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兩株副溶血弧菌基因組序列分析及其在不同鹽度下毒力相關(guān)基因表達(dá)差異和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2021-03-21 15:53
  副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是一種廣泛存在于海水、半咸水環(huán)境中的人畜共患菌,會(huì)引發(fā)人腹瀉嘔吐等胃腸疾病,也會(huì)導(dǎo)致魚蝦蟹貝等水生生物疾病。因凡納濱對蝦鹽度適應(yīng)性廣,抗病能力強(qiáng),目前我國淡水養(yǎng)殖凡納濱對蝦發(fā)展迅速,隨著養(yǎng)殖動(dòng)物引入,原海水病原隨宿主進(jìn)入淡水水域,引發(fā)了淡水養(yǎng)殖對蝦的新疾病。隨著環(huán)境鹽度的改變,海水病原菌通過提高細(xì)菌增殖能力以及對宿主的粘附能力來適應(yīng)低鹽環(huán)境并引發(fā)疾病。本文以兩株不同環(huán)境下分離的致病性副溶血弧菌為研究對象,對兩株副溶血弧菌進(jìn)行了全基因組測序,檢測了兩株副溶血弧菌的毒力因子和致病力,并在不同鹽度下對其生長速率和毒力基因的定量表達(dá)做了研究,結(jié)合不同鹽度下兩株副溶血弧菌的轉(zhuǎn)錄組學(xué)信息,探討了鹽度對副溶血弧菌轉(zhuǎn)錄和生長的影響,為探究環(huán)境因素與副溶血弧菌致病力的關(guān)系提供了科學(xué)依據(jù)。本文利用Illumina Hiseq測序平臺對本實(shí)驗(yàn)中的兩株副溶血弧菌進(jìn)行全基因組測序,結(jié)果顯示副溶血弧菌V9株基因組大小為5489686bp,GC含量45.23%,預(yù)測得到5202個(gè)基因,總長度為4645029bp,包括108個(gè)tRNA,1個(gè)rRNA。菌株38... 

【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】:99 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

兩株副溶血弧菌基因組序列分析及其在不同鹽度下毒力相關(guān)基因表達(dá)差異和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究


菌株V9CGView基因組圈圖

圈圖,菌株,基因組


17圖 2-2 菌株 383chr1CGView 基因組圈圖Figure 2-2 CG View genomic map of strain 383 chr1

圈圖,菌株,基因組


18圖 2-2 菌株 383chr2CGView 基因組圈圖Figure 2-2 CG View genomic map of strain 383 chr2

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]高鹽對凡納濱對蝦仔蝦生長、滲透調(diào)節(jié)及免疫相關(guān)酶活性的影響[J]. 趙玉超,王仁杰,沈敏,崔彥婷,王淑生,李玉全,付瑞江,張紹龍.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2019(04)
[2]副溶血弧菌菌株229基因組測序及其致病因子的注釋[J]. 林毅英,潘力,吳清平,王斌.  現(xiàn)代食品科技. 2018(05)
[3]鹽度對副溶血性弧菌生物特性的影響[J]. 沈津宇,倪瑩,高璐.  現(xiàn)代食品. 2018(06)
[4]2016年河北省唐山市淡水養(yǎng)殖環(huán)節(jié)中副溶血性弧菌監(jiān)測結(jié)果分析[J]. 秦磊,王建紅,高靜,李成林.  醫(yī)學(xué)動(dòng)物防制. 2018(04)
[5]T3SS1和T3SS2影響副溶血弧菌生物學(xué)特性及細(xì)胞致病性的比較[J]. 白雪瑞,王權(quán),凌嬌,萬瑩,陳永軍,方維煥,孫衛(wèi)東,蔣蔚.  微生物學(xué)報(bào). 2018(03)
[6]副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)中溶源噬菌體與其宿主菌致病力的相關(guān)性[J]. 王娜,王海亮,白楠,黃倢,謝達(dá)祥,謝起浪,於俊琦,萬夕和.  漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2016(02)
[7]溫度對副溶血弧菌T3SS中相關(guān)基因表達(dá)的影響[J]. 丁曉燕,曲凌云,王琛,田欣欣,孫承君,王敏強(qiáng).  海洋科學(xué)進(jìn)展. 2016(02)
[8]副溶血性弧菌食物中毒及腹瀉菌株Ⅲ型分泌系統(tǒng)的檢測及分析[J]. 邵占濤,李穎,王園園,朱美娟,王彥波.  中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2015(02)
[9]對蝦早期死亡綜合癥的研究進(jìn)展[J]. 徐含穎,張婉蓉,張學(xué)舒,馮雙雙,羅燕兒.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(06)
[10]鹽度和溫度對副溶血弧菌運(yùn)動(dòng)能力的影響[J]. 董新波,張義全,楊瑞馥,謝傳曉,周冬生.  軍事醫(yī)學(xué). 2014(12)

博士論文
[1]酸耐受副溶血性弧菌生物學(xué)特性及轉(zhuǎn)錄組、蛋白組分析[D]. 馬月姣.上海海洋大學(xué) 2016
[2]基于RNA-Seq技術(shù)的米曲霉RIB40轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 王斌.華南理工大學(xué) 2010
[3]遲緩愛德華氏菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)(T3SS)輸送器蛋白及分子伴侶的研究[D]. 王波.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2009

碩士論文
[1]霍亂弧菌T6SS針狀蛋白VgrG3及其免疫蛋白的結(jié)構(gòu)和功能研究[D]. 張九龍.中國科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2014



本文編號:3093136

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