鳥類TLRs基因的適應(yīng)性進(jìn)化研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-25 18:35
先天性免疫是抵御和殺傷外界病原微生物入侵機(jī)體的第一道防線,在免疫反應(yīng)前期對(duì)機(jī)體的保護(hù)上起到重要的作用。Toll樣受體(Toll-like receptors,TLRs)作為一種介導(dǎo)先天免疫的重要功能性蛋白質(zhì),通過模式識(shí)別受體(Pattern recognition receptors,PRRs)直接作用于病原體,參與并調(diào)控特異性免疫應(yīng)答,在先天性免疫和特異性免疫中起到橋梁作用。鳥類廣泛分布于各地,其生存環(huán)境和食性均有著明顯的差異,因而接觸到病原微生物的種類和結(jié)構(gòu)也有所不同。本研究基于TLRs基因探討以下3個(gè)問題:1)鳥類TLRs基因家族的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系如何?2)鳥類TLR1和TLR2多拷貝基因的進(jìn)化模式出現(xiàn)了怎樣的差異?3)外界因素如何驅(qū)動(dòng)鳥類TLRs基因的進(jìn)化?本研究通過對(duì)綠尾虹雉、紅腹角雉、紅腹錦雞、藍(lán)孔雀、環(huán)頸雉和普通鵪鶉TLRs基因的克隆,并結(jié)合網(wǎng)上已有數(shù)據(jù),獲得主要結(jié)果如下:1)獲得6個(gè)物種TLR家族基因完整編碼區(qū)序列,其長(zhǎng)度從1959 bp(TLR1B)到3180 bp(TLR7)之間不等;10個(gè)基因的核苷酸和氨基酸序列的同源性在雞形目中都比較保守,相似性均在90%以上;結(jié)合...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:141 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
TLRs信號(hào)通路圖,該圖引自[34]
7圖1.2脊椎動(dòng)物Toll樣基因系統(tǒng)發(fā)育[40]Fig1.2thephylogeneticofvertebrateToll-likereceptors[40]1.4鳥類Toll樣受體基因家族研究進(jìn)展鳥類和哺乳動(dòng)物分化時(shí)間大約在3億年前,雖然鳥類與哺乳動(dòng)物的免疫反應(yīng)大致相似,然而在淋巴組織、免疫細(xì)胞及抗體多樣性等方面都存在顯著差異。通過對(duì)紅原雞(GallusGallus)基因組序列的分析發(fā)現(xiàn),雖然所有主要的細(xì)胞因子、趨化因子及整合素等基因家族成員均在雞基因組中被發(fā)現(xiàn),但其家族成員的數(shù)量卻有所減少,特別是在多基因家族中[44],尤其在MHC家族成員中,其數(shù)量與人類相比小了近20倍,因而也被稱作最低必需MHC[44]。同時(shí)在雞中也檢測(cè)到TLRs基因、哺乳動(dòng)物銜接蛋白的同源基因、參與TLRs基因下游信號(hào)傳導(dǎo)的激酶以及效應(yīng)分子等。在鳥類中共發(fā)現(xiàn)有10種TLRs基因,分別為TLR1A、TLR1B、TLR2A、TLR2B、TLR3、TLR4、TLR5、
262.4結(jié)果2.4.1基因組DNA提取本實(shí)驗(yàn)采用傳統(tǒng)酚/氯仿抽提法,對(duì)6個(gè)雞形目鳥類基因組DNA進(jìn)行提取,并經(jīng)凝膠電泳和ND-2000超微量核酸蛋白測(cè)定儀對(duì)基因組DNA的質(zhì)量和濃度進(jìn)行了檢測(cè)。如圖2.1所示,除了綠尾虹雉條帶較弱以外,其余5個(gè)均清晰明亮,說明基因組DNA提取的整體質(zhì)量和濃度均較高,可以滿足后續(xù)實(shí)驗(yàn)的要求。圖2.1基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果。M:DNAmarker(DL2000),Lolh:綠尾虹雉,Trte:紅腹角雉,Chpi:紅腹錦雞,Coco:普通鵪鶉,Phco:環(huán)頸雉,Paus:藍(lán)孔雀Fig2.1TheagarosegelelectrophoresisresultsofgenomicDNA.M:DNAmarker(DL2000),Lolh:L.lhuysii,Trte:T.temminckii,Chpi:C.pictus,Coco:C.coturnix,Phco:P.colchicus,Paus:P.cristatus2.4.2部分PCR擴(kuò)增與測(cè)序結(jié)果通過設(shè)計(jì)特異性引物,以前面檢驗(yàn)合格的基因組DNA為模板,采用PCR擴(kuò)增技術(shù)對(duì)目的基因進(jìn)行體外擴(kuò)增。由于引物較多,因而PCR擴(kuò)增圖片也較多,由于篇幅有限,不能一一列出,因此選取部分?jǐn)U增和測(cè)序結(jié)果為代表(圖2.2)。2.4.3雞形目鳥類TLRs基因序列特征分析通過將擴(kuò)增的高質(zhì)量的PCR產(chǎn)物送往北京擎科梓熙生物技術(shù)(成都)有限公司和生物工程(成都)有限公司進(jìn)行雙向測(cè)序,從公司返回的測(cè)序峰圖顯示,測(cè)序峰圖單一、清晰沒有套峰、亂峰,說明測(cè)序結(jié)果可用。由于鳥類TLRs基因編碼區(qū)序列普
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Toll樣受體信號(hào)通路的負(fù)調(diào)控[J]. 孫冰,韓代書. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2009(12)
[2]現(xiàn)生鳥類的起源和早期演化[J]. 張玉光. 自然雜志. 2007(01)
[3]中國(guó)首次發(fā)現(xiàn)真正會(huì)飛的“恐龍”——中華神州鳥(新屬新種)[J]. 季強(qiáng),姬書安,尤海魯,張建平,袁崇喜,季鑫鑫,李景路,李印先. 地質(zhì)通報(bào). 2002(07)
[4]評(píng)《鳥類的起源與演化》[J]. 周忠和. 古脊椎動(dòng)物學(xué)報(bào). 1997(02)
[5]中國(guó)最早鳥類化石的發(fā)現(xiàn)及鳥類的起源[J]. 季強(qiáng),姬書安. 中國(guó)地質(zhì). 1996(10)
碩士論文
[1]偶蹄目TLR1-4基因的分子進(jìn)化研究[D]. 顧棚.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào):3100115
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:141 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
TLRs信號(hào)通路圖,該圖引自[34]
7圖1.2脊椎動(dòng)物Toll樣基因系統(tǒng)發(fā)育[40]Fig1.2thephylogeneticofvertebrateToll-likereceptors[40]1.4鳥類Toll樣受體基因家族研究進(jìn)展鳥類和哺乳動(dòng)物分化時(shí)間大約在3億年前,雖然鳥類與哺乳動(dòng)物的免疫反應(yīng)大致相似,然而在淋巴組織、免疫細(xì)胞及抗體多樣性等方面都存在顯著差異。通過對(duì)紅原雞(GallusGallus)基因組序列的分析發(fā)現(xiàn),雖然所有主要的細(xì)胞因子、趨化因子及整合素等基因家族成員均在雞基因組中被發(fā)現(xiàn),但其家族成員的數(shù)量卻有所減少,特別是在多基因家族中[44],尤其在MHC家族成員中,其數(shù)量與人類相比小了近20倍,因而也被稱作最低必需MHC[44]。同時(shí)在雞中也檢測(cè)到TLRs基因、哺乳動(dòng)物銜接蛋白的同源基因、參與TLRs基因下游信號(hào)傳導(dǎo)的激酶以及效應(yīng)分子等。在鳥類中共發(fā)現(xiàn)有10種TLRs基因,分別為TLR1A、TLR1B、TLR2A、TLR2B、TLR3、TLR4、TLR5、
262.4結(jié)果2.4.1基因組DNA提取本實(shí)驗(yàn)采用傳統(tǒng)酚/氯仿抽提法,對(duì)6個(gè)雞形目鳥類基因組DNA進(jìn)行提取,并經(jīng)凝膠電泳和ND-2000超微量核酸蛋白測(cè)定儀對(duì)基因組DNA的質(zhì)量和濃度進(jìn)行了檢測(cè)。如圖2.1所示,除了綠尾虹雉條帶較弱以外,其余5個(gè)均清晰明亮,說明基因組DNA提取的整體質(zhì)量和濃度均較高,可以滿足后續(xù)實(shí)驗(yàn)的要求。圖2.1基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果。M:DNAmarker(DL2000),Lolh:綠尾虹雉,Trte:紅腹角雉,Chpi:紅腹錦雞,Coco:普通鵪鶉,Phco:環(huán)頸雉,Paus:藍(lán)孔雀Fig2.1TheagarosegelelectrophoresisresultsofgenomicDNA.M:DNAmarker(DL2000),Lolh:L.lhuysii,Trte:T.temminckii,Chpi:C.pictus,Coco:C.coturnix,Phco:P.colchicus,Paus:P.cristatus2.4.2部分PCR擴(kuò)增與測(cè)序結(jié)果通過設(shè)計(jì)特異性引物,以前面檢驗(yàn)合格的基因組DNA為模板,采用PCR擴(kuò)增技術(shù)對(duì)目的基因進(jìn)行體外擴(kuò)增。由于引物較多,因而PCR擴(kuò)增圖片也較多,由于篇幅有限,不能一一列出,因此選取部分?jǐn)U增和測(cè)序結(jié)果為代表(圖2.2)。2.4.3雞形目鳥類TLRs基因序列特征分析通過將擴(kuò)增的高質(zhì)量的PCR產(chǎn)物送往北京擎科梓熙生物技術(shù)(成都)有限公司和生物工程(成都)有限公司進(jìn)行雙向測(cè)序,從公司返回的測(cè)序峰圖顯示,測(cè)序峰圖單一、清晰沒有套峰、亂峰,說明測(cè)序結(jié)果可用。由于鳥類TLRs基因編碼區(qū)序列普
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Toll樣受體信號(hào)通路的負(fù)調(diào)控[J]. 孫冰,韓代書. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2009(12)
[2]現(xiàn)生鳥類的起源和早期演化[J]. 張玉光. 自然雜志. 2007(01)
[3]中國(guó)首次發(fā)現(xiàn)真正會(huì)飛的“恐龍”——中華神州鳥(新屬新種)[J]. 季強(qiáng),姬書安,尤海魯,張建平,袁崇喜,季鑫鑫,李景路,李印先. 地質(zhì)通報(bào). 2002(07)
[4]評(píng)《鳥類的起源與演化》[J]. 周忠和. 古脊椎動(dòng)物學(xué)報(bào). 1997(02)
[5]中國(guó)最早鳥類化石的發(fā)現(xiàn)及鳥類的起源[J]. 季強(qiáng),姬書安. 中國(guó)地質(zhì). 1996(10)
碩士論文
[1]偶蹄目TLR1-4基因的分子進(jìn)化研究[D]. 顧棚.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào):3100115
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