集（ｇｅｎｅ?ｏｎｔｏｌｏｇｙ?ｔｅｒｍ，?ＧＯ?Ｔｅｒｍ）［６９］。我們使用的是ＤＡＶＩＤ中的功能??注釋圖表這一功能。我們使用富集分?jǐn)?shù)（Ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ?ｓｃｏｒｅ，?ＥＳ，為各注釋集Ｐ??值幾何平均數(shù)的－ｌｏｇ值）作為評價最后每個注釋集的指標(biāo)，ＥＳ２３．０被認(rèn)為是具??有統(tǒng)計學(xué)意義［４９］。最后，我們將模塊中基因的信息與功能富集分析中基因的信??息相結(jié)合，找到一些可能與骨密度有關(guān)的基因，并進(jìn)一步闡述這些基因可能與??骨密度相關(guān)的生物學(xué)基礎(chǔ)。??

第一部分整合分析基因組水平與轉(zhuǎn)錄組水平數(shù)據(jù)以鑒定與女性骨密度相關(guān)的潛在功能基???ｍ???并且挑選其中感興趣的個別基因繪圖，看其周邊的基因，推薦其可能是新發(fā)現(xiàn)??的與骨密度有關(guān)的基因。??１．７本研宄基本流程圖（如圖１－３所本）??Ｓｔ＆ｆｙ?１?Ａｎｎｏｔａｔｅ?ＧＷＡ?Ｐ－ｙ／ａｌｕ＆ｓ?ｕｓｉｎｇ?ＰｒｏｘｙＧＱｒｔＧＬ－ＩＤ?ａｎｄ?ｉｄｏｒｔｔｔｆｙ?ｔｔ＞ｏｓ＆?ｒｔｏｍｉｒｔａＵｙ?ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ??ａ?ｓｓｏｃｉ＆ｔｉｏｒｔｓ??


本文編號：3100597